Transcription Factors and their targets
Search Term:
TF
TargetGene
TargetGeneID
Home
Gene List
TF list
Protocol
Contact
TF
Target
Gene ID
Distance From TSS
AHR
Pold2
18972
-314.00
AP2A
Pold2
18972
-164.00
ASH2L
Pold2
18972
-246.00
ATF4
Pold2
18972
96.00
BACH2
Pold2
18972
61.00
BATF
Pold2
18972
-376.00
BATF
Pold2
18972
-221.00
BATF
Pold2
18972
-193.00
BATF
Pold2
18972
-132.00
BATF
Pold2
18972
-126.00
BATF
Pold2
18972
-71.00
BATF
Pold2
18972
-45.00
BATF
Pold2
18972
-36.00
BATF
Pold2
18972
12.00
BMAL1
Pold2
18972
-22.00
BRCA1
Pold2
18972
26.00
BRD4
Pold2
18972
70.00
CBP
Pold2
18972
-25.00
CBP
Pold2
18972
19.00
CBX3
Pold2
18972
-145.00
CBX8
Pold2
18972
-121.00
CDK8
Pold2
18972
-29.00
CDK9
Pold2
18972
-97.00
CEBPA
Pold2
18972
-989.00
CEBPB
Pold2
18972
-1000.00
CEBPB
Pold2
18972
-991.00
CEBPB
Pold2
18972
-990.00
CEBPB
Pold2
18972
-978.00
CEBPB
Pold2
18972
-385.00
CHD4
Pold2
18972
-827.00
CLOCK
Pold2
18972
-23.00
CREB1
Pold2
18972
6.00
CREB1
Pold2
18972
40.00
CRY1
Pold2
18972
15.00
CRY2
Pold2
18972
85.00
CTCF
Pold2
18972
-999.00
CTR9
Pold2
18972
-204.00
DMC1
Pold2
18972
-282.00
E2F1
Pold2
18972
-581.00
E2F4
Pold2
18972
66.00
E2F4
Pold2
18972
170.00
ELF1
Pold2
18972
-23.00
EP300
Pold2
18972
-202.00
EP300
Pold2
18972
-142.00
EP300
Pold2
18972
-130.00
EP300
Pold2
18972
-129.00
EP300
Pold2
18972
-109.00
EP300
Pold2
18972
-104.00
EP300
Pold2
18972
-97.00
EP300
Pold2
18972
-72.00
EP300
Pold2
18972
-45.00
EP300
Pold2
18972
-22.00
EP300
Pold2
18972
-20.00
EP300
Pold2
18972
-4.00
EP300
Pold2
18972
-2.00
EP300
Pold2
18972
64.00
EP300
Pold2
18972
82.00
EP300
Pold2
18972
94.00
EP300
Pold2
18972
144.00
EP300
Pold2
18972
165.00
EP300
Pold2
18972
172.00
EP300
Pold2
18972
175.00
EP300
Pold2
18972
176.00
EP300
Pold2
18972
179.00
EP300
Pold2
18972
186.00
ERG
Pold2
18972
81.00
ERG
Pold2
18972
91.00
ERG
Pold2
18972
93.00
ESR1
Pold2
18972
27.00
ETS1
Pold2
18972
161.00
FLI1
Pold2
18972
-174.00
FOSL2
Pold2
18972
-313.00
FOSL2
Pold2
18972
-41.00
FOSL2
Pold2
18972
0.00
FOXA1
Pold2
18972
-693.00
FOXA1
Pold2
18972
-112.00
FOXO1
Pold2
18972
51.00
FOXP3
Pold2
18972
-84.00
FOXP3
Pold2
18972
-76.00
GATA4
Pold2
18972
128.00
HIF1A
Pold2
18972
17.00
HXB4
Pold2
18972
-116.00
HXB4
Pold2
18972
22.00
IKZF1
Pold2
18972
-253.00
IKZF1
Pold2
18972
-94.00
IKZF1
Pold2
18972
-89.00
IKZF1
Pold2
18972
-61.00
IKZF1
Pold2
18972
-53.00
IKZF1
Pold2
18972
-3.00
IKZF1
Pold2
18972
8.00
IKZF1
Pold2
18972
61.00
IRF4
Pold2
18972
-621.00
IRF4
Pold2
18972
-394.00
IRF4
Pold2
18972
-328.00
IRF4
Pold2
18972
-159.00
IRF4
Pold2
18972
-154.00
IRF4
Pold2
18972
-131.00
IRF4
Pold2
18972
-118.00
IRF4
Pold2
18972
-108.00
IRF4
Pold2
18972
-87.00
IRF4
Pold2
18972
-82.00
IRF4
Pold2
18972
-71.00
IRF4
Pold2
18972
-39.00
IRF4
Pold2
18972
-5.00
IRF4
Pold2
18972
109.00
JUN
Pold2
18972
-125.00
JUND
Pold2
18972
-110.00
JUND
Pold2
18972
75.00
KAT8
Pold2
18972
-686.00
KAT8
Pold2
18972
72.00
KDM1A
Pold2
18972
60.00
KDM2A
Pold2
18972
108.00
KDM2B
Pold2
18972
-238.00
KDM6B
Pold2
18972
101.00
KLF1
Pold2
18972
155.00
KLF3
Pold2
18972
161.00
KMT2B
Pold2
18972
196.00
KMT2C
Pold2
18972
-314.00
KMT2D
Pold2
18972
-172.00
KMT2D
Pold2
18972
86.00
KMT2D
Pold2
18972
98.00
KMT2D
Pold2
18972
106.00
LDB1
Pold2
18972
-156.00
MAF
Pold2
18972
-202.00
MED1
Pold2
18972
-75.00
MED1
Pold2
18972
-29.00
MED1
Pold2
18972
58.00
MEIS1
Pold2
18972
167.00
MK08
Pold2
18972
-9.00
MK08
Pold2
18972
24.00
MK08
Pold2
18972
48.00
MK08
Pold2
18972
55.00
MK08
Pold2
18972
93.00
MK10
Pold2
18972
-9.00
MK10
Pold2
18972
24.00
MK10
Pold2
18972
48.00
MK10
Pold2
18972
55.00
MK10
Pold2
18972
93.00
MYC
Pold2
18972
-340.00
MYC
Pold2
18972
-109.00
MYC
Pold2
18972
78.00
MYOD1
Pold2
18972
-128.00
MYOD1
Pold2
18972
99.00
MYOG
Pold2
18972
-71.00
MYOG
Pold2
18972
142.00
NANOG
Pold2
18972
26.00
NANOG
Pold2
18972
126.00
NCOA2
Pold2
18972
176.00
NCOR1
Pold2
18972
-197.00
NFIB
Pold2
18972
-153.00
NKX21
Pold2
18972
-841.00
NKX31
Pold2
18972
130.00
NR1D2
Pold2
18972
-85.00
NUCKS
Pold2
18972
-150.00
NUCKS
Pold2
18972
190.00
PAX5
Pold2
18972
1.00
PAX5
Pold2
18972
39.00
PAX6
Pold2
18972
-638.00
PAXI1
Pold2
18972
-61.00
PER1
Pold2
18972
35.00
PER2
Pold2
18972
155.00
PIT1
Pold2
18972
-988.00
PIT1
Pold2
18972
36.00
PO5F1
Pold2
18972
-229.00
PO5F1
Pold2
18972
-136.00
PO5F1
Pold2
18972
-133.00
PO5F1
Pold2
18972
-119.00
PO5F1
Pold2
18972
-73.00
PO5F1
Pold2
18972
151.00
PO5F1
Pold2
18972
197.00
PPARG
Pold2
18972
-95.00
PPARG
Pold2
18972
96.00
PPARG
Pold2
18972
166.00
PRGR
Pold2
18972
39.00
RARA
Pold2
18972
-125.00
RARA
Pold2
18972
184.00
RING2
Pold2
18972
-413.00
RING2
Pold2
18972
-75.00
RING2
Pold2
18972
70.00
RORG
Pold2
18972
-139.00
RUNX1
Pold2
18972
-86.00
RUNX1
Pold2
18972
-82.00
RUNX1
Pold2
18972
-86
RUNX1
Pold2
18972
-82
RUNX1
Pold2
18972
3
RUNX1
Pold2
18972
20
RUNX1
Pold2
18972
23
RUNX2
Pold2
18972
-88
RUNX2
Pold2
18972
-49
RUNX3
Pold2
18972
107
RUNX3
Pold2
18972
143
RUNX3
Pold2
18972
183
SIN3A
Pold2
18972
-68
SIN3A
Pold2
18972
-36
SIR1
Pold2
18972
169
SMC5
Pold2
18972
-174
SMCA4
Pold2
18972
-78
SMCA4
Pold2
18972
-59
SMCA4
Pold2
18972
-47
SMCA4
Pold2
18972
-9
SMCA4
Pold2
18972
6
SOX17
Pold2
18972
-972
SOX17
Pold2
18972
-149
SOX2
Pold2
18972
180
SOX3
Pold2
18972
-39
SPI1
Pold2
18972
-103
SPI1
Pold2
18972
-69
SPI1
Pold2
18972
-66
SPI1
Pold2
18972
-57
SPI1
Pold2
18972
-44
SPI1
Pold2
18972
-40
SPI1
Pold2
18972
-36
SPI1
Pold2
18972
-30
SPI1
Pold2
18972
-26
SPI1
Pold2
18972
-23
SPI1
Pold2
18972
-19
SPI1
Pold2
18972
-18
SPI1
Pold2
18972
-11
SPI1
Pold2
18972
-5
SPI1
Pold2
18972
-1
SPI1
Pold2
18972
9
SPI1
Pold2
18972
10
SPI1
Pold2
18972
28
SPI1
Pold2
18972
45
SPI1
Pold2
18972
53
SPI1
Pold2
18972
63
SRBP1
Pold2
18972
-147
SRBP2
Pold2
18972
151
SRF
Pold2
18972
-27
SRF
Pold2
18972
29
STA5A
Pold2
18972
-18
STA5A
Pold2
18972
154
STA5B
Pold2
18972
-18
STAT1
Pold2
18972
-133
STAT1
Pold2
18972
124
STAT3
Pold2
18972
-162
STAT3
Pold2
18972
-143
STAT3
Pold2
18972
82
STAT3
Pold2
18972
97
STAT3
Pold2
18972
165
STAT3
Pold2
18972
182
SUH
Pold2
18972
197
T2EB
Pold2
18972
-119
T2EB
Pold2
18972
46
TAF1
Pold2
18972
-138
TAF1
Pold2
18972
103
TAF3
Pold2
18972
-101
TAF7L
Pold2
18972
134
TAF9B
Pold2
18972
140
TBP
Pold2
18972
-174
TBP
Pold2
18972
-62
TBP
Pold2
18972
182
TBX3
Pold2
18972
-118
TBX3
Pold2
18972
188
TBX5
Pold2
18972
112
TCF7
Pold2
18972
-37
TET1
Pold2
18972
-127
TET1
Pold2
18972
-118
TET1
Pold2
18972
116
TF2B
Pold2
18972
-138
TF2B
Pold2
18972
-109
TF2B
Pold2
18972
-2
TF2B
Pold2
18972
105
TF65
Pold2
18972
-182
TF65
Pold2
18972
-145
TF65
Pold2
18972
-138
TF65
Pold2
18972
-114
TF65
Pold2
18972
-91
TF65
Pold2
18972
-80
TF65
Pold2
18972
-55
TF65
Pold2
18972
-53
TF65
Pold2
18972
-41
TF65
Pold2
18972
-8
TF65
Pold2
18972
5
TF65
Pold2
18972
36
TFE2
Pold2
18972
-82
TFE2
Pold2
18972
-2
TGIF1
Pold2
18972
79
THB
Pold2
18972
-71
THB
Pold2
18972
170
TIF1B
Pold2
18972
-71
TLE1
Pold2
18972
-926
TLE2
Pold2
18972
-926
TLE3
Pold2
18972
-926
TLE4
Pold2
18972
-926
TOP2A
Pold2
18972
106
USF1
Pold2
18972
-77
UTF1
Pold2
18972
-224
WT1
Pold2
18972
-302
ZBT17
Pold2
18972
-168
ZBT17
Pold2
18972
147
ZFX
Pold2
18972
-37
SIN3A
Pold2
18972
-68.00
SIN3A
Pold2
18972
-36.00
SIR1
Pold2
18972
169.00
SMC5
Pold2
18972
-174.00
SMCA4
Pold2
18972
-78.00
SMCA4
Pold2
18972
-59.00
SMCA4
Pold2
18972
-47.00
SMCA4
Pold2
18972
-9.00
SMCA4
Pold2
18972
6.00
SOX17
Pold2
18972
-972.00
SOX17
Pold2
18972
-149.00
SOX2
Pold2
18972
180.00
SPI1
Pold2
18972
-103.00
SPI1
Pold2
18972
-44.00
SPI1
Pold2
18972
-36.00
SPI1
Pold2
18972
-30.00
SPI1
Pold2
18972
-19.00
SPI1
Pold2
18972
-18.00
SPI1
Pold2
18972
-11.00
SPI1
Pold2
18972
-1.00
SPI1
Pold2
18972
9.00
SPI1
Pold2
18972
28.00
SPI1
Pold2
18972
53.00
SPI1
Pold2
18972
63.00
SRBP2
Pold2
18972
151.00
SRF
Pold2
18972
-27.00
SRF
Pold2
18972
29.00
STA5A
Pold2
18972
-18.00
STA5A
Pold2
18972
154.00
STA5B
Pold2
18972
-18.00
STAT1
Pold2
18972
-133.00
STAT1
Pold2
18972
124.00
STAT3
Pold2
18972
-162.00
STAT3
Pold2
18972
-143.00
STAT3
Pold2
18972
82.00
STAT3
Pold2
18972
97.00
STAT3
Pold2
18972
165.00
STAT3
Pold2
18972
182.00
SUH
Pold2
18972
197.00
TAF1
Pold2
18972
-138.00
TAF1
Pold2
18972
103.00
TAF3
Pold2
18972
-101.00
TAF7L
Pold2
18972
134.00
TBP
Pold2
18972
182.00
TBX3
Pold2
18972
-118.00
TBX5
Pold2
18972
112.00
TCF7
Pold2
18972
-37.00
TET1
Pold2
18972
-127.00
TET1
Pold2
18972
-118.00
TET1
Pold2
18972
116.00
TF65
Pold2
18972
-182.00
TF65
Pold2
18972
-145.00
TF65
Pold2
18972
-138.00
TF65
Pold2
18972
-114.00
TF65
Pold2
18972
-80.00
TF65
Pold2
18972
-55.00
TF65
Pold2
18972
-41.00
TF65
Pold2
18972
36.00
TFE2
Pold2
18972
-2.00
TLE1
Pold2
18972
-926.00
TLE2
Pold2
18972
-926.00
TLE3
Pold2
18972
-926.00
TLE4
Pold2
18972
-926.00
TOP2A
Pold2
18972
106.00
USF1
Pold2
18972
-77.00
UTF1
Pold2
18972
-224.00
ZFX
Pold2
18972
-37.00
Additional Information about the Gene
Expression1
Allen Brain Atlas
BGEM
EMAGE
GeneNote
genepaint
GNF Symatlas
GENSAT
Expression2
AceView
HGNC Expression
UCSC
GEO
ArrayExpress
Cleanex
Function
AMIGO
MIPS
Panther
Uniport
Genecards
InterPro
IHOP
Gene Regulation
MicroRNA target
TRED
Pathways
Biocarta Pathways CGAP SAGE
KEGG Pathways
EBI
Sequences
NCBI
Ensembl
MGI Information
QTL
Harvester
Howdy
Interactions
MIMI
EBI
Nature-NCI
string
IHOP
Tools Links
Sequence Manipulation
Genes and Transcripts
Micoroarray Analysis
Literature Search
Protein
Databases
Functional Analysis
Transcription Factor Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
Target Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9