Transcription Factors and their targets
Search Term:
TF
TargetGene
TargetGeneID
Home
Gene List
TF list
Protocol
Contact
TF
Target
Gene ID
Distance From TSS
AICDA
Opn3
13603
133.00
AP2A
Opn3
13603
-248.00
AP2A
Opn3
13603
-171.00
AP2A
Opn3
13603
-142.00
AP2A
Opn3
13603
22.00
AP2A
Opn3
13603
60.00
AP2A
Opn3
13603
159.00
AP2C
Opn3
13603
-127.00
ARX
Opn3
13603
33.00
ATOH1
Opn3
13603
-268.00
BATF
Opn3
13603
-282.00
BATF
Opn3
13603
-278.00
BATF
Opn3
13603
-255.00
BATF
Opn3
13603
-224.00
BATF
Opn3
13603
-194.00
BATF
Opn3
13603
-153.00
BATF
Opn3
13603
-152.00
BATF
Opn3
13603
-136.00
BATF
Opn3
13603
-88.00
BATF
Opn3
13603
-65.00
BATF
Opn3
13603
90.00
BMAL1
Opn3
13603
-161.00
BMAL1
Opn3
13603
-100.00
CBP
Opn3
13603
-259.00
CDK9
Opn3
13603
-438.00
CDK9
Opn3
13603
-380.00
CEBPA
Opn3
13603
-41.00
CEBPB
Opn3
13603
-152.00
CEBPB
Opn3
13603
103.00
CHD4
Opn3
13603
-135.00
CHD4
Opn3
13603
-129.00
CHD4
Opn3
13603
-104.00
CHD4
Opn3
13603
-100.00
CHD4
Opn3
13603
-58.00
CHD4
Opn3
13603
11.00
CHD4
Opn3
13603
115.00
CHD4
Opn3
13603
161.00
COE1
Opn3
13603
-120.00
COE1
Opn3
13603
-100.00
COE1
Opn3
13603
-88.00
COE1
Opn3
13603
-25.00
COE1
Opn3
13603
75.00
CRX
Opn3
13603
-246.00
CRX
Opn3
13603
-224.00
CRY1
Opn3
13603
-110.00
CRY2
Opn3
13603
-60.00
CTCF
Opn3
13603
-355.00
CTCF
Opn3
13603
-296.00
CTCF
Opn3
13603
-106.00
E2F1
Opn3
13603
76.00
E2F2
Opn3
13603
-500.00
E2F4
Opn3
13603
-380.00
E2F4
Opn3
13603
-285.00
E2F4
Opn3
13603
-255.00
E2F4
Opn3
13603
8.00
E2F4
Opn3
13603
33.00
ELF1
Opn3
13603
-104.00
ELF1
Opn3
13603
-101.00
ELL2
Opn3
13603
-193.00
EP300
Opn3
13603
-519.00
EP300
Opn3
13603
-197.00
EP300
Opn3
13603
-160.00
EP300
Opn3
13603
-156.00
EP300
Opn3
13603
-154.00
EP300
Opn3
13603
-132.00
EP300
Opn3
13603
-131.00
EP300
Opn3
13603
-130.00
EP300
Opn3
13603
-120.00
EP300
Opn3
13603
-119.00
EP300
Opn3
13603
-116.00
EP300
Opn3
13603
-105.00
EP300
Opn3
13603
-104.00
EP300
Opn3
13603
-86.00
EP300
Opn3
13603
-75.00
EP300
Opn3
13603
-68.00
EP300
Opn3
13603
-59.00
EP300
Opn3
13603
-47.00
EP300
Opn3
13603
-13.00
EP300
Opn3
13603
-10.00
EP300
Opn3
13603
64.00
EP300
Opn3
13603
101.00
EP300
Opn3
13603
142.00
EP300
Opn3
13603
144.00
EP400
Opn3
13603
-475.00
ESR1
Opn3
13603
-108.00
ESR1
Opn3
13603
58.00
ESR1
Opn3
13603
112.00
ETS1
Opn3
13603
-14.00
ETS1
Opn3
13603
31.00
EZH1
Opn3
13603
33.00
FLI1
Opn3
13603
107.00
FOSL2
Opn3
13603
-339.00
FOSL2
Opn3
13603
-178.00
FOSL2
Opn3
13603
-175.00
FOSL2
Opn3
13603
-137.00
FOXA2
Opn3
13603
-70.00
FOXA2
Opn3
13603
98.00
FOXO1
Opn3
13603
-220.00
FOXO1
Opn3
13603
70.00
HCFC1
Opn3
13603
-124.00
HDAC2
Opn3
13603
-89.00
HDAC2
Opn3
13603
-73.00
HXB4
Opn3
13603
-3.00
IKZF1
Opn3
13603
-145.00
IKZF1
Opn3
13603
-115.00
IKZF1
Opn3
13603
-106.00
IKZF1
Opn3
13603
65.00
IRF4
Opn3
13603
-452.00
IRF4
Opn3
13603
-446.00
IRF4
Opn3
13603
-445.00
IRF4
Opn3
13603
-421.00
IRF4
Opn3
13603
-362.00
IRF4
Opn3
13603
-358.00
IRF4
Opn3
13603
-143.00
IRF4
Opn3
13603
-122.00
IRF4
Opn3
13603
-105.00
IRF4
Opn3
13603
-75.00
IRF4
Opn3
13603
-9.00
IRF4
Opn3
13603
38.00
IRF4
Opn3
13603
67.00
IRF4
Opn3
13603
98.00
IRF4
Opn3
13603
102.00
IRF4
Opn3
13603
108.00
IRF4
Opn3
13603
185.00
JUN
Opn3
13603
-226.00
JUNB
Opn3
13603
-15.00
JUNB
Opn3
13603
102.00
JUND
Opn3
13603
-364.00
JUND
Opn3
13603
-70.00
KDM1A
Opn3
13603
-473.00
KDM6B
Opn3
13603
10.00
KDM6B
Opn3
13603
120.00
KLF1
Opn3
13603
59.00
KLF1
Opn3
13603
142.00
KLF3
Opn3
13603
-33.00
KLF4
Opn3
13603
-922.00
KLF4
Opn3
13603
-735.00
KLF4
Opn3
13603
-568.00
KLF4
Opn3
13603
42.00
KMT2C
Opn3
13603
138.00
KMT2D
Opn3
13603
-174.00
KMT2D
Opn3
13603
16.00
KMT2D
Opn3
13603
26.00
MED1
Opn3
13603
-185.00
MED1
Opn3
13603
-38.00
MED1
Opn3
13603
120.00
MK08
Opn3
13603
-190.00
MK10
Opn3
13603
-190.00
MYOD1
Opn3
13603
-86.00
MYOD1
Opn3
13603
120.00
NANOG
Opn3
13603
-568.00
NANOG
Opn3
13603
21.00
NCOA2
Opn3
13603
18.00
NCOA2
Opn3
13603
19.00
NKX61
Opn3
13603
-98.00
NR1D1
Opn3
13603
-84.00
PAXI1
Opn3
13603
-386.00
PAXI1
Opn3
13603
-181.00
PEBB
Opn3
13603
-131.00
PER1
Opn3
13603
-60.00
PER2
Opn3
13603
-70.00
PIT1
Opn3
13603
-577.00
PIT1
Opn3
13603
-475.00
PIT1
Opn3
13603
-375.00
PITX2
Opn3
13603
185.00
PO5F1
Opn3
13603
-404.00
PO5F1
Opn3
13603
-130.00
PO5F1
Opn3
13603
-110.00
PO5F1
Opn3
13603
-77.00
PO5F1
Opn3
13603
-38.00
PO5F1
Opn3
13603
-2.00
PO5F1
Opn3
13603
16.00
PO5F1
Opn3
13603
56.00
PO5F1
Opn3
13603
77.00
PO5F1
Opn3
13603
99.00
PO5F1
Opn3
13603
124.00
PO5F1
Opn3
13603
146.00
PO5F1
Opn3
13603
159.00
PO5F1
Opn3
13603
171.00
PPARG
Opn3
13603
-382.00
PPARG
Opn3
13603
-224.00
PPARG
Opn3
13603
-4.00
PPARG
Opn3
13603
76.00
PPARG
Opn3
13603
126.00
PRGR
Opn3
13603
-47.00
PRGR
Opn3
13603
95.00
PRGR
Opn3
13603
136.00
RARA
Opn3
13603
136.00
RARB
Opn3
13603
101.00
RFA2
Opn3
13603
-679.00
RING2
Opn3
13603
-319.00
RPB1
Opn3
13603
157.00
RXRA
Opn3
13603
103.00
RXRA
Opn3
13603
110.00
RXRA
Opn3
13603
113.00
RXRA
Opn3
13603
133.00
RXRA
Opn3
13603
151.00
RXRA
Opn3
13603
193.00
RPB1
Opn3
13603
157
RUNX1
Opn3
13603
5
RUNX3
Opn3
13603
26
RXRA
Opn3
13603
103
RXRA
Opn3
13603
110
RXRA
Opn3
13603
113
RXRA
Opn3
13603
133
RXRA
Opn3
13603
151
RXRA
Opn3
13603
193
SIR1
Opn3
13603
-395
SIR1
Opn3
13603
-259
SIR1
Opn3
13603
24
SIX1
Opn3
13603
32
SMAD3
Opn3
13603
-4
SMC3
Opn3
13603
163
SMCA4
Opn3
13603
-205
SMCA4
Opn3
13603
-188
SOX17
Opn3
13603
-675
SOX2
Opn3
13603
-251
SOX2
Opn3
13603
-191
SOX2
Opn3
13603
-110
SOX2
Opn3
13603
16
SOX2
Opn3
13603
103
SOX3
Opn3
13603
174
SPI1
Opn3
13603
-947
SPI1
Opn3
13603
-914
SPI1
Opn3
13603
-913
SPI1
Opn3
13603
-912
SPI1
Opn3
13603
-860
SPI1
Opn3
13603
-803
SPI1
Opn3
13603
-797
SPI1
Opn3
13603
-749
SPI1
Opn3
13603
-473
SPI1
Opn3
13603
-279
SPI1
Opn3
13603
-239
SPI1
Opn3
13603
-235
SPI1
Opn3
13603
-225
SPI1
Opn3
13603
-217
SPI1
Opn3
13603
-214
SPI1
Opn3
13603
-210
SPI1
Opn3
13603
-208
SPI1
Opn3
13603
-204
SPI1
Opn3
13603
-203
SPI1
Opn3
13603
-198
SPI1
Opn3
13603
-196
SPI1
Opn3
13603
-185
SPI1
Opn3
13603
-183
SPI1
Opn3
13603
-182
SPI1
Opn3
13603
-181
SPI1
Opn3
13603
-170
SPI1
Opn3
13603
-169
SPI1
Opn3
13603
-165
SPI1
Opn3
13603
-153
SPI1
Opn3
13603
-151
SPI1
Opn3
13603
-150
SPI1
Opn3
13603
-131
SPI1
Opn3
13603
-117
SPI1
Opn3
13603
-94
SPI1
Opn3
13603
-88
SPI1
Opn3
13603
-83
SPI1
Opn3
13603
-80
SPI1
Opn3
13603
-64
SPI1
Opn3
13603
-47
SPI1
Opn3
13603
-20
SPI1
Opn3
13603
-19
SPI1
Opn3
13603
-11
SPI1
Opn3
13603
-6
SPI1
Opn3
13603
4
SPI1
Opn3
13603
13
SPI1
Opn3
13603
20
SPI1
Opn3
13603
33
SPI1
Opn3
13603
35
SPI1
Opn3
13603
53
SPI1
Opn3
13603
78
SPI1
Opn3
13603
90
SPI1
Opn3
13603
102
SPI1
Opn3
13603
114
SPI1
Opn3
13603
115
SPI1
Opn3
13603
138
SPI1
Opn3
13603
150
SPI1
Opn3
13603
153
SPI1
Opn3
13603
155
SPI1
Opn3
13603
157
SPI1
Opn3
13603
162
SPI1
Opn3
13603
164
SPI1
Opn3
13603
192
SPT5H
Opn3
13603
-436
SPT5H
Opn3
13603
-427
SPT5H
Opn3
13603
-404
SRF
Opn3
13603
-315
SRF
Opn3
13603
-55
SRF
Opn3
13603
57
STA5B
Opn3
13603
-202
STAT1
Opn3
13603
94
STAT1
Opn3
13603
101
STAT3
Opn3
13603
-67
STAT6
Opn3
13603
4
STAT6
Opn3
13603
129
SUZ12
Opn3
13603
-450
SUZ12
Opn3
13603
-418
SUZ12
Opn3
13603
-208
SUZ12
Opn3
13603
-3
TAF3
Opn3
13603
-444
TBP
Opn3
13603
-236
TBP
Opn3
13603
80
TBP
Opn3
13603
144
TBX21
Opn3
13603
-91
TBX3
Opn3
13603
-312
TBX3
Opn3
13603
-77
TBX5
Opn3
13603
-321
TCF7
Opn3
13603
-153
TEAD4
Opn3
13603
-317
TEAD4
Opn3
13603
-175
TET1
Opn3
13603
-577
TF2B
Opn3
13603
77
TF2B
Opn3
13603
151
TF2B
Opn3
13603
152
TF65
Opn3
13603
-277
TF65
Opn3
13603
-275
TF65
Opn3
13603
-273
TF65
Opn3
13603
-267
TF65
Opn3
13603
-262
TF65
Opn3
13603
-253
TF65
Opn3
13603
-225
TF65
Opn3
13603
-221
TF65
Opn3
13603
-126
TF65
Opn3
13603
-110
TF65
Opn3
13603
-92
TF65
Opn3
13603
-90
TF65
Opn3
13603
-70
TF65
Opn3
13603
-69
TF7L2
Opn3
13603
-289
TFAP4
Opn3
13603
-438
TFE2
Opn3
13603
-2
TGIF1
Opn3
13603
-904
TGIF1
Opn3
13603
-371
TGIF1
Opn3
13603
-1
THB
Opn3
13603
62
USF1
Opn3
13603
-122
WDR5
Opn3
13603
161
WT1
Opn3
13603
-349
WT1
Opn3
13603
-60
ZFX
Opn3
13603
56
SIR1
Opn3
13603
-395.00
SIR1
Opn3
13603
-259.00
SIR1
Opn3
13603
24.00
SIX1
Opn3
13603
32.00
SMAD3
Opn3
13603
-4.00
SMC3
Opn3
13603
163.00
SMCA4
Opn3
13603
-205.00
SMCA4
Opn3
13603
-188.00
SOX17
Opn3
13603
-675.00
SOX2
Opn3
13603
-251.00
SOX2
Opn3
13603
-191.00
SOX2
Opn3
13603
-110.00
SOX2
Opn3
13603
16.00
SPI1
Opn3
13603
-947.00
SPI1
Opn3
13603
-914.00
SPI1
Opn3
13603
-913.00
SPI1
Opn3
13603
-860.00
SPI1
Opn3
13603
-803.00
SPI1
Opn3
13603
-797.00
SPI1
Opn3
13603
-749.00
SPI1
Opn3
13603
-235.00
SPI1
Opn3
13603
-217.00
SPI1
Opn3
13603
-214.00
SPI1
Opn3
13603
-208.00
SPI1
Opn3
13603
-204.00
SPI1
Opn3
13603
-198.00
SPI1
Opn3
13603
-196.00
SPI1
Opn3
13603
-185.00
SPI1
Opn3
13603
-182.00
SPI1
Opn3
13603
-181.00
SPI1
Opn3
13603
-170.00
SPI1
Opn3
13603
-151.00
SPI1
Opn3
13603
-117.00
SPI1
Opn3
13603
-80.00
SPI1
Opn3
13603
-64.00
SPI1
Opn3
13603
-47.00
SPI1
Opn3
13603
-19.00
SPI1
Opn3
13603
-11.00
SPI1
Opn3
13603
-6.00
SPI1
Opn3
13603
13.00
SPI1
Opn3
13603
20.00
SPI1
Opn3
13603
33.00
SPI1
Opn3
13603
35.00
SPI1
Opn3
13603
78.00
SPI1
Opn3
13603
90.00
SPI1
Opn3
13603
102.00
SPI1
Opn3
13603
114.00
SPI1
Opn3
13603
115.00
SPI1
Opn3
13603
138.00
SPI1
Opn3
13603
153.00
SPI1
Opn3
13603
155.00
SPI1
Opn3
13603
157.00
SPI1
Opn3
13603
162.00
SPI1
Opn3
13603
164.00
SPI1
Opn3
13603
192.00
SPT5H
Opn3
13603
-436.00
SPT5H
Opn3
13603
-427.00
SPT5H
Opn3
13603
-404.00
SRF
Opn3
13603
-315.00
SRF
Opn3
13603
-55.00
SRF
Opn3
13603
57.00
STA5B
Opn3
13603
-202.00
STAT1
Opn3
13603
94.00
STAT3
Opn3
13603
-67.00
STAT6
Opn3
13603
4.00
STAT6
Opn3
13603
129.00
TBP
Opn3
13603
-236.00
TBP
Opn3
13603
80.00
TBX21
Opn3
13603
-91.00
TBX3
Opn3
13603
-312.00
TBX5
Opn3
13603
-321.00
TCF7
Opn3
13603
-153.00
TEAD4
Opn3
13603
-317.00
TEAD4
Opn3
13603
-175.00
TET1
Opn3
13603
-577.00
TF65
Opn3
13603
-277.00
TF65
Opn3
13603
-273.00
TF65
Opn3
13603
-267.00
TF65
Opn3
13603
-262.00
TF65
Opn3
13603
-253.00
TF65
Opn3
13603
-225.00
TF65
Opn3
13603
-221.00
TF65
Opn3
13603
-126.00
TF65
Opn3
13603
-90.00
TF7L2
Opn3
13603
-289.00
TFE2
Opn3
13603
-2.00
USF1
Opn3
13603
-122.00
WDR5
Opn3
13603
161.00
ZFX
Opn3
13603
56.00
Additional Information about the Gene
Expression1
Allen Brain Atlas
BGEM
EMAGE
GeneNote
genepaint
GNF Symatlas
GENSAT
Expression2
AceView
HGNC Expression
UCSC
GEO
ArrayExpress
Cleanex
Function
AMIGO
MIPS
Panther
Uniport
Genecards
InterPro
IHOP
Gene Regulation
MicroRNA target
TRED
Pathways
Biocarta Pathways CGAP SAGE
KEGG Pathways
EBI
Sequences
NCBI
Ensembl
MGI Information
QTL
Harvester
Howdy
Interactions
MIMI
EBI
Nature-NCI
string
IHOP
Tools Links
Sequence Manipulation
Genes and Transcripts
Micoroarray Analysis
Literature Search
Protein
Databases
Functional Analysis
Transcription Factor Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
Target Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9