Transcription Factors and their targets
Search Term:
TF
TargetGene
TargetGeneID
Home
Gene List
TF list
Protocol
Contact
TF
Target
Gene ID
Distance From TSS
AFF4
Lmln
239833
-548.00
AICDA
Lmln
239833
-466.00
AICDA
Lmln
239833
-434.00
AP2A
Lmln
239833
-218.00
AP2A
Lmln
239833
-206.00
AP2C
Lmln
239833
-600.00
ASCL1
Lmln
239833
-487.00
ASCL1
Lmln
239833
-49.00
ATF4
Lmln
239833
-272.00
ATOH1
Lmln
239833
-167.00
BAP1
Lmln
239833
-742.00
BATF
Lmln
239833
-506.00
BATF
Lmln
239833
-481.00
BATF
Lmln
239833
-480.00
BATF
Lmln
239833
-469.00
BATF
Lmln
239833
-364.00
BATF
Lmln
239833
-326.00
BATF
Lmln
239833
-310.00
BATF
Lmln
239833
-298.00
BATF
Lmln
239833
-295.00
BATF
Lmln
239833
-284.00
BATF
Lmln
239833
-255.00
BATF
Lmln
239833
-241.00
BATF
Lmln
239833
-207.00
BATF
Lmln
239833
-69.00
BATF
Lmln
239833
141.00
BCL6
Lmln
239833
-740.00
CBX3
Lmln
239833
-815.00
CCND1
Lmln
239833
-731.00
CDK8
Lmln
239833
-382.00
CDK9
Lmln
239833
-399.00
CEBPA
Lmln
239833
-178.00
CEBPB
Lmln
239833
-866.00
CEBPB
Lmln
239833
-293.00
CEBPB
Lmln
239833
-176.00
CEBPB
Lmln
239833
92.00
CEBPB
Lmln
239833
98.00
COE1
Lmln
239833
-475.00
COE1
Lmln
239833
23.00
CREM
Lmln
239833
-338.00
CRX
Lmln
239833
-294.00
CRX
Lmln
239833
-282.00
CRX
Lmln
239833
-279.00
CTCF
Lmln
239833
150.00
CXXC1
Lmln
239833
-49.00
DMC1
Lmln
239833
-586.00
DMC1
Lmln
239833
-159.00
DPY30
Lmln
239833
-956.00
E2F1
Lmln
239833
-446.00
E2F3
Lmln
239833
-426.00
E2F3
Lmln
239833
-414.00
E2F4
Lmln
239833
-725.00
E2F4
Lmln
239833
-537.00
E2F4
Lmln
239833
-285.00
E2F4
Lmln
239833
-143.00
EGR2
Lmln
239833
-429.00
EGR2
Lmln
239833
-384.00
EOMES
Lmln
239833
-633.00
EP300
Lmln
239833
-622.00
EP300
Lmln
239833
-525.00
EP300
Lmln
239833
-510.00
EP300
Lmln
239833
-490.00
EP300
Lmln
239833
-486.00
EP300
Lmln
239833
-478.00
EP300
Lmln
239833
-471.00
EP300
Lmln
239833
-464.00
EP300
Lmln
239833
-454.00
EP300
Lmln
239833
-421.00
EP300
Lmln
239833
-409.00
EP300
Lmln
239833
-397.00
EP300
Lmln
239833
-396.00
EP300
Lmln
239833
-387.00
EP300
Lmln
239833
-357.00
EP300
Lmln
239833
-345.00
EP300
Lmln
239833
-303.00
EP300
Lmln
239833
-287.00
EP300
Lmln
239833
-274.00
EP300
Lmln
239833
-252.00
EP300
Lmln
239833
-195.00
EP300
Lmln
239833
-163.00
EP300
Lmln
239833
-99.00
EP300
Lmln
239833
47.00
EP300
Lmln
239833
93.00
EP400
Lmln
239833
-527.00
ERR1
Lmln
239833
-676.00
ERR2
Lmln
239833
-528.00
ESR1
Lmln
239833
-388.00
ESR1
Lmln
239833
-363.00
ESR1
Lmln
239833
-10.00
ETS1
Lmln
239833
-232.00
ETS2
Lmln
239833
182.00
EZH2
Lmln
239833
-305.00
EZH2
Lmln
239833
-143.00
FIZ1
Lmln
239833
-764.00
FLI1
Lmln
239833
-369.00
FOSL2
Lmln
239833
-630.00
FOSL2
Lmln
239833
-616.00
FOSL2
Lmln
239833
-207.00
FOXA2
Lmln
239833
-410.00
FOXA2
Lmln
239833
-388.00
FOXA2
Lmln
239833
87.00
FOXA2
Lmln
239833
172.00
FOXO1
Lmln
239833
-315.00
FOXO1
Lmln
239833
-90.00
GATA2
Lmln
239833
-590.00
GATA2
Lmln
239833
-189.00
HCFC1
Lmln
239833
-764.00
HELLS
Lmln
239833
-356.00
HIF1A
Lmln
239833
-392.00
HIF1A
Lmln
239833
-282.00
HNF4A
Lmln
239833
50.00
HXB4
Lmln
239833
-777.00
IKZF1
Lmln
239833
-466.00
IRF3
Lmln
239833
-123.00
IRF4
Lmln
239833
-855.00
IRF4
Lmln
239833
-747.00
IRF4
Lmln
239833
-743.00
IRF4
Lmln
239833
-673.00
IRF4
Lmln
239833
-646.00
IRF4
Lmln
239833
-566.00
IRF4
Lmln
239833
-510.00
IRF4
Lmln
239833
-502.00
IRF4
Lmln
239833
-459.00
IRF4
Lmln
239833
-438.00
IRF4
Lmln
239833
-406.00
IRF4
Lmln
239833
-401.00
IRF4
Lmln
239833
-364.00
IRF4
Lmln
239833
-353.00
IRF4
Lmln
239833
-318.00
IRF4
Lmln
239833
-246.00
IRF4
Lmln
239833
-189.00
IRF4
Lmln
239833
-84.00
IRF4
Lmln
239833
-80.00
IRF4
Lmln
239833
-18.00
IRF4
Lmln
239833
8.00
IRF4
Lmln
239833
86.00
ISL1
Lmln
239833
-90.00
JUN
Lmln
239833
-543.00
JUN
Lmln
239833
-286.00
JUN
Lmln
239833
-201.00
JUND
Lmln
239833
-294.00
JUND
Lmln
239833
-61.00
KAT8
Lmln
239833
-406.00
KAT8
Lmln
239833
-313.00
KAT8
Lmln
239833
136.00
KAT8
Lmln
239833
150.00
KDM1A
Lmln
239833
-265.00
KDM2A
Lmln
239833
-512.00
KDM2A
Lmln
239833
-369.00
KDM2A
Lmln
239833
63.00
KDM2B
Lmln
239833
-725.00
KDM2B
Lmln
239833
-599.00
KDM2B
Lmln
239833
-443.00
KDM2B
Lmln
239833
-309.00
KDM2B
Lmln
239833
-288.00
KDM2B
Lmln
239833
-262.00
KDM2B
Lmln
239833
70.00
KDM2B
Lmln
239833
76.00
KDM2B
Lmln
239833
190.00
KDM4B
Lmln
239833
-615.00
KDM4C
Lmln
239833
-715.00
KDM4C
Lmln
239833
-250.00
KDM4C
Lmln
239833
57.00
KDM5A
Lmln
239833
-336.00
KDM6B
Lmln
239833
-447.00
KLF1
Lmln
239833
-99.00
KLF4
Lmln
239833
-819.00
KLF4
Lmln
239833
-522.00
KMT2B
Lmln
239833
-517.00
KMT2B
Lmln
239833
55.00
KMT2C
Lmln
239833
-456.00
KMT2D
Lmln
239833
-368.00
KMT2D
Lmln
239833
-281.00
KMT2D
Lmln
239833
-264.00
MAF
Lmln
239833
-612.00
MAF
Lmln
239833
-610.00
MBD1
Lmln
239833
-583.00
MED1
Lmln
239833
-469.00
MED1
Lmln
239833
-295.00
MED1
Lmln
239833
-258.00
MED1
Lmln
239833
-189.00
MEIS1
Lmln
239833
-199.00
MEIS1
Lmln
239833
-89.00
MTOR
Lmln
239833
-290.00
MYBA
Lmln
239833
-240.00
MYC
Lmln
239833
-819.00
MYC
Lmln
239833
-522.00
MYC
Lmln
239833
-386.00
MYOD1
Lmln
239833
-690.00
MYOD1
Lmln
239833
-650.00
MYOD1
Lmln
239833
-534.00
MYOD1
Lmln
239833
-486.00
MYOD1
Lmln
239833
-337.00
MYOD1
Lmln
239833
-325.00
MYOD1
Lmln
239833
-83.00
MYOD1
Lmln
239833
135.00
MYOG
Lmln
239833
-597.00
MYOG
Lmln
239833
-343.00
MYOG
Lmln
239833
-132.00
NANOG
Lmln
239833
-358.00
NANOG
Lmln
239833
-258.00
NCOA2
Lmln
239833
-291.00
NDF2
Lmln
239833
-540.00
NDF2
Lmln
239833
-479.00
NELFB
Lmln
239833
-386.00
NIPBL
Lmln
239833
-581.00
NIPBL
Lmln
239833
-288.00
NKX21
Lmln
239833
-436.00
NKX61
Lmln
239833
-199.00
NR0B1
Lmln
239833
-912.00
OLIG2
Lmln
239833
-270.00
OLIG2
Lmln
239833
-250.00
P53
Lmln
239833
-702.00
PAX6
Lmln
239833
198.00
PAXI1
Lmln
239833
-525.00
PAXI1
Lmln
239833
-299.00
PITX1
Lmln
239833
-757.00
PITX1
Lmln
239833
-547.00
PO5F1
Lmln
239833
-965.00
PO5F1
Lmln
239833
-819.00
PO5F1
Lmln
239833
-522.00
PO5F1
Lmln
239833
-498.00
PO5F1
Lmln
239833
-386.00
PO5F1
Lmln
239833
-263.00
PO5F1
Lmln
239833
-234.00
PO5F1
Lmln
239833
-188.00
PO5F1
Lmln
239833
63.00
PPARG
Lmln
239833
-596.00
PPARG
Lmln
239833
-592.00
PPARG
Lmln
239833
-537.00
PPARG
Lmln
239833
-528.00
PPARG
Lmln
239833
-500.00
PPARG
Lmln
239833
-463.00
PPARG
Lmln
239833
-446.00
PPARG
Lmln
239833
-339.00
PPARG
Lmln
239833
-305.00
PPARG
Lmln
239833
-297.00
PRGR
Lmln
239833
-167.00
PRGR
Lmln
239833
16.00
PTF1A
Lmln
239833
-395.00
RARA
Lmln
239833
-763.00
RARA
Lmln
239833
-755.00
RARA
Lmln
239833
-663.00
RARA
Lmln
239833
-627.00
RARA
Lmln
239833
-579.00
RARA
Lmln
239833
-479.00
RARA
Lmln
239833
38.00
RARB
Lmln
239833
-700.00
RARB
Lmln
239833
-293.00
RBBP5
Lmln
239833
-67.00
RFX1
Lmln
239833
-282.00
RING1
Lmln
239833
-731.00
RING2
Lmln
239833
-731.00
RING2
Lmln
239833
-288.00
RING2
Lmln
239833
-268.00
RING2
Lmln
239833
150.00
RORG
Lmln
239833
-474.00
RORG
Lmln
239833
-401.00
RORG
Lmln
239833
-101.00
RPB1
Lmln
239833
-638.00
RUNX3
Lmln
239833
-478.00
RXRA
Lmln
239833
-772.00
RXRA
Lmln
239833
-625.00
RXRA
Lmln
239833
-622.00
RXRA
Lmln
239833
-595.00
RXRA
Lmln
239833
-566.00
RXRA
Lmln
239833
-551.00
RXRA
Lmln
239833
-505.00
RXRA
Lmln
239833
-376.00
RXRA
Lmln
239833
-251.00
RYBP
Lmln
239833
-763.00
RYBP
Lmln
239833
-434.00
RPB1
Lmln
239833
-988
RPB1
Lmln
239833
-881
RPB1
Lmln
239833
-874
RPB1
Lmln
239833
-765
RPB1
Lmln
239833
-764
RPB1
Lmln
239833
-748
RPB1
Lmln
239833
-734
RPB1
Lmln
239833
-733
RPB1
Lmln
239833
-731
RPB1
Lmln
239833
-726
RPB1
Lmln
239833
-720
RPB1
Lmln
239833
-718
RPB1
Lmln
239833
-716
RPB1
Lmln
239833
-713
RPB1
Lmln
239833
-697
RPB1
Lmln
239833
-691
RPB1
Lmln
239833
-658
RPB1
Lmln
239833
-638
RPB1
Lmln
239833
-495
RPB1
Lmln
239833
-432
RPB1
Lmln
239833
-402
RUNX1
Lmln
239833
-371
RUNX1
Lmln
239833
-328
RUNX2
Lmln
239833
-725
RUNX2
Lmln
239833
-693
RUNX2
Lmln
239833
-610
RUNX3
Lmln
239833
-587
RUNX3
Lmln
239833
-522
RUNX3
Lmln
239833
-478
RXRA
Lmln
239833
-772
RXRA
Lmln
239833
-625
RXRA
Lmln
239833
-622
RXRA
Lmln
239833
-595
RXRA
Lmln
239833
-566
RXRA
Lmln
239833
-551
RXRA
Lmln
239833
-505
RXRA
Lmln
239833
-376
RXRA
Lmln
239833
-251
RYBP
Lmln
239833
-763
RYBP
Lmln
239833
-434
SIN3A
Lmln
239833
-615
SIN3A
Lmln
239833
-434
SIN3A
Lmln
239833
-360
SIN3A
Lmln
239833
-311
SIN3A
Lmln
239833
59
SIN3B
Lmln
239833
-18
SIR1
Lmln
239833
-298
SIR1
Lmln
239833
169
SIR6
Lmln
239833
-527
SIR6
Lmln
239833
-235
SIX1
Lmln
239833
-730
SMAD3
Lmln
239833
-353
SMAD3
Lmln
239833
-248
SMBT1
Lmln
239833
-272
SMC1A
Lmln
239833
-942
SMC3
Lmln
239833
-620
SMC3
Lmln
239833
-569
SMC3
Lmln
239833
-532
SMC3
Lmln
239833
-491
SMC3
Lmln
239833
149
SMCA4
Lmln
239833
-373
SMCA4
Lmln
239833
-230
SMCA4
Lmln
239833
57
SMCA4
Lmln
239833
129
SOX17
Lmln
239833
-600
SOX17
Lmln
239833
-528
SOX2
Lmln
239833
-778
SOX2
Lmln
239833
-560
SOX2
Lmln
239833
-522
SOX2
Lmln
239833
-486
SOX2
Lmln
239833
-386
SOX2
Lmln
239833
-209
SPI1
Lmln
239833
-302
SPI1
Lmln
239833
-294
SPI1
Lmln
239833
-261
SPI1
Lmln
239833
-248
SPI1
Lmln
239833
-237
SPT5H
Lmln
239833
-980
SRF
Lmln
239833
-230
SRF
Lmln
239833
-198
STA5A
Lmln
239833
-428
STA5A
Lmln
239833
-108
STA5B
Lmln
239833
-620
STAT3
Lmln
239833
-859
STAT3
Lmln
239833
-691
STAT3
Lmln
239833
-608
STAT3
Lmln
239833
-499
STAT3
Lmln
239833
-410
STAT3
Lmln
239833
-407
STAT3
Lmln
239833
-304
STAT3
Lmln
239833
-296
STAT3
Lmln
239833
-228
STAT3
Lmln
239833
-227
STAT6
Lmln
239833
-236
SUH
Lmln
239833
-492
SUH
Lmln
239833
-481
SUH
Lmln
239833
-297
SUZ12
Lmln
239833
-391
SUZ12
Lmln
239833
-390
SUZ12
Lmln
239833
-324
SUZ12
Lmln
239833
-323
SUZ12
Lmln
239833
-311
SUZ12
Lmln
239833
-235
SUZ12
Lmln
239833
-176
SUZ12
Lmln
239833
97
SUZ12
Lmln
239833
113
T2EB
Lmln
239833
-459
T2EB
Lmln
239833
-398
TAF1
Lmln
239833
-654
TAF1
Lmln
239833
-361
TAF3
Lmln
239833
-794
TAF3
Lmln
239833
-475
TAF3
Lmln
239833
-433
TAF3
Lmln
239833
-324
TAF7L
Lmln
239833
-634
TAF7L
Lmln
239833
-258
TAF9B
Lmln
239833
-358
TBP
Lmln
239833
-459
TBP
Lmln
239833
-386
TBP
Lmln
239833
-285
TBP
Lmln
239833
-18
TBX3
Lmln
239833
-806
TBX3
Lmln
239833
-327
TBX3
Lmln
239833
127
TBX5
Lmln
239833
-374
TCF7
Lmln
239833
-323
TCF7
Lmln
239833
-286
TCF7
Lmln
239833
-114
TDG
Lmln
239833
-825
TEAD1
Lmln
239833
-904
TET1
Lmln
239833
-316
TF2B
Lmln
239833
-428
TF2B
Lmln
239833
-411
TF2B
Lmln
239833
-339
TF2B
Lmln
239833
-338
TF2B
Lmln
239833
-306
TF65
Lmln
239833
-177
TF65
Lmln
239833
-172
TF65
Lmln
239833
-165
TF65
Lmln
239833
-146
TF65
Lmln
239833
-136
TF7L2
Lmln
239833
-852
TF7L2
Lmln
239833
-751
TFAP4
Lmln
239833
-754
TFE2
Lmln
239833
-377
TFE2
Lmln
239833
-336
TFE2
Lmln
239833
-143
TFE2
Lmln
239833
-116
TGIF1
Lmln
239833
-415
THB
Lmln
239833
-364
THB
Lmln
239833
-151
THB
Lmln
239833
102
TIF1B
Lmln
239833
-545
TYY1
Lmln
239833
-438
TYY1
Lmln
239833
-275
UBF1
Lmln
239833
-603
USF1
Lmln
239833
-342
USF1
Lmln
239833
-329
USF1
Lmln
239833
-251
USF2
Lmln
239833
-923
USF2
Lmln
239833
-757
UTF1
Lmln
239833
-403
UTF1
Lmln
239833
-280
UTF1
Lmln
239833
-262
UTF1
Lmln
239833
190
WDR5
Lmln
239833
-538
WDR5
Lmln
239833
-161
WT1
Lmln
239833
59
ZFX
Lmln
239833
-34
ZKSC1
Lmln
239833
-804
SIN3A
Lmln
239833
-434.00
SIN3A
Lmln
239833
-360.00
SIN3A
Lmln
239833
-311.00
SIN3A
Lmln
239833
59.00
SIN3B
Lmln
239833
-18.00
SIR1
Lmln
239833
-298.00
SIR1
Lmln
239833
169.00
SIR6
Lmln
239833
-527.00
SIX1
Lmln
239833
-730.00
SMAD3
Lmln
239833
-353.00
SMAD3
Lmln
239833
-248.00
SMBT1
Lmln
239833
-272.00
SMC1A
Lmln
239833
-942.00
SMC3
Lmln
239833
-620.00
SMC3
Lmln
239833
-569.00
SMC3
Lmln
239833
-532.00
SMC3
Lmln
239833
-491.00
SMC3
Lmln
239833
149.00
SMCA4
Lmln
239833
-373.00
SOX17
Lmln
239833
-600.00
SOX17
Lmln
239833
-528.00
SOX2
Lmln
239833
-560.00
SOX2
Lmln
239833
-522.00
SOX2
Lmln
239833
-386.00
SOX2
Lmln
239833
-209.00
SPI1
Lmln
239833
-261.00
SPI1
Lmln
239833
-248.00
SPT5H
Lmln
239833
-980.00
SRF
Lmln
239833
-230.00
SRF
Lmln
239833
-198.00
STA5A
Lmln
239833
-428.00
STA5A
Lmln
239833
-108.00
STA5B
Lmln
239833
-620.00
STAT3
Lmln
239833
-859.00
STAT3
Lmln
239833
-691.00
STAT3
Lmln
239833
-608.00
STAT3
Lmln
239833
-499.00
STAT3
Lmln
239833
-410.00
STAT3
Lmln
239833
-407.00
STAT3
Lmln
239833
-304.00
STAT3
Lmln
239833
-296.00
STAT3
Lmln
239833
-228.00
STAT3
Lmln
239833
-227.00
STAT6
Lmln
239833
-236.00
SUH
Lmln
239833
-492.00
SUH
Lmln
239833
-297.00
SUZ12
Lmln
239833
113.00
TAF1
Lmln
239833
-654.00
TAF1
Lmln
239833
-361.00
TAF3
Lmln
239833
-324.00
TAF7L
Lmln
239833
-634.00
TAF7L
Lmln
239833
-258.00
TBP
Lmln
239833
-386.00
TBP
Lmln
239833
-285.00
TBP
Lmln
239833
-18.00
TBX3
Lmln
239833
-327.00
TBX5
Lmln
239833
-374.00
TCF7
Lmln
239833
-323.00
TCF7
Lmln
239833
-286.00
TCF7
Lmln
239833
-114.00
TET1
Lmln
239833
-316.00
TF65
Lmln
239833
-177.00
TF65
Lmln
239833
-172.00
TF65
Lmln
239833
-165.00
TF65
Lmln
239833
-146.00
TF65
Lmln
239833
-136.00
TFE2
Lmln
239833
-336.00
TFE2
Lmln
239833
-143.00
TFE2
Lmln
239833
-116.00
TYY1
Lmln
239833
-438.00
TYY1
Lmln
239833
-275.00
USF1
Lmln
239833
-251.00
UTF1
Lmln
239833
-280.00
UTF1
Lmln
239833
190.00
WDR5
Lmln
239833
-161.00
WT1
Lmln
239833
59.00
ZFX
Lmln
239833
-34.00
Additional Information about the Gene
Expression1
Allen Brain Atlas
BGEM
EMAGE
GeneNote
genepaint
GNF Symatlas
GENSAT
Expression2
AceView
HGNC Expression
UCSC
GEO
ArrayExpress
Cleanex
Function
AMIGO
MIPS
Panther
Uniport
Genecards
InterPro
IHOP
Gene Regulation
MicroRNA target
TRED
Pathways
Biocarta Pathways CGAP SAGE
KEGG Pathways
EBI
Sequences
NCBI
Ensembl
MGI Information
QTL
Harvester
Howdy
Interactions
MIMI
EBI
Nature-NCI
string
IHOP
Tools Links
Sequence Manipulation
Genes and Transcripts
Micoroarray Analysis
Literature Search
Protein
Databases
Functional Analysis
Transcription Factor Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
Target Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9