Transcription Factors and their targets
Search Term:
TF
TargetGene
TargetGeneID
Home
Gene List
TF list
Protocol
Contact
TF
Target
Gene ID
Distance From TSS
AICDA
Atpaf1
230649
-213.00
AICDA
Atpaf1
230649
-12.00
AP2A
Atpaf1
230649
-98.00
AP2A
Atpaf1
230649
-89.00
ATF4
Atpaf1
230649
-146.00
ATOH1
Atpaf1
230649
-24.00
BATF
Atpaf1
230649
-197.00
BATF
Atpaf1
230649
-182.00
BATF
Atpaf1
230649
-169.00
BATF
Atpaf1
230649
-160.00
BATF
Atpaf1
230649
-152.00
BATF
Atpaf1
230649
-138.00
BATF
Atpaf1
230649
-128.00
BATF
Atpaf1
230649
-123.00
BATF
Atpaf1
230649
-114.00
BATF
Atpaf1
230649
-109.00
BATF
Atpaf1
230649
-98.00
BATF
Atpaf1
230649
-94.00
BATF
Atpaf1
230649
6.00
BRCA1
Atpaf1
230649
-990.00
BRCA1
Atpaf1
230649
-790.00
BRCA1
Atpaf1
230649
-190.00
BRD4
Atpaf1
230649
-136.00
CBX3
Atpaf1
230649
-228.00
CDK9
Atpaf1
230649
-186.00
CEBPB
Atpaf1
230649
-149.00
CHD4
Atpaf1
230649
-368.00
CHD4
Atpaf1
230649
-192.00
CHD4
Atpaf1
230649
-174.00
CHD4
Atpaf1
230649
-142.00
CHD4
Atpaf1
230649
-57.00
CHD4
Atpaf1
230649
90.00
CREM
Atpaf1
230649
-201.00
CTCF
Atpaf1
230649
-228.00
CTCF
Atpaf1
230649
-177.00
CTCF
Atpaf1
230649
-152.00
CTCF
Atpaf1
230649
-103.00
CTCF
Atpaf1
230649
-98.00
CTCF
Atpaf1
230649
-44.00
CTCF
Atpaf1
230649
-38.00
CTCF
Atpaf1
230649
-35.00
CTCF
Atpaf1
230649
-12.00
CTCF
Atpaf1
230649
-3.00
CTCF
Atpaf1
230649
0.00
CTCF
Atpaf1
230649
11.00
CTCF
Atpaf1
230649
26.00
CTCF
Atpaf1
230649
36.00
CTCF
Atpaf1
230649
40.00
CTCF
Atpaf1
230649
45.00
CTCF
Atpaf1
230649
47.00
CTCF
Atpaf1
230649
67.00
CTCF
Atpaf1
230649
81.00
CTCF
Atpaf1
230649
83.00
CTCFL
Atpaf1
230649
-154.00
CXXC1
Atpaf1
230649
-194.00
DPY30
Atpaf1
230649
-402.00
E2F1
Atpaf1
230649
-231.00
E2F2
Atpaf1
230649
-680.00
E2F3
Atpaf1
230649
-212.00
E2F3
Atpaf1
230649
-132.00
E2F4
Atpaf1
230649
-69.00
EGR2
Atpaf1
230649
-282.00
EGR2
Atpaf1
230649
-237.00
EHMT2
Atpaf1
230649
-702.00
EP300
Atpaf1
230649
-713.00
EP300
Atpaf1
230649
-221.00
EP300
Atpaf1
230649
-217.00
EP300
Atpaf1
230649
-203.00
EP300
Atpaf1
230649
-195.00
EP300
Atpaf1
230649
-189.00
EP300
Atpaf1
230649
-180.00
EP300
Atpaf1
230649
-163.00
EP300
Atpaf1
230649
-152.00
EP300
Atpaf1
230649
-151.00
EP300
Atpaf1
230649
-150.00
EP300
Atpaf1
230649
-149.00
EP300
Atpaf1
230649
-145.00
EP300
Atpaf1
230649
-138.00
EP300
Atpaf1
230649
-118.00
EP300
Atpaf1
230649
-110.00
EP300
Atpaf1
230649
-101.00
EP300
Atpaf1
230649
-96.00
EP300
Atpaf1
230649
-94.00
EP300
Atpaf1
230649
-69.00
EP300
Atpaf1
230649
-56.00
EP300
Atpaf1
230649
36.00
EP300
Atpaf1
230649
194.00
ERG
Atpaf1
230649
148.00
ESR1
Atpaf1
230649
-234.00
ESR1
Atpaf1
230649
-28.00
ETV6
Atpaf1
230649
-122.00
ETV6
Atpaf1
230649
-35.00
FOSL2
Atpaf1
230649
-106.00
FOXA2
Atpaf1
230649
-284.00
FOXA2
Atpaf1
230649
104.00
FOXA2
Atpaf1
230649
132.00
FOXO1
Atpaf1
230649
-274.00
FOXP3
Atpaf1
230649
-72.00
GATA1
Atpaf1
230649
-75.00
GATA1
Atpaf1
230649
30.00
GATA3
Atpaf1
230649
-170.00
GATA4
Atpaf1
230649
-111.00
GATA4
Atpaf1
230649
-75.00
GCR
Atpaf1
230649
-222.00
HELLS
Atpaf1
230649
-297.00
HIF1A
Atpaf1
230649
-104.00
IKZF1
Atpaf1
230649
-299.00
IKZF1
Atpaf1
230649
-254.00
IKZF1
Atpaf1
230649
-240.00
IKZF1
Atpaf1
230649
-228.00
IKZF1
Atpaf1
230649
-224.00
IKZF1
Atpaf1
230649
127.00
IKZF1
Atpaf1
230649
172.00
IRF1
Atpaf1
230649
47.00
IRF3
Atpaf1
230649
-61.00
IRF4
Atpaf1
230649
-307.00
IRF4
Atpaf1
230649
-284.00
IRF4
Atpaf1
230649
-253.00
IRF4
Atpaf1
230649
-241.00
IRF4
Atpaf1
230649
-232.00
IRF4
Atpaf1
230649
-219.00
IRF4
Atpaf1
230649
-202.00
IRF4
Atpaf1
230649
-193.00
IRF4
Atpaf1
230649
-190.00
IRF4
Atpaf1
230649
-184.00
IRF4
Atpaf1
230649
-178.00
IRF4
Atpaf1
230649
-172.00
IRF4
Atpaf1
230649
-159.00
IRF4
Atpaf1
230649
-156.00
IRF4
Atpaf1
230649
-148.00
IRF4
Atpaf1
230649
-133.00
IRF4
Atpaf1
230649
-125.00
IRF4
Atpaf1
230649
-113.00
IRF4
Atpaf1
230649
-109.00
IRF4
Atpaf1
230649
-102.00
IRF4
Atpaf1
230649
-99.00
IRF4
Atpaf1
230649
-95.00
IRF4
Atpaf1
230649
-87.00
JUN
Atpaf1
230649
-203.00
JUND
Atpaf1
230649
-191.00
KAT8
Atpaf1
230649
-781.00
KAT8
Atpaf1
230649
-114.00
KAT8
Atpaf1
230649
-95.00
KDM1A
Atpaf1
230649
-130.00
KDM2A
Atpaf1
230649
-131.00
KDM2B
Atpaf1
230649
-265.00
KDM2B
Atpaf1
230649
-246.00
KDM2B
Atpaf1
230649
-244.00
KDM2B
Atpaf1
230649
-230.00
KDM2B
Atpaf1
230649
-18.00
KDM4B
Atpaf1
230649
-330.00
KDM4C
Atpaf1
230649
-131.00
KDM4C
Atpaf1
230649
-58.00
KDM6A
Atpaf1
230649
-390.00
KDM6B
Atpaf1
230649
-128.00
KMT2B
Atpaf1
230649
-337.00
KMT2C
Atpaf1
230649
-204.00
KMT2C
Atpaf1
230649
-138.00
KMT2C
Atpaf1
230649
-125.00
KMT2D
Atpaf1
230649
-185.00
KMT2D
Atpaf1
230649
-75.00
KMT2D
Atpaf1
230649
-65.00
MAF
Atpaf1
230649
-167.00
MAF
Atpaf1
230649
-113.00
MAX
Atpaf1
230649
0.00
MED1
Atpaf1
230649
-288.00
MED1
Atpaf1
230649
-240.00
MED1
Atpaf1
230649
-154.00
MED1
Atpaf1
230649
-142.00
MED1
Atpaf1
230649
-48.00
MEIS1
Atpaf1
230649
-137.00
MYBA
Atpaf1
230649
-137.00
MYC
Atpaf1
230649
-496.00
MYC
Atpaf1
230649
-347.00
MYC
Atpaf1
230649
-323.00
MYOD1
Atpaf1
230649
-172.00
MYOD1
Atpaf1
230649
-8.00
MYOG
Atpaf1
230649
-202.00
NANOG
Atpaf1
230649
-354.00
NANOG
Atpaf1
230649
-290.00
NBN
Atpaf1
230649
-23.00
NCOR1
Atpaf1
230649
-291.00
NDF2
Atpaf1
230649
-298.00
NELFB
Atpaf1
230649
-202.00
NIPBL
Atpaf1
230649
-325.00
NKX61
Atpaf1
230649
-173.00
NR0B1
Atpaf1
230649
34.00
NR1D2
Atpaf1
230649
-118.00
NR6A1
Atpaf1
230649
-294.00
NR6A1
Atpaf1
230649
-229.00
P53
Atpaf1
230649
-117.00
PAXI1
Atpaf1
230649
26.00
PEBB
Atpaf1
230649
-141.00
PO5F1
Atpaf1
230649
-496.00
PO5F1
Atpaf1
230649
-422.00
PO5F1
Atpaf1
230649
-321.00
PO5F1
Atpaf1
230649
-303.00
PO5F1
Atpaf1
230649
-265.00
PO5F1
Atpaf1
230649
-238.00
PO5F1
Atpaf1
230649
-221.00
PO5F1
Atpaf1
230649
-141.00
PO5F1
Atpaf1
230649
-112.00
PO5F1
Atpaf1
230649
-100.00
PO5F1
Atpaf1
230649
-95.00
PO5F1
Atpaf1
230649
-84.00
PO5F1
Atpaf1
230649
-79.00
PO5F1
Atpaf1
230649
-59.00
PPARG
Atpaf1
230649
-215.00
PPARG
Atpaf1
230649
-147.00
PPARG
Atpaf1
230649
-116.00
PPARG
Atpaf1
230649
-86.00
RARA
Atpaf1
230649
-381.00
RARA
Atpaf1
230649
-285.00
RARA
Atpaf1
230649
-221.00
RARA
Atpaf1
230649
-138.00
RARB
Atpaf1
230649
-283.00
RBBP5
Atpaf1
230649
-215.00
RBPJL
Atpaf1
230649
-140.00
RBPJL
Atpaf1
230649
-132.00
RFX1
Atpaf1
230649
-44.00
RING1
Atpaf1
230649
-571.00
RING2
Atpaf1
230649
-571.00
RING2
Atpaf1
230649
-236.00
RING2
Atpaf1
230649
-222.00
RORG
Atpaf1
230649
-143.00
RPB1
Atpaf1
230649
-414.00
RPB1
Atpaf1
230649
-351.00
RPB1
Atpaf1
230649
-161.00
RUNX3
Atpaf1
230649
-284.00
RYBP
Atpaf1
230649
-408.00
RUNX1
Atpaf1
230649
-219
RUNX1
Atpaf1
230649
-140
RUNX2
Atpaf1
230649
-317
RUNX2
Atpaf1
230649
-306
RUNX2
Atpaf1
230649
-260
RUNX3
Atpaf1
230649
-284
RYBP
Atpaf1
230649
-408
SALL4
Atpaf1
230649
-571
SIN3A
Atpaf1
230649
-471
SIN3A
Atpaf1
230649
-314
SIN3A
Atpaf1
230649
-143
SIN3A
Atpaf1
230649
-74
SIN3A
Atpaf1
230649
13
SIR1
Atpaf1
230649
-137
SIR1
Atpaf1
230649
-114
SIR6
Atpaf1
230649
-403
SMAD3
Atpaf1
230649
-79
SMBT1
Atpaf1
230649
-112
SMC1A
Atpaf1
230649
-778
SMC1A
Atpaf1
230649
-637
SMC1A
Atpaf1
230649
-93
SMC3
Atpaf1
230649
-419
SMC3
Atpaf1
230649
-372
SMC5
Atpaf1
230649
-790
SMCA4
Atpaf1
230649
-350
SMCA4
Atpaf1
230649
-325
SMCA4
Atpaf1
230649
-260
SMCA4
Atpaf1
230649
-255
SMCA4
Atpaf1
230649
-238
SMCA4
Atpaf1
230649
-199
SMCA4
Atpaf1
230649
-194
SMCA5
Atpaf1
230649
-229
SMCA5
Atpaf1
230649
-227
SOX17
Atpaf1
230649
-854
SOX17
Atpaf1
230649
-261
SOX17
Atpaf1
230649
-81
SOX17
Atpaf1
230649
-32
SOX2
Atpaf1
230649
-496
SOX2
Atpaf1
230649
-51
SOX4
Atpaf1
230649
-354
SPI1
Atpaf1
230649
-300
SPI1
Atpaf1
230649
-196
SPI1
Atpaf1
230649
-165
SPI1
Atpaf1
230649
-162
SPI1
Atpaf1
230649
-127
SPI1
Atpaf1
230649
-90
SPT5H
Atpaf1
230649
-371
SPT5H
Atpaf1
230649
-270
SPT5H
Atpaf1
230649
-248
SPT5H
Atpaf1
230649
-188
SRF
Atpaf1
230649
-173
SRF
Atpaf1
230649
-114
STA5B
Atpaf1
230649
-303
STAT1
Atpaf1
230649
-483
STAT1
Atpaf1
230649
-256
STAT1
Atpaf1
230649
-103
STAT1
Atpaf1
230649
-62
STAT2
Atpaf1
230649
26
STAT3
Atpaf1
230649
-146
STAT3
Atpaf1
230649
-133
STAT3
Atpaf1
230649
-131
STAT3
Atpaf1
230649
-124
STAT3
Atpaf1
230649
-85
STAT3
Atpaf1
230649
-52
SUZ12
Atpaf1
230649
-290
SUZ12
Atpaf1
230649
-220
SUZ12
Atpaf1
230649
-213
SUZ12
Atpaf1
230649
-209
SUZ12
Atpaf1
230649
-207
SUZ12
Atpaf1
230649
-165
SUZ12
Atpaf1
230649
-164
SUZ12
Atpaf1
230649
-161
SUZ12
Atpaf1
230649
-154
SUZ12
Atpaf1
230649
-136
SUZ12
Atpaf1
230649
14
SUZ12
Atpaf1
230649
179
T2EB
Atpaf1
230649
-149
TAF3
Atpaf1
230649
-270
TAF3
Atpaf1
230649
-269
TAF3
Atpaf1
230649
-249
TAF7L
Atpaf1
230649
-211
TAF7L
Atpaf1
230649
-83
TBP
Atpaf1
230649
-266
TBP
Atpaf1
230649
-259
TBP
Atpaf1
230649
-256
TBP
Atpaf1
230649
-124
TBX19
Atpaf1
230649
-827
TBX5
Atpaf1
230649
-191
TCF7
Atpaf1
230649
-93
TDG
Atpaf1
230649
-487
TET1
Atpaf1
230649
-187
TET1
Atpaf1
230649
-180
TET1
Atpaf1
230649
-141
TET1
Atpaf1
230649
-133
TF2B
Atpaf1
230649
-248
TF2B
Atpaf1
230649
-238
TF2B
Atpaf1
230649
-186
TF2B
Atpaf1
230649
-62
TF65
Atpaf1
230649
-95
TF65
Atpaf1
230649
-84
TF65
Atpaf1
230649
-60
TF7L2
Atpaf1
230649
-357
TFAP4
Atpaf1
230649
-278
TFE2
Atpaf1
230649
-29
TIF1B
Atpaf1
230649
-341
TIF1B
Atpaf1
230649
-339
TOP2A
Atpaf1
230649
-512
TYY1
Atpaf1
230649
-287
TYY1
Atpaf1
230649
-161
UBF1
Atpaf1
230649
-519
UBF1
Atpaf1
230649
-240
UTF1
Atpaf1
230649
-357
UTF1
Atpaf1
230649
-254
UTF1
Atpaf1
230649
-210
WDR5
Atpaf1
230649
-490
WDR5
Atpaf1
230649
31
WT1
Atpaf1
230649
-293
WT1
Atpaf1
230649
-3
ZBT17
Atpaf1
230649
-240
ZBT17
Atpaf1
230649
-234
ZBT17
Atpaf1
230649
-66
ZFX
Atpaf1
230649
-269
ZKSC1
Atpaf1
230649
-305
ZMIZ1
Atpaf1
230649
-335
SALL4
Atpaf1
230649
-571.00
SIN3A
Atpaf1
230649
-143.00
SIN3A
Atpaf1
230649
13.00
SIR1
Atpaf1
230649
-137.00
SIR1
Atpaf1
230649
-114.00
SMAD3
Atpaf1
230649
-79.00
SMBT1
Atpaf1
230649
-112.00
SMC1A
Atpaf1
230649
-778.00
SMC1A
Atpaf1
230649
-637.00
SMC1A
Atpaf1
230649
-93.00
SMC3
Atpaf1
230649
-419.00
SMC5
Atpaf1
230649
-790.00
SMCA4
Atpaf1
230649
-255.00
SMCA4
Atpaf1
230649
-238.00
SMCA5
Atpaf1
230649
-229.00
SMCA5
Atpaf1
230649
-227.00
SOX17
Atpaf1
230649
-854.00
SOX17
Atpaf1
230649
-261.00
SOX17
Atpaf1
230649
-81.00
SOX17
Atpaf1
230649
-32.00
SOX2
Atpaf1
230649
-496.00
SPI1
Atpaf1
230649
-300.00
SPI1
Atpaf1
230649
-165.00
SPI1
Atpaf1
230649
-162.00
SPI1
Atpaf1
230649
-127.00
SPT5H
Atpaf1
230649
-371.00
SPT5H
Atpaf1
230649
-270.00
SPT5H
Atpaf1
230649
-248.00
SPT5H
Atpaf1
230649
-188.00
SRF
Atpaf1
230649
-173.00
SRF
Atpaf1
230649
-114.00
STA5B
Atpaf1
230649
-303.00
STAT1
Atpaf1
230649
-483.00
STAT1
Atpaf1
230649
-256.00
STAT1
Atpaf1
230649
-103.00
STAT2
Atpaf1
230649
26.00
STAT3
Atpaf1
230649
-146.00
STAT3
Atpaf1
230649
-133.00
STAT3
Atpaf1
230649
-131.00
STAT3
Atpaf1
230649
-124.00
STAT3
Atpaf1
230649
-85.00
STAT3
Atpaf1
230649
-52.00
SUZ12
Atpaf1
230649
-290.00
SUZ12
Atpaf1
230649
-213.00
TAF3
Atpaf1
230649
-249.00
TAF7L
Atpaf1
230649
-211.00
TAF7L
Atpaf1
230649
-83.00
TBP
Atpaf1
230649
-266.00
TBP
Atpaf1
230649
-259.00
TBP
Atpaf1
230649
-124.00
TBX5
Atpaf1
230649
-191.00
TCF7
Atpaf1
230649
-93.00
TET1
Atpaf1
230649
-187.00
TET1
Atpaf1
230649
-180.00
TET1
Atpaf1
230649
-141.00
TET1
Atpaf1
230649
-133.00
TF65
Atpaf1
230649
-95.00
TF65
Atpaf1
230649
-84.00
TF65
Atpaf1
230649
-60.00
TOP2A
Atpaf1
230649
-512.00
TYY1
Atpaf1
230649
-287.00
TYY1
Atpaf1
230649
-161.00
UTF1
Atpaf1
230649
-210.00
WDR5
Atpaf1
230649
31.00
ZFX
Atpaf1
230649
-269.00
Additional Information about the Gene
Expression1
Allen Brain Atlas
BGEM
EMAGE
GeneNote
genepaint
GNF Symatlas
GENSAT
Expression2
AceView
HGNC Expression
UCSC
GEO
ArrayExpress
Cleanex
Function
AMIGO
MIPS
Panther
Uniport
Genecards
InterPro
IHOP
Gene Regulation
MicroRNA target
TRED
Pathways
Biocarta Pathways CGAP SAGE
KEGG Pathways
EBI
Sequences
NCBI
Ensembl
MGI Information
QTL
Harvester
Howdy
Interactions
MIMI
EBI
Nature-NCI
string
IHOP
Tools Links
Sequence Manipulation
Genes and Transcripts
Micoroarray Analysis
Literature Search
Protein
Databases
Functional Analysis
Transcription Factor Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
Target Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9