Transcription Factors and their targets
Search Term:
TF
TargetGene
TargetGeneID
Home
Gene List
TF list
Protocol
Contact
TF
Target
Gene ID
Distance From TSS
AICDA
Nek2
18005
-350.00
AP2C
Nek2
18005
-967.00
ASH2L
Nek2
18005
-434.00
ASH2L
Nek2
18005
-304.00
ATF4
Nek2
18005
-17.00
ATOH1
Nek2
18005
-151.00
BAP1
Nek2
18005
-594.00
BATF
Nek2
18005
-194.00
BATF
Nek2
18005
-155.00
CBP
Nek2
18005
-291.00
CBP
Nek2
18005
-86.00
CBX3
Nek2
18005
-351.00
CBX3
Nek2
18005
73.00
CCND1
Nek2
18005
-300.00
CDK8
Nek2
18005
-384.00
CDK9
Nek2
18005
-324.00
CEBPB
Nek2
18005
-166.00
CHD4
Nek2
18005
-643.00
CHD4
Nek2
18005
-138.00
CHD4
Nek2
18005
60.00
COE1
Nek2
18005
-514.00
COE1
Nek2
18005
-257.00
COE1
Nek2
18005
-238.00
COE1
Nek2
18005
-214.00
COE1
Nek2
18005
-183.00
CREM
Nek2
18005
-548.00
CRX
Nek2
18005
-242.00
CRX
Nek2
18005
-234.00
CTCF
Nek2
18005
-346.00
CTR9
Nek2
18005
-193.00
CXXC1
Nek2
18005
-396.00
DMAP1
Nek2
18005
-449.00
DPY30
Nek2
18005
-625.00
E2F1
Nek2
18005
-138.00
E2F3
Nek2
18005
-109.00
E2F4
Nek2
18005
-694.00
E2F4
Nek2
18005
-588.00
E2F4
Nek2
18005
-382.00
E2F4
Nek2
18005
-300.00
E2F4
Nek2
18005
-244.00
E2F4
Nek2
18005
-166.00
E2F4
Nek2
18005
-112.00
E2F4
Nek2
18005
-86.00
E2F4
Nek2
18005
-81.00
EGR2
Nek2
18005
-567.00
EGR2
Nek2
18005
-497.00
ELL2
Nek2
18005
-115.00
EP300
Nek2
18005
-709.00
EP300
Nek2
18005
-606.00
EP300
Nek2
18005
-452.00
EP300
Nek2
18005
-363.00
EP300
Nek2
18005
-271.00
EP300
Nek2
18005
-188.00
EP300
Nek2
18005
-161.00
EP300
Nek2
18005
-147.00
EP300
Nek2
18005
-143.00
EP300
Nek2
18005
-132.00
EP300
Nek2
18005
-109.00
EP300
Nek2
18005
-104.00
EP300
Nek2
18005
-101.00
EP300
Nek2
18005
-95.00
EP300
Nek2
18005
-69.00
EP300
Nek2
18005
32.00
EP300
Nek2
18005
39.00
EP300
Nek2
18005
120.00
ERR2
Nek2
18005
-396.00
ERR2
Nek2
18005
-147.00
ESR1
Nek2
18005
-301.00
ESR1
Nek2
18005
-100.00
ETS1
Nek2
18005
-220.00
ETS2
Nek2
18005
-122.00
ETS2
Nek2
18005
-85.00
ETS2
Nek2
18005
-20.00
ETS2
Nek2
18005
30.00
ETV6
Nek2
18005
-331.00
FLI1
Nek2
18005
-304.00
FOXA1
Nek2
18005
-137.00
FOXA2
Nek2
18005
-392.00
FOXA2
Nek2
18005
-319.00
FOXO1
Nek2
18005
-109.00
HCFC1
Nek2
18005
-497.00
HELLS
Nek2
18005
-45.00
HNF4A
Nek2
18005
-488.00
HXB4
Nek2
18005
-914.00
IKZF1
Nek2
18005
-372.00
IKZF1
Nek2
18005
-262.00
IKZF1
Nek2
18005
-245.00
IKZF1
Nek2
18005
-220.00
IKZF1
Nek2
18005
-194.00
IRF4
Nek2
18005
-306.00
IRF4
Nek2
18005
-254.00
IRF4
Nek2
18005
-248.00
IRF4
Nek2
18005
-245.00
IRF4
Nek2
18005
-219.00
IRF4
Nek2
18005
-196.00
IRF4
Nek2
18005
-192.00
IRF4
Nek2
18005
-183.00
IRF4
Nek2
18005
-176.00
IRF4
Nek2
18005
-172.00
IRF4
Nek2
18005
-169.00
IRF4
Nek2
18005
-130.00
IRF4
Nek2
18005
-107.00
IRF4
Nek2
18005
12.00
IRF4
Nek2
18005
21.00
IRF4
Nek2
18005
183.00
JUN
Nek2
18005
-231.00
JUND
Nek2
18005
-301.00
KAT5
Nek2
18005
-376.00
KAT8
Nek2
18005
-412.00
KAT8
Nek2
18005
-350.00
KAT8
Nek2
18005
62.00
KDM1A
Nek2
18005
-421.00
KDM2A
Nek2
18005
-25.00
KDM2B
Nek2
18005
-518.00
KDM2B
Nek2
18005
-503.00
KDM2B
Nek2
18005
-307.00
KDM2B
Nek2
18005
-270.00
KDM2B
Nek2
18005
-142.00
KDM2B
Nek2
18005
52.00
KDM4B
Nek2
18005
-547.00
KDM4C
Nek2
18005
-719.00
KDM4C
Nek2
18005
3.00
KDM5A
Nek2
18005
-492.00
KDM5A
Nek2
18005
-236.00
KDM6A
Nek2
18005
-578.00
KDM6B
Nek2
18005
-452.00
KDM6B
Nek2
18005
-318.00
KLF1
Nek2
18005
101.00
KLF4
Nek2
18005
-768.00
KLF4
Nek2
18005
-754.00
KLF4
Nek2
18005
-644.00
KLF4
Nek2
18005
-407.00
KLF4
Nek2
18005
-247.00
KMT2B
Nek2
18005
-618.00
KMT2B
Nek2
18005
-369.00
KMT2B
Nek2
18005
-360.00
KMT2C
Nek2
18005
-133.00
KMT2C
Nek2
18005
-42.00
KMT2C
Nek2
18005
42.00
KMT2D
Nek2
18005
-274.00
KMT2D
Nek2
18005
-218.00
KMT2D
Nek2
18005
-216.00
KMT2D
Nek2
18005
-169.00
KMT2D
Nek2
18005
-11.00
KMT2D
Nek2
18005
26.00
MAX
Nek2
18005
-694.00
MBD1
Nek2
18005
-494.00
MBD2
Nek2
18005
-335.00
MED1
Nek2
18005
-225.00
MED1
Nek2
18005
-215.00
MED1
Nek2
18005
-52.00
MEIS1
Nek2
18005
-112.00
MK08
Nek2
18005
-191.00
MK10
Nek2
18005
-191.00
MYBA
Nek2
18005
-533.00
MYC
Nek2
18005
-729.00
MYC
Nek2
18005
-658.00
MYC
Nek2
18005
-584.00
MYC
Nek2
18005
-520.00
MYC
Nek2
18005
-449.00
MYC
Nek2
18005
-40.00
MYOD1
Nek2
18005
-149.00
MYOG
Nek2
18005
-192.00
NANOG
Nek2
18005
-860.00
NANOG
Nek2
18005
-820.00
NANOG
Nek2
18005
-694.00
NANOG
Nek2
18005
-644.00
NANOG
Nek2
18005
-492.00
NANOG
Nek2
18005
-478.00
NANOG
Nek2
18005
-428.00
NBN
Nek2
18005
-6.00
NCOR1
Nek2
18005
-256.00
NELFB
Nek2
18005
-154.00
NFIB
Nek2
18005
1.00
NFYA
Nek2
18005
-89.00
NIPBL
Nek2
18005
-120.00
NR0B1
Nek2
18005
-768.00
NR1D2
Nek2
18005
-94.00
OGT1
Nek2
18005
-178.00
PAX5
Nek2
18005
-427.00
PAX6
Nek2
18005
-786.00
PAX6
Nek2
18005
-337.00
PAXI1
Nek2
18005
-309.00
PAXI1
Nek2
18005
-136.00
PAXI1
Nek2
18005
126.00
PIT1
Nek2
18005
-710.00
PITX1
Nek2
18005
-455.00
PITX1
Nek2
18005
-348.00
PO5F1
Nek2
18005
-985.00
PO5F1
Nek2
18005
-917.00
PO5F1
Nek2
18005
-772.00
PO5F1
Nek2
18005
-732.00
PO5F1
Nek2
18005
-644.00
PO5F1
Nek2
18005
-437.00
PO5F1
Nek2
18005
-436.00
PO5F1
Nek2
18005
-419.00
PO5F1
Nek2
18005
-392.00
PO5F1
Nek2
18005
-381.00
PO5F1
Nek2
18005
-306.00
PO5F1
Nek2
18005
-297.00
PO5F1
Nek2
18005
-290.00
PO5F1
Nek2
18005
-198.00
PO5F1
Nek2
18005
-182.00
PO5F1
Nek2
18005
-164.00
PO5F1
Nek2
18005
0.00
PPARA
Nek2
18005
-468.00
PPARG
Nek2
18005
-323.00
PPARG
Nek2
18005
-305.00
PPARG
Nek2
18005
-211.00
PPARG
Nek2
18005
-168.00
PPARG
Nek2
18005
-5.00
PRD14
Nek2
18005
-474.00
RARA
Nek2
18005
-439.00
RARA
Nek2
18005
-414.00
RARA
Nek2
18005
-255.00
RARA
Nek2
18005
32.00
RARB
Nek2
18005
-439.00
RARB
Nek2
18005
-414.00
RARB
Nek2
18005
-406.00
RARG
Nek2
18005
-439.00
RARG
Nek2
18005
-414.00
RBBP5
Nek2
18005
-277.00
RBBP5
Nek2
18005
-153.00
RFX1
Nek2
18005
-315.00
RING1
Nek2
18005
-666.00
RING1
Nek2
18005
-178.00
RING2
Nek2
18005
-407.00
RING2
Nek2
18005
-224.00
RING2
Nek2
18005
-36.00
RORG
Nek2
18005
-19.00
RXRA
Nek2
18005
-603.00
RXRA
Nek2
18005
-590.00
RXRA
Nek2
18005
-546.00
RXRA
Nek2
18005
-506.00
RXRA
Nek2
18005
-481.00
RXRA
Nek2
18005
-414.00
RXRA
Nek2
18005
-392.00
RYBP
Nek2
18005
-685.00
RYBP
Nek2
18005
-300.00
RPB1
Nek2
18005
-603
RPB1
Nek2
18005
-566
RPB1
Nek2
18005
-443
RPB1
Nek2
18005
-442
RPB1
Nek2
18005
-431
RPB1
Nek2
18005
-425
RPB1
Nek2
18005
-421
RPB1
Nek2
18005
-397
RPB1
Nek2
18005
-391
RPB1
Nek2
18005
-349
RPB1
Nek2
18005
-284
RPB1
Nek2
18005
-197
RPB1
Nek2
18005
-196
RPB1
Nek2
18005
-185
RPB1
Nek2
18005
-119
RPB1
Nek2
18005
19
RUNX1
Nek2
18005
-198
RUNX2
Nek2
18005
-481
RUNX2
Nek2
18005
-407
RUNX2
Nek2
18005
-387
RXRA
Nek2
18005
-603
RXRA
Nek2
18005
-590
RXRA
Nek2
18005
-546
RXRA
Nek2
18005
-506
RXRA
Nek2
18005
-481
RXRA
Nek2
18005
-414
RXRA
Nek2
18005
-392
RXRA
Nek2
18005
-372
RXRA
Nek2
18005
-344
RYBP
Nek2
18005
-685
RYBP
Nek2
18005
-300
SALL4
Nek2
18005
-178
SIN3A
Nek2
18005
-721
SIN3A
Nek2
18005
-631
SIN3A
Nek2
18005
-569
SIN3A
Nek2
18005
-526
SIN3A
Nek2
18005
-357
SIN3A
Nek2
18005
-342
SIN3A
Nek2
18005
-335
SIN3A
Nek2
18005
-300
SIN3A
Nek2
18005
-282
SIN3A
Nek2
18005
-143
SIN3A
Nek2
18005
-105
SIN3B
Nek2
18005
-726
SIN3B
Nek2
18005
-628
SIN3B
Nek2
18005
-467
SIN3B
Nek2
18005
-388
SIN3B
Nek2
18005
-300
SIN3B
Nek2
18005
-240
SIN3B
Nek2
18005
-178
SIN3B
Nek2
18005
-142
SIN3B
Nek2
18005
-123
SIR1
Nek2
18005
-142
SIR6
Nek2
18005
-26
SIX1
Nek2
18005
-666
SIX1
Nek2
18005
-299
SIX2
Nek2
18005
-214
SMAD3
Nek2
18005
-288
SMBT1
Nek2
18005
-276
SMC3
Nek2
18005
-809
SMC3
Nek2
18005
-568
SMC5
Nek2
18005
-578
SMC5
Nek2
18005
-378
SMCA4
Nek2
18005
-504
SMCA4
Nek2
18005
-168
SMCA4
Nek2
18005
-167
SMCA4
Nek2
18005
-150
SMCA4
Nek2
18005
-147
SMCA4
Nek2
18005
-110
SMCA4
Nek2
18005
-14
SOX17
Nek2
18005
12
SOX17
Nek2
18005
58
SOX2
Nek2
18005
-644
SOX2
Nek2
18005
-402
SOX2
Nek2
18005
-360
SOX2
Nek2
18005
-247
SOX2
Nek2
18005
-81
SOX2
Nek2
18005
-80
SOX3
Nek2
18005
-258
SOX4
Nek2
18005
-345
SPI1
Nek2
18005
-139
SPIB
Nek2
18005
-447
SPT5H
Nek2
18005
-613
SPT5H
Nek2
18005
-593
SPT5H
Nek2
18005
-117
SPT5H
Nek2
18005
-108
SPT6H
Nek2
18005
-178
SRBP1
Nek2
18005
-199
SRF
Nek2
18005
-448
SRF
Nek2
18005
-271
STA5A
Nek2
18005
-316
STA5B
Nek2
18005
-438
STA5B
Nek2
18005
-316
STAT1
Nek2
18005
-126
STAT3
Nek2
18005
-302
STAT4
Nek2
18005
-382
SUH
Nek2
18005
-421
SUH
Nek2
18005
-186
SUH
Nek2
18005
-167
SUH
Nek2
18005
-154
SUH
Nek2
18005
-147
SUZ12
Nek2
18005
-637
SUZ12
Nek2
18005
-131
SUZ12
Nek2
18005
-65
SUZ12
Nek2
18005
-8
SUZ12
Nek2
18005
5
SUZ12
Nek2
18005
26
SUZ12
Nek2
18005
124
SUZ12
Nek2
18005
175
TAF3
Nek2
18005
-535
TAF3
Nek2
18005
-347
TAF3
Nek2
18005
-59
TAF3
Nek2
18005
-11
TAF7L
Nek2
18005
-172
TBP
Nek2
18005
-284
TBP
Nek2
18005
-192
TBP
Nek2
18005
-162
TBP
Nek2
18005
50
TBX3
Nek2
18005
-619
TBX3
Nek2
18005
-148
TBX5
Nek2
18005
-290
TCF7
Nek2
18005
-207
TCF7
Nek2
18005
-172
TCF7
Nek2
18005
-140
TCF7
Nek2
18005
121
TDG
Nek2
18005
-882
TET1
Nek2
18005
-573
TET1
Nek2
18005
-400
TET1
Nek2
18005
-397
TET1
Nek2
18005
-249
TET1
Nek2
18005
-163
TF65
Nek2
18005
-285
TF65
Nek2
18005
-283
TF65
Nek2
18005
-222
TF65
Nek2
18005
-205
TF65
Nek2
18005
-204
TF65
Nek2
18005
-203
TF65
Nek2
18005
-199
TF65
Nek2
18005
-195
TF65
Nek2
18005
-185
TF7L2
Nek2
18005
-544
TF7L2
Nek2
18005
-481
TFAP4
Nek2
18005
-355
TFE2
Nek2
18005
-666
TGIF1
Nek2
18005
-48
TGIF1
Nek2
18005
16
TGIF1
Nek2
18005
124
THB
Nek2
18005
-77
TIF1B
Nek2
18005
-593
TOP2A
Nek2
18005
-786
UBF1
Nek2
18005
-325
USF2
Nek2
18005
-125
UTF1
Nek2
18005
-598
UTF1
Nek2
18005
-250
UTF1
Nek2
18005
-42
UTF1
Nek2
18005
95
WDR5
Nek2
18005
-560
WDR5
Nek2
18005
-102
ZFP384
Nek2
18005
-940
SALL4
Nek2
18005
-178.00
SIN3A
Nek2
18005
-526.00
SIN3A
Nek2
18005
-342.00
SIN3A
Nek2
18005
-335.00
SIN3A
Nek2
18005
-300.00
SIN3A
Nek2
18005
-282.00
SIN3A
Nek2
18005
-143.00
SIN3A
Nek2
18005
-105.00
SIN3B
Nek2
18005
-726.00
SIN3B
Nek2
18005
-628.00
SIN3B
Nek2
18005
-467.00
SIN3B
Nek2
18005
-388.00
SIN3B
Nek2
18005
-300.00
SIN3B
Nek2
18005
-240.00
SIN3B
Nek2
18005
-178.00
SIN3B
Nek2
18005
-142.00
SIN3B
Nek2
18005
-123.00
SIR1
Nek2
18005
-142.00
SIX1
Nek2
18005
-666.00
SIX1
Nek2
18005
-299.00
SIX2
Nek2
18005
-214.00
SMAD3
Nek2
18005
-288.00
SMBT1
Nek2
18005
-276.00
SMC3
Nek2
18005
-809.00
SMC3
Nek2
18005
-568.00
SMC5
Nek2
18005
-578.00
SMC5
Nek2
18005
-378.00
SMCA4
Nek2
18005
-168.00
SMCA4
Nek2
18005
-167.00
SMCA4
Nek2
18005
-150.00
SMCA4
Nek2
18005
-147.00
SMCA4
Nek2
18005
-110.00
SOX17
Nek2
18005
12.00
SOX17
Nek2
18005
58.00
SOX2
Nek2
18005
-644.00
SOX2
Nek2
18005
-402.00
SOX2
Nek2
18005
-360.00
SOX2
Nek2
18005
-247.00
SOX2
Nek2
18005
-80.00
SPI1
Nek2
18005
-139.00
SPT5H
Nek2
18005
-613.00
SPT5H
Nek2
18005
-593.00
SPT5H
Nek2
18005
-117.00
SPT5H
Nek2
18005
-108.00
SPT6H
Nek2
18005
-178.00
SRF
Nek2
18005
-448.00
SRF
Nek2
18005
-271.00
STA5A
Nek2
18005
-316.00
STA5B
Nek2
18005
-438.00
STA5B
Nek2
18005
-316.00
STAT1
Nek2
18005
-126.00
STAT3
Nek2
18005
-302.00
STAT4
Nek2
18005
-382.00
SUH
Nek2
18005
-167.00
SUH
Nek2
18005
-154.00
SUH
Nek2
18005
-147.00
SUZ12
Nek2
18005
-8.00
TAF3
Nek2
18005
-59.00
TAF7L
Nek2
18005
-172.00
TBP
Nek2
18005
-192.00
TBX3
Nek2
18005
-148.00
TBX5
Nek2
18005
-290.00
TCF7
Nek2
18005
-207.00
TCF7
Nek2
18005
-172.00
TCF7
Nek2
18005
-140.00
TCF7
Nek2
18005
121.00
TET1
Nek2
18005
-573.00
TET1
Nek2
18005
-400.00
TET1
Nek2
18005
-397.00
TET1
Nek2
18005
-249.00
TET1
Nek2
18005
-163.00
TF65
Nek2
18005
-222.00
TF65
Nek2
18005
-205.00
TF65
Nek2
18005
-204.00
TF65
Nek2
18005
-199.00
TFE2
Nek2
18005
-666.00
TOP2A
Nek2
18005
-786.00
UTF1
Nek2
18005
-250.00
UTF1
Nek2
18005
95.00
WDR5
Nek2
18005
-102.00
Additional Information about the Gene
Expression1
Allen Brain Atlas
BGEM
EMAGE
GeneNote
genepaint
GNF Symatlas
GENSAT
Expression2
AceView
HGNC Expression
UCSC
GEO
ArrayExpress
Cleanex
Function
AMIGO
MIPS
Panther
Uniport
Genecards
InterPro
IHOP
Gene Regulation
MicroRNA target
TRED
Pathways
Biocarta Pathways CGAP SAGE
KEGG Pathways
EBI
Sequences
NCBI
Ensembl
MGI Information
QTL
Harvester
Howdy
Interactions
MIMI
EBI
Nature-NCI
string
IHOP
Tools Links
Sequence Manipulation
Genes and Transcripts
Micoroarray Analysis
Literature Search
Protein
Databases
Functional Analysis
Transcription Factor Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
Target Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9