Transcription Factors and their targets
Search Term:
TF
TargetGene
TargetGeneID
Home
Gene List
TF list
Protocol
Contact
TF
Target
Gene ID
Distance From TSS
AICDA
Grina
66168
61.00
AP2A
Grina
66168
-43.00
AP2A
Grina
66168
-24.00
AP2C
Grina
66168
-683.00
ATF4
Grina
66168
-79.00
BAP1
Grina
66168
-417.00
BATF
Grina
66168
-332.00
BATF
Grina
66168
-58.00
BATF
Grina
66168
-34.00
BATF
Grina
66168
3.00
BCL6
Grina
66168
-605.00
BCL6
Grina
66168
-274.00
BCL6
Grina
66168
-58.00
CBP
Grina
66168
189.00
CCND1
Grina
66168
-197.00
CDK8
Grina
66168
-126.00
CDK8
Grina
66168
179.00
CDK9
Grina
66168
-20.00
CDK9
Grina
66168
-1.00
CEBPB
Grina
66168
-650.00
CEBPB
Grina
66168
-73.00
CEBPB
Grina
66168
-41.00
CHD4
Grina
66168
-67.00
CHD4
Grina
66168
141.00
CHD4
Grina
66168
185.00
COE1
Grina
66168
-77.00
CTCF
Grina
66168
-150.00
CTCF
Grina
66168
-54.00
CTCF
Grina
66168
-49.00
CTCF
Grina
66168
-26.00
CTCF
Grina
66168
134.00
DPY30
Grina
66168
-62.00
E2F3
Grina
66168
-140.00
E2F4
Grina
66168
-197.00
EGR2
Grina
66168
26.00
EGR2
Grina
66168
74.00
EGR2
Grina
66168
92.00
EP300
Grina
66168
-313.00
EP300
Grina
66168
-305.00
EP300
Grina
66168
-256.00
EP300
Grina
66168
-236.00
EP300
Grina
66168
-176.00
EP300
Grina
66168
-98.00
EP300
Grina
66168
-51.00
EP400
Grina
66168
-237.00
ESR1
Grina
66168
24.00
ESR1
Grina
66168
36.00
EZH1
Grina
66168
-197.00
EZH2
Grina
66168
-328.00
EZH2
Grina
66168
-197.00
EZH2
Grina
66168
-35.00
EZH2
Grina
66168
-7.00
EZH2
Grina
66168
21.00
FOXA1
Grina
66168
-71.00
FOXA2
Grina
66168
-56.00
FOXA2
Grina
66168
2.00
HCFC1
Grina
66168
-428.00
HCFC1
Grina
66168
-117.00
HELLS
Grina
66168
-322.00
HELLS
Grina
66168
-85.00
HEXI1
Grina
66168
13.00
HXB4
Grina
66168
-577.00
IKZF1
Grina
66168
-318.00
IKZF1
Grina
66168
-90.00
IKZF1
Grina
66168
-74.00
IKZF1
Grina
66168
125.00
IRF4
Grina
66168
-569.00
IRF4
Grina
66168
-557.00
IRF4
Grina
66168
-49.00
IRF4
Grina
66168
-45.00
JUN
Grina
66168
-49.00
JUND
Grina
66168
-65.00
KAT8
Grina
66168
-13.00
KDM1A
Grina
66168
-41.00
KDM1A
Grina
66168
27.00
KDM2A
Grina
66168
-9.00
KDM2B
Grina
66168
-295.00
KDM2B
Grina
66168
-87.00
KDM2B
Grina
66168
-86.00
KDM2B
Grina
66168
-59.00
KDM2B
Grina
66168
-33.00
KDM2B
Grina
66168
50.00
KDM4C
Grina
66168
-845.00
KDM4C
Grina
66168
14.00
KDM6A
Grina
66168
-638.00
KDM6A
Grina
66168
-38.00
KDM6B
Grina
66168
-15.00
KLF1
Grina
66168
-164.00
KLF3
Grina
66168
-411.00
KLF4
Grina
66168
-820.00
KLF4
Grina
66168
-266.00
KMT2B
Grina
66168
-690.00
KMT2B
Grina
66168
-64.00
KMT2C
Grina
66168
-102.00
KMT2C
Grina
66168
-34.00
KMT2C
Grina
66168
151.00
KMT2D
Grina
66168
-261.00
KMT2D
Grina
66168
-94.00
KMT2D
Grina
66168
-46.00
KMT2D
Grina
66168
144.00
MAF
Grina
66168
-348.00
MAF
Grina
66168
-1.00
MED1
Grina
66168
-669.00
MED1
Grina
66168
-117.00
MED1
Grina
66168
-66.00
MED1
Grina
66168
-28.00
MEIS1
Grina
66168
-94.00
MYBA
Grina
66168
-76.00
MYOD1
Grina
66168
-378.00
MYOD1
Grina
66168
-241.00
MYOD1
Grina
66168
-49.00
MYOD1
Grina
66168
-22.00
MYOG
Grina
66168
-296.00
MYOG
Grina
66168
-89.00
MYOG
Grina
66168
-53.00
NANOG
Grina
66168
-138.00
NBN
Grina
66168
191.00
NCOA2
Grina
66168
-9.00
NELFB
Grina
66168
-85.00
NIPBL
Grina
66168
-145.00
NKX61
Grina
66168
-109.00
NR1D1
Grina
66168
-72.00
OGT1
Grina
66168
-74.00
P53
Grina
66168
-111.00
PAX5
Grina
66168
-31.00
PO5F1
Grina
66168
-228.00
PO5F1
Grina
66168
-69.00
PO5F1
Grina
66168
-47.00
PO5F1
Grina
66168
-32.00
PPARG
Grina
66168
-89.00
PPARG
Grina
66168
-67.00
PPARG
Grina
66168
-22.00
PPARG
Grina
66168
51.00
PRGR
Grina
66168
-82.00
RARA
Grina
66168
-350.00
RARA
Grina
66168
-132.00
RARA
Grina
66168
-104.00
RING2
Grina
66168
-197.00
RING2
Grina
66168
-48.00
RING2
Grina
66168
128.00
RORG
Grina
66168
46.00
RPB1
Grina
66168
-897.00
RPB1
Grina
66168
-467.00
RPB1
Grina
66168
-375.00
RUNX3
Grina
66168
-212.00
RXRA
Grina
66168
-354.00
RXRA
Grina
66168
-295.00
RXRA
Grina
66168
-60.00
RYBP
Grina
66168
-197.00
RUNX1
Grina
66168
-171
RUNX1
Grina
66168
9
RUNX2
Grina
66168
-304
RUNX2
Grina
66168
-179
RUNX3
Grina
66168
-212
RXRA
Grina
66168
-354
RXRA
Grina
66168
-295
RXRA
Grina
66168
-60
RYBP
Grina
66168
-197
SIN3A
Grina
66168
-419
SIN3A
Grina
66168
-297
SIN3A
Grina
66168
-93
SIN3A
Grina
66168
-85
SIN3A
Grina
66168
-82
SIN3A
Grina
66168
-7
SIN3B
Grina
66168
-197
SIR6
Grina
66168
-35
SMBT1
Grina
66168
20
SMC1A
Grina
66168
-115
SMC3
Grina
66168
-60
SMC3
Grina
66168
46
SMCA4
Grina
66168
-93
SMCA4
Grina
66168
-48
SMCA4
Grina
66168
-27
SMCA4
Grina
66168
176
SMCA5
Grina
66168
-58
SOX17
Grina
66168
-441
SOX17
Grina
66168
-106
SOX2
Grina
66168
-76
SPIB
Grina
66168
-124
SPT5H
Grina
66168
-229
SPT5H
Grina
66168
-227
SPT5H
Grina
66168
-75
SPT5H
Grina
66168
-63
SPT6H
Grina
66168
-838
SRBP2
Grina
66168
-69
SRF
Grina
66168
-25
STA5A
Grina
66168
-166
STA5A
Grina
66168
-94
STA5B
Grina
66168
-166
STA5B
Grina
66168
-73
STAT2
Grina
66168
87
STAT3
Grina
66168
-33
SUZ12
Grina
66168
-238
SUZ12
Grina
66168
-100
SUZ12
Grina
66168
-77
SUZ12
Grina
66168
-58
SUZ12
Grina
66168
-57
SUZ12
Grina
66168
-54
SUZ12
Grina
66168
-50
SUZ12
Grina
66168
-47
SUZ12
Grina
66168
-43
SUZ12
Grina
66168
-35
SUZ12
Grina
66168
-23
SUZ12
Grina
66168
-22
SUZ12
Grina
66168
-17
SUZ12
Grina
66168
0
SUZ12
Grina
66168
41
SUZ12
Grina
66168
145
SUZ12
Grina
66168
166
SUZ12
Grina
66168
190
T2EB
Grina
66168
-108
T2EB
Grina
66168
-53
TAF3
Grina
66168
-355
TAF3
Grina
66168
-340
TAF3
Grina
66168
-70
TAF3
Grina
66168
-64
TAF7L
Grina
66168
-44
TAF7L
Grina
66168
-10
TBP
Grina
66168
-382
TBP
Grina
66168
-264
TBP
Grina
66168
-73
TBP
Grina
66168
-70
TBX19
Grina
66168
-959
TBX3
Grina
66168
-404
TBX5
Grina
66168
-67
TCF7
Grina
66168
-66
TCF7
Grina
66168
120
TDG
Grina
66168
-679
TEAD4
Grina
66168
-197
TET1
Grina
66168
-20
TF2B
Grina
66168
-108
TF2B
Grina
66168
-100
TF2B
Grina
66168
-80
TF2B
Grina
66168
-77
TF65
Grina
66168
-594
TF65
Grina
66168
-55
TF65
Grina
66168
26
TFAP4
Grina
66168
-737
TFAP4
Grina
66168
-95
TFE2
Grina
66168
-197
TGIF1
Grina
66168
-205
THB
Grina
66168
-28
TIF1B
Grina
66168
-345
TOP2A
Grina
66168
-139
UBF1
Grina
66168
-311
UTF1
Grina
66168
-818
UTF1
Grina
66168
-76
UTF1
Grina
66168
-38
WDR5
Grina
66168
-107
WT1
Grina
66168
-197
ZBT17
Grina
66168
-25
ZFX
Grina
66168
-97
ZMIZ1
Grina
66168
-352
SIN3A
Grina
66168
-93.00
SIN3A
Grina
66168
-7.00
SIN3B
Grina
66168
-197.00
SMBT1
Grina
66168
20.00
SMC1A
Grina
66168
-115.00
SMC3
Grina
66168
-60.00
SMCA4
Grina
66168
-93.00
SMCA5
Grina
66168
-58.00
SOX17
Grina
66168
-441.00
SOX17
Grina
66168
-106.00
SPT5H
Grina
66168
-229.00
SPT5H
Grina
66168
-227.00
SPT5H
Grina
66168
-75.00
SPT5H
Grina
66168
-63.00
SPT6H
Grina
66168
-838.00
SRBP2
Grina
66168
-69.00
SRF
Grina
66168
-25.00
STA5A
Grina
66168
-166.00
STA5A
Grina
66168
-94.00
STA5B
Grina
66168
-166.00
STA5B
Grina
66168
-73.00
STAT2
Grina
66168
87.00
STAT3
Grina
66168
-33.00
SUZ12
Grina
66168
-238.00
SUZ12
Grina
66168
0.00
SUZ12
Grina
66168
41.00
SUZ12
Grina
66168
145.00
TAF3
Grina
66168
-64.00
TAF7L
Grina
66168
-44.00
TAF7L
Grina
66168
-10.00
TBP
Grina
66168
-264.00
TBP
Grina
66168
-70.00
TBX5
Grina
66168
-67.00
TCF7
Grina
66168
-66.00
TCF7
Grina
66168
120.00
TEAD4
Grina
66168
-197.00
TET1
Grina
66168
-20.00
TF65
Grina
66168
-594.00
TF65
Grina
66168
-55.00
TF65
Grina
66168
26.00
TFE2
Grina
66168
-197.00
TOP2A
Grina
66168
-139.00
WT1
Grina
66168
-197.00
ZFX
Grina
66168
-97.00
Additional Information about the Gene
Expression1
Allen Brain Atlas
BGEM
EMAGE
GeneNote
genepaint
GNF Symatlas
GENSAT
Expression2
AceView
HGNC Expression
UCSC
GEO
ArrayExpress
Cleanex
Function
AMIGO
MIPS
Panther
Uniport
Genecards
InterPro
IHOP
Gene Regulation
MicroRNA target
TRED
Pathways
Biocarta Pathways CGAP SAGE
KEGG Pathways
EBI
Sequences
NCBI
Ensembl
MGI Information
QTL
Harvester
Howdy
Interactions
MIMI
EBI
Nature-NCI
string
IHOP
Tools Links
Sequence Manipulation
Genes and Transcripts
Micoroarray Analysis
Literature Search
Protein
Databases
Functional Analysis
Transcription Factor Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
Target Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9