Transcription Factors and their targets
Search Term:
TF
TargetGene
TargetGeneID
Home
Gene List
TF list
Protocol
Contact
TF
Target
Gene ID
Distance From TSS
AHR
Herc3
73998
-898.00
AICDA
Herc3
73998
-346.00
ANDR
Herc3
73998
55.00
AP2A
Herc3
73998
-397.00
AP2A
Herc3
73998
-332.00
AP2A
Herc3
73998
-325.00
AP2A
Herc3
73998
-244.00
AP2C
Herc3
73998
-148.00
AP2C
Herc3
73998
99.00
ARX
Herc3
73998
-470.00
ARX
Herc3
73998
-308.00
ASXL1
Herc3
73998
-664.00
ATF4
Herc3
73998
-284.00
ATOH1
Herc3
73998
-101.00
BATF
Herc3
73998
-391.00
BATF
Herc3
73998
-383.00
BATF
Herc3
73998
-374.00
BATF
Herc3
73998
-373.00
BATF
Herc3
73998
-360.00
BCL6
Herc3
73998
-917.00
BCL6
Herc3
73998
-151.00
BMI1
Herc3
73998
-106.00
BRAC
Herc3
73998
-308.00
BRCA1
Herc3
73998
144.00
CBX3
Herc3
73998
-310.00
CDK8
Herc3
73998
-517.00
CHD4
Herc3
73998
-907.00
CHD4
Herc3
73998
-655.00
CHD4
Herc3
73998
-458.00
CHD4
Herc3
73998
-347.00
CHD4
Herc3
73998
-201.00
CHD4
Herc3
73998
-116.00
COE1
Herc3
73998
-150.00
CRX
Herc3
73998
-174.00
CRX
Herc3
73998
-155.00
CTCF
Herc3
73998
-2.00
CTCF
Herc3
73998
44.00
CTCF
Herc3
73998
132.00
CXXC1
Herc3
73998
-298.00
E2F3
Herc3
73998
-698.00
E2F4
Herc3
73998
-922.00
E2F4
Herc3
73998
-454.00
E2F4
Herc3
73998
-187.00
E2F4
Herc3
73998
60.00
EGR2
Herc3
73998
-878.00
ELF1
Herc3
73998
125.00
EP300
Herc3
73998
-645.00
EP300
Herc3
73998
-637.00
EP300
Herc3
73998
-622.00
EP300
Herc3
73998
-556.00
EP300
Herc3
73998
-459.00
EP300
Herc3
73998
-443.00
EP300
Herc3
73998
-435.00
EP300
Herc3
73998
-385.00
EP300
Herc3
73998
-362.00
EP300
Herc3
73998
-350.00
EP300
Herc3
73998
-345.00
EP300
Herc3
73998
-321.00
EP300
Herc3
73998
-316.00
EP300
Herc3
73998
-277.00
EP300
Herc3
73998
-270.00
EP300
Herc3
73998
-266.00
EP300
Herc3
73998
-186.00
EP300
Herc3
73998
-164.00
EP300
Herc3
73998
-155.00
EP300
Herc3
73998
-150.00
EP300
Herc3
73998
-135.00
EP300
Herc3
73998
-118.00
EP300
Herc3
73998
-65.00
EP400
Herc3
73998
-999.00
ERR2
Herc3
73998
-221.00
ESR1
Herc3
73998
-270.00
ESR1
Herc3
73998
52.00
EZH1
Herc3
73998
-470.00
EZH2
Herc3
73998
-577.00
EZH2
Herc3
73998
-470.00
EZH2
Herc3
73998
-125.00
FOSL2
Herc3
73998
13.00
FOXA1
Herc3
73998
-64.00
FOXA1
Herc3
73998
64.00
FOXA2
Herc3
73998
-45.00
FOXA2
Herc3
73998
-26.00
GATA3
Herc3
73998
-434.00
HNF4A
Herc3
73998
-134.00
IKZF1
Herc3
73998
-731.00
IKZF1
Herc3
73998
-158.00
IKZF1
Herc3
73998
-150.00
IKZF1
Herc3
73998
20.00
IKZF1
Herc3
73998
56.00
IKZF1
Herc3
73998
161.00
IRF3
Herc3
73998
-52.00
IRF4
Herc3
73998
-954.00
IRF4
Herc3
73998
-948.00
IRF4
Herc3
73998
-945.00
IRF4
Herc3
73998
-852.00
IRF4
Herc3
73998
-686.00
IRF4
Herc3
73998
-569.00
IRF4
Herc3
73998
-399.00
IRF4
Herc3
73998
-376.00
IRF4
Herc3
73998
-370.00
IRF4
Herc3
73998
-367.00
IRF4
Herc3
73998
-361.00
IRF4
Herc3
73998
-359.00
IRF4
Herc3
73998
-327.00
IRF4
Herc3
73998
-265.00
IRF4
Herc3
73998
-204.00
IRF4
Herc3
73998
-203.00
IRF4
Herc3
73998
-160.00
IRF4
Herc3
73998
-80.00
IRF4
Herc3
73998
-62.00
JUN
Herc3
73998
-389.00
JUND
Herc3
73998
-122.00
KDM2A
Herc3
73998
-381.00
KDM2B
Herc3
73998
-742.00
KDM2B
Herc3
73998
-475.00
KDM2B
Herc3
73998
-383.00
KDM2B
Herc3
73998
-122.00
KDM4B
Herc3
73998
-774.00
KDM4C
Herc3
73998
-377.00
KDM6B
Herc3
73998
-369.00
KLF1
Herc3
73998
-321.00
KLF1
Herc3
73998
-78.00
KLF4
Herc3
73998
-146.00
KMT2B
Herc3
73998
-961.00
KMT2C
Herc3
73998
-322.00
KMT2C
Herc3
73998
-190.00
KMT2D
Herc3
73998
-424.00
KMT2D
Herc3
73998
-416.00
KMT2D
Herc3
73998
-352.00
KMT2D
Herc3
73998
-177.00
LDB1
Herc3
73998
73.00
MAF
Herc3
73998
-346.00
MED1
Herc3
73998
-353.00
MED1
Herc3
73998
-139.00
MEIS1
Herc3
73998
-632.00
MEIS1
Herc3
73998
-430.00
MYOD1
Herc3
73998
-281.00
MYOD1
Herc3
73998
-196.00
MYOD1
Herc3
73998
-165.00
MYOD1
Herc3
73998
-135.00
MYOD1
Herc3
73998
-115.00
MYOD1
Herc3
73998
-110.00
MYOD1
Herc3
73998
-30.00
MYOD1
Herc3
73998
2.00
MYOG
Herc3
73998
-332.00
MYOG
Herc3
73998
-251.00
MYOG
Herc3
73998
-168.00
NANOG
Herc3
73998
-749.00
NANOG
Herc3
73998
-556.00
NANOG
Herc3
73998
-494.00
NANOG
Herc3
73998
-206.00
NBN
Herc3
73998
-290.00
NCOA2
Herc3
73998
-259.00
NDF2
Herc3
73998
-318.00
NDF2
Herc3
73998
-304.00
NELFA
Herc3
73998
-286.00
NIPBL
Herc3
73998
-643.00
NKX61
Herc3
73998
-448.00
NR1D2
Herc3
73998
-320.00
NUCKS
Herc3
73998
-347.00
NUCKS
Herc3
73998
-108.00
PAX5
Herc3
73998
-871.00
PKNX2
Herc3
73998
-469.00
PO5F1
Herc3
73998
-954.00
PO5F1
Herc3
73998
-848.00
PO5F1
Herc3
73998
-820.00
PO5F1
Herc3
73998
-702.00
PO5F1
Herc3
73998
-693.00
PO5F1
Herc3
73998
-625.00
PO5F1
Herc3
73998
-623.00
PO5F1
Herc3
73998
-602.00
PO5F1
Herc3
73998
-576.00
PO5F1
Herc3
73998
-317.00
PO5F1
Herc3
73998
-277.00
PO5F1
Herc3
73998
-253.00
PPARG
Herc3
73998
-423.00
PPARG
Herc3
73998
-368.00
PPARG
Herc3
73998
-164.00
PPARG
Herc3
73998
12.00
PPARG
Herc3
73998
19.00
PPARG
Herc3
73998
169.00
PRGR
Herc3
73998
-365.00
PTF1A
Herc3
73998
-27.00
RAD21
Herc3
73998
-199.00
RARA
Herc3
73998
-685.00
RARA
Herc3
73998
-525.00
RARA
Herc3
73998
-433.00
RARB
Herc3
73998
-595.00
RBBP5
Herc3
73998
-287.00
RBBP5
Herc3
73998
-153.00
RELB
Herc3
73998
65.00
RFA2
Herc3
73998
-856.00
RFX1
Herc3
73998
-476.00
RING1
Herc3
73998
-740.00
RING2
Herc3
73998
-922.00
RING2
Herc3
73998
-740.00
RING2
Herc3
73998
-580.00
RING2
Herc3
73998
-397.00
RING2
Herc3
73998
-90.00
RING2
Herc3
73998
127.00
RPB1
Herc3
73998
-793.00
RPB1
Herc3
73998
-761.00
RPB1
Herc3
73998
-398.00
RUNX3
Herc3
73998
-606.00
RXRA
Herc3
73998
-661.00
RXRA
Herc3
73998
-623.00
RXRA
Herc3
73998
-419.00
RXRA
Herc3
73998
-298.00
RYBP
Herc3
73998
-922.00
RYBP
Herc3
73998
-308.00
RUNX1
Herc3
73998
-239
RUNX2
Herc3
73998
-774
RUNX2
Herc3
73998
-445
RUNX2
Herc3
73998
-434
RUNX3
Herc3
73998
-606
RUNX3
Herc3
73998
-384
RUNX3
Herc3
73998
-300
RUNX3
Herc3
73998
-160
RXRA
Herc3
73998
-661
RXRA
Herc3
73998
-623
RXRA
Herc3
73998
-419
RXRA
Herc3
73998
-298
RYBP
Herc3
73998
-922
RYBP
Herc3
73998
-308
SALL4
Herc3
73998
-740
SIN3A
Herc3
73998
-943
SIN3A
Herc3
73998
-470
SIN3A
Herc3
73998
-369
SIN3A
Herc3
73998
-358
SIN3A
Herc3
73998
-240
SIN3B
Herc3
73998
-922
SIR1
Herc3
73998
-436
SIR6
Herc3
73998
-335
SMAD3
Herc3
73998
-195
SMC1A
Herc3
73998
-433
SMC3
Herc3
73998
-321
SMC5
Herc3
73998
-256
SMC5
Herc3
73998
144
SMCA4
Herc3
73998
-636
SMCA4
Herc3
73998
-626
SMCA4
Herc3
73998
-618
SMCA4
Herc3
73998
-349
SMCA4
Herc3
73998
-307
SMCA4
Herc3
73998
-68
SMCA4
Herc3
73998
9
SMCA4
Herc3
73998
67
SMCA5
Herc3
73998
-63
SOX2
Herc3
73998
-512
SOX4
Herc3
73998
-611
SPI1
Herc3
73998
-978
SPI1
Herc3
73998
-966
SPI1
Herc3
73998
-940
SPI1
Herc3
73998
-927
SPI1
Herc3
73998
-925
SPI1
Herc3
73998
-920
SPI1
Herc3
73998
-829
SPI1
Herc3
73998
-766
SPI1
Herc3
73998
-754
SPI1
Herc3
73998
-720
SPI1
Herc3
73998
-612
SPI1
Herc3
73998
-601
SPI1
Herc3
73998
-561
SPI1
Herc3
73998
-554
SPI1
Herc3
73998
-454
SPI1
Herc3
73998
-450
SPI1
Herc3
73998
-445
SPI1
Herc3
73998
-439
SPI1
Herc3
73998
-436
SPI1
Herc3
73998
-433
SPI1
Herc3
73998
-431
SPI1
Herc3
73998
-425
SPI1
Herc3
73998
-421
SPI1
Herc3
73998
-419
SPI1
Herc3
73998
-416
SPI1
Herc3
73998
-407
SPI1
Herc3
73998
-405
SPI1
Herc3
73998
-404
SPI1
Herc3
73998
-397
SPI1
Herc3
73998
-156
SPI1
Herc3
73998
95
SPI1
Herc3
73998
122
SPI1
Herc3
73998
140
SPI1
Herc3
73998
177
SPT5H
Herc3
73998
-465
SPT5H
Herc3
73998
-394
SPT5H
Herc3
73998
-381
SPT5H
Herc3
73998
-374
SPT5H
Herc3
73998
-286
SPT5H
Herc3
73998
-143
SRF
Herc3
73998
-376
SRF
Herc3
73998
-113
STA5A
Herc3
73998
-353
STA5A
Herc3
73998
-301
STA5B
Herc3
73998
-389
STA5B
Herc3
73998
-301
STAT3
Herc3
73998
-351
STAT4
Herc3
73998
99
SUZ12
Herc3
73998
-925
SUZ12
Herc3
73998
-741
SUZ12
Herc3
73998
-550
SUZ12
Herc3
73998
-534
SUZ12
Herc3
73998
-506
SUZ12
Herc3
73998
-379
SUZ12
Herc3
73998
-341
SUZ12
Herc3
73998
-268
SUZ12
Herc3
73998
-261
SUZ12
Herc3
73998
-250
SUZ12
Herc3
73998
-234
SUZ12
Herc3
73998
-219
SUZ12
Herc3
73998
-196
SUZ12
Herc3
73998
-109
SUZ12
Herc3
73998
-96
SUZ12
Herc3
73998
70
T2EB
Herc3
73998
-331
TAF3
Herc3
73998
-535
TAF3
Herc3
73998
-369
TAF3
Herc3
73998
-322
TAF7L
Herc3
73998
-186
TAF9B
Herc3
73998
-51
TBP
Herc3
73998
-424
TBX21
Herc3
73998
-64
TBX3
Herc3
73998
-581
TBX3
Herc3
73998
-206
TBX3
Herc3
73998
19
TBX5
Herc3
73998
-597
TCF7
Herc3
73998
88
TDG
Herc3
73998
-965
TET1
Herc3
73998
-252
TET1
Herc3
73998
-187
TET1
Herc3
73998
-185
TF2B
Herc3
73998
-418
TF2B
Herc3
73998
-389
TF2B
Herc3
73998
-365
TF65
Herc3
73998
-582
TF65
Herc3
73998
-564
TF65
Herc3
73998
-529
TF65
Herc3
73998
-528
TF65
Herc3
73998
-442
TF65
Herc3
73998
-372
TF65
Herc3
73998
-172
TF65
Herc3
73998
-160
TF65
Herc3
73998
-128
TF65
Herc3
73998
-121
TF65
Herc3
73998
-119
TF65
Herc3
73998
-110
TF65
Herc3
73998
-102
TF65
Herc3
73998
-98
TF65
Herc3
73998
-92
TF65
Herc3
73998
-85
TF65
Herc3
73998
109
TF7L2
Herc3
73998
-657
TFAP4
Herc3
73998
-686
TFE2
Herc3
73998
-53
THB
Herc3
73998
-1
TIF1B
Herc3
73998
-703
TIF1B
Herc3
73998
-458
TYY1
Herc3
73998
-363
UBF1
Herc3
73998
-321
UTF1
Herc3
73998
-993
UTF1
Herc3
73998
-376
UTF1
Herc3
73998
-115
WDR5
Herc3
73998
-436
WDR5
Herc3
73998
-383
WT1
Herc3
73998
-740
WT1
Herc3
73998
-571
WT1
Herc3
73998
-378
WT1
Herc3
73998
-342
ZBT17
Herc3
73998
-686
ZBT17
Herc3
73998
-569
ZBT17
Herc3
73998
-523
ZBT17
Herc3
73998
-216
ZBT17
Herc3
73998
-214
ZBT17
Herc3
73998
-213
SALL4
Herc3
73998
-740.00
SIN3A
Herc3
73998
-470.00
SIN3A
Herc3
73998
-358.00
SIN3B
Herc3
73998
-922.00
SIR1
Herc3
73998
-436.00
SMAD3
Herc3
73998
-195.00
SMC1A
Herc3
73998
-433.00
SMC3
Herc3
73998
-321.00
SMC5
Herc3
73998
-256.00
SMC5
Herc3
73998
144.00
SMCA4
Herc3
73998
-626.00
SMCA4
Herc3
73998
-307.00
SMCA5
Herc3
73998
-63.00
SOX2
Herc3
73998
-512.00
SPI1
Herc3
73998
-978.00
SPI1
Herc3
73998
-966.00
SPI1
Herc3
73998
-940.00
SPI1
Herc3
73998
-927.00
SPI1
Herc3
73998
-925.00
SPI1
Herc3
73998
-920.00
SPI1
Herc3
73998
-829.00
SPI1
Herc3
73998
-766.00
SPI1
Herc3
73998
-754.00
SPI1
Herc3
73998
-720.00
SPI1
Herc3
73998
-612.00
SPI1
Herc3
73998
-601.00
SPI1
Herc3
73998
-561.00
SPI1
Herc3
73998
-454.00
SPI1
Herc3
73998
-433.00
SPI1
Herc3
73998
-425.00
SPI1
Herc3
73998
-421.00
SPI1
Herc3
73998
-419.00
SPI1
Herc3
73998
-416.00
SPI1
Herc3
73998
-407.00
SPI1
Herc3
73998
-404.00
SPI1
Herc3
73998
-156.00
SPI1
Herc3
73998
95.00
SPI1
Herc3
73998
140.00
SPI1
Herc3
73998
177.00
SPT5H
Herc3
73998
-465.00
SPT5H
Herc3
73998
-394.00
SPT5H
Herc3
73998
-381.00
SPT5H
Herc3
73998
-374.00
SPT5H
Herc3
73998
-286.00
SPT5H
Herc3
73998
-143.00
SRF
Herc3
73998
-376.00
SRF
Herc3
73998
-113.00
STA5A
Herc3
73998
-353.00
STA5A
Herc3
73998
-301.00
STA5B
Herc3
73998
-389.00
STA5B
Herc3
73998
-301.00
STAT3
Herc3
73998
-351.00
STAT4
Herc3
73998
99.00
SUZ12
Herc3
73998
-234.00
SUZ12
Herc3
73998
-96.00
SUZ12
Herc3
73998
70.00
TAF3
Herc3
73998
-322.00
TAF7L
Herc3
73998
-186.00
TBP
Herc3
73998
-424.00
TBX3
Herc3
73998
-581.00
TBX3
Herc3
73998
-206.00
TBX5
Herc3
73998
-597.00
TCF7
Herc3
73998
88.00
TET1
Herc3
73998
-252.00
TET1
Herc3
73998
-187.00
TET1
Herc3
73998
-185.00
TF65
Herc3
73998
-582.00
TF65
Herc3
73998
-564.00
TF65
Herc3
73998
-529.00
TF65
Herc3
73998
-528.00
TF65
Herc3
73998
-442.00
TF65
Herc3
73998
-372.00
TF65
Herc3
73998
-172.00
TF65
Herc3
73998
-160.00
TF65
Herc3
73998
-128.00
TF65
Herc3
73998
-121.00
TF65
Herc3
73998
-102.00
TF65
Herc3
73998
-98.00
TF65
Herc3
73998
-92.00
TF65
Herc3
73998
-85.00
TF65
Herc3
73998
109.00
TYY1
Herc3
73998
-363.00
UTF1
Herc3
73998
-115.00
WDR5
Herc3
73998
-383.00
WT1
Herc3
73998
-740.00
Additional Information about the Gene
Expression1
Allen Brain Atlas
BGEM
EMAGE
GeneNote
genepaint
GNF Symatlas
GENSAT
Expression2
AceView
HGNC Expression
UCSC
GEO
ArrayExpress
Cleanex
Function
AMIGO
MIPS
Panther
Uniport
Genecards
InterPro
IHOP
Gene Regulation
MicroRNA target
TRED
Pathways
Biocarta Pathways CGAP SAGE
KEGG Pathways
EBI
Sequences
NCBI
Ensembl
MGI Information
QTL
Harvester
Howdy
Interactions
MIMI
EBI
Nature-NCI
string
IHOP
Tools Links
Sequence Manipulation
Genes and Transcripts
Micoroarray Analysis
Literature Search
Protein
Databases
Functional Analysis
Transcription Factor Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
Target Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9