Transcription Factors and their targets
Search Term:
TF
TargetGene
TargetGeneID
Home
Gene List
TF list
Protocol
Contact
TF
Target
Gene ID
Distance From TSS
AFF4
Gli2
14633
-58.00
ATF4
Gli2
14633
20.00
BMI1
Gli2
14633
55.00
CBP
Gli2
14633
-18.00
CBP
Gli2
14633
23.00
CBX3
Gli2
14633
24.00
CDK9
Gli2
14633
-11.00
CEBPA
Gli2
14633
4.00
CEBPA
Gli2
14633
35.00
CEBPA
Gli2
14633
46.00
CEBPB
Gli2
14633
-55.00
CEBPB
Gli2
14633
-40.00
CEBPB
Gli2
14633
-25.00
CEBPB
Gli2
14633
-12.00
CEBPB
Gli2
14633
-11.00
CEBPB
Gli2
14633
11.00
CEBPB
Gli2
14633
12.00
CEBPB
Gli2
14633
13.00
CEBPB
Gli2
14633
36.00
CEBPB
Gli2
14633
163.00
CHD4
Gli2
14633
-155.00
CHD4
Gli2
14633
152.00
CTCF
Gli2
14633
-682.00
CTCF
Gli2
14633
-489.00
CTCF
Gli2
14633
-381.00
CTCF
Gli2
14633
-26.00
CTCF
Gli2
14633
-16.00
CTCF
Gli2
14633
-12.00
CTCF
Gli2
14633
-4.00
CTCF
Gli2
14633
1.00
CTCF
Gli2
14633
15.00
CTCF
Gli2
14633
17.00
CTCF
Gli2
14633
25.00
CTCF
Gli2
14633
26.00
CTCF
Gli2
14633
34.00
CTCF
Gli2
14633
39.00
CTCF
Gli2
14633
47.00
CTCF
Gli2
14633
50.00
CTCF
Gli2
14633
71.00
CTCF
Gli2
14633
82.00
CTCF
Gli2
14633
85.00
CTCF
Gli2
14633
88.00
CTCF
Gli2
14633
91.00
CTCF
Gli2
14633
92.00
CTCF
Gli2
14633
95.00
CTCF
Gli2
14633
99.00
CTCF
Gli2
14633
106.00
CTCF
Gli2
14633
107.00
CTCF
Gli2
14633
139.00
CTCF
Gli2
14633
157.00
CTCF
Gli2
14633
171.00
CTCF
Gli2
14633
179.00
CTR9
Gli2
14633
-956.00
DMAP1
Gli2
14633
-12.00
E2F1
Gli2
14633
-989.00
E2F4
Gli2
14633
140.00
ELL3
Gli2
14633
-123.00
EP300
Gli2
14633
-129.00
EP300
Gli2
14633
-48.00
EP300
Gli2
14633
19.00
EP300
Gli2
14633
36.00
ESR1
Gli2
14633
56.00
EZH2
Gli2
14633
-915.00
EZH2
Gli2
14633
-129.00
FOXA2
Gli2
14633
-499.00
FOXA2
Gli2
14633
126.00
FOXO1
Gli2
14633
65.00
HDAC3
Gli2
14633
-65.00
HXB4
Gli2
14633
59.00
IRF4
Gli2
14633
-76.00
IRF4
Gli2
14633
-55.00
IRF4
Gli2
14633
-51.00
IRF4
Gli2
14633
-17.00
IRF4
Gli2
14633
3.00
IRF4
Gli2
14633
153.00
ISL1
Gli2
14633
-89.00
KAT8
Gli2
14633
-616.00
KAT8
Gli2
14633
-31.00
KAT8
Gli2
14633
-27.00
KDM2A
Gli2
14633
-533.00
KDM2B
Gli2
14633
-557.00
KDM2B
Gli2
14633
-537.00
KDM2B
Gli2
14633
-502.00
KDM2B
Gli2
14633
-363.00
KDM2B
Gli2
14633
-55.00
KDM2B
Gli2
14633
44.00
KDM5A
Gli2
14633
-6.00
KDM6B
Gli2
14633
70.00
KMT2C
Gli2
14633
-104.00
KMT2D
Gli2
14633
-532.00
KMT2D
Gli2
14633
45.00
KMT2D
Gli2
14633
68.00
LHX3
Gli2
14633
-997.00
MAF
Gli2
14633
-16.00
MAX
Gli2
14633
176.00
MBD1
Gli2
14633
-998.00
MBD1
Gli2
14633
-195.00
MED1
Gli2
14633
-667.00
MED1
Gli2
14633
-51.00
MED1
Gli2
14633
-31.00
MED1
Gli2
14633
36.00
MED1
Gli2
14633
50.00
MED1
Gli2
14633
110.00
MEIS1
Gli2
14633
16.00
MEIS1
Gli2
14633
139.00
MYC
Gli2
14633
-82.00
MYC
Gli2
14633
107.00
MYOG
Gli2
14633
-27.00
NANOG
Gli2
14633
-4.00
NELFB
Gli2
14633
56.00
NFIB
Gli2
14633
91.00
NIPBL
Gli2
14633
37.00
P53
Gli2
14633
-634.00
P53
Gli2
14633
-548.00
P53
Gli2
14633
-8.00
P53
Gli2
14633
19.00
PAX6
Gli2
14633
-382.00
PITX1
Gli2
14633
65.00
PKNX2
Gli2
14633
93.00
PO5F1
Gli2
14633
-581.00
PO5F1
Gli2
14633
-562.00
PO5F1
Gli2
14633
-494.00
PO5F1
Gli2
14633
-70.00
PO5F1
Gli2
14633
-60.00
PO5F1
Gli2
14633
-52.00
PO5F1
Gli2
14633
-44.00
PO5F1
Gli2
14633
-21.00
PO5F1
Gli2
14633
-13.00
PO5F1
Gli2
14633
12.00
PO5F1
Gli2
14633
18.00
PO5F1
Gli2
14633
32.00
PO5F1
Gli2
14633
47.00
PO5F1
Gli2
14633
68.00
PO5F1
Gli2
14633
82.00
PPARG
Gli2
14633
-525.00
PPARG
Gli2
14633
-503.00
PPARG
Gli2
14633
-419.00
PPARG
Gli2
14633
-35.00
PPARG
Gli2
14633
-2.00
PPARG
Gli2
14633
42.00
PPARG
Gli2
14633
70.00
PRD14
Gli2
14633
-396.00
PRGR
Gli2
14633
-19.00
PTF1A
Gli2
14633
-551.00
RAD21
Gli2
14633
53.00
RAD21
Gli2
14633
97.00
RARA
Gli2
14633
-474.00
RARA
Gli2
14633
47.00
RARA
Gli2
14633
106.00
RARA
Gli2
14633
165.00
RBBP5
Gli2
14633
108.00
RCOR3
Gli2
14633
-46.00
RFX1
Gli2
14633
105.00
RING2
Gli2
14633
-690.00
RING2
Gli2
14633
-543.00
RING2
Gli2
14633
21.00
RING2
Gli2
14633
185.00
SIN3A
Gli2
14633
-21
SIN3A
Gli2
14633
-12
SMAD3
Gli2
14633
-153
SMAD3
Gli2
14633
140
SMC1A
Gli2
14633
-17
SMC1A
Gli2
14633
71
SMC1A
Gli2
14633
116
SMC1A
Gli2
14633
127
SMC1A
Gli2
14633
165
SMC3
Gli2
14633
92
SMC3
Gli2
14633
169
SMCA4
Gli2
14633
-634
SMCA4
Gli2
14633
-517
SMCA4
Gli2
14633
-187
SMCA4
Gli2
14633
-40
SOX2
Gli2
14633
-95
SOX2
Gli2
14633
55
SOX3
Gli2
14633
-466
SPI1
Gli2
14633
-83
STA5B
Gli2
14633
85
STAG1
Gli2
14633
137
STAT1
Gli2
14633
58
SUZ12
Gli2
14633
-987
SUZ12
Gli2
14633
-643
SUZ12
Gli2
14633
-585
SUZ12
Gli2
14633
-579
SUZ12
Gli2
14633
-518
SUZ12
Gli2
14633
-414
SUZ12
Gli2
14633
-272
SUZ12
Gli2
14633
-208
SUZ12
Gli2
14633
-108
SUZ12
Gli2
14633
-61
SUZ12
Gli2
14633
-45
SUZ12
Gli2
14633
-1
SUZ12
Gli2
14633
57
SUZ12
Gli2
14633
70
SUZ12
Gli2
14633
135
SUZ12
Gli2
14633
145
SUZ12
Gli2
14633
170
TAF3
Gli2
14633
-632
TAF3
Gli2
14633
-525
TAF3
Gli2
14633
-511
TAF3
Gli2
14633
-113
TAF3
Gli2
14633
125
TAF3
Gli2
14633
187
TAF9B
Gli2
14633
37
TBX3
Gli2
14633
149
TET1
Gli2
14633
-676
TET1
Gli2
14633
-406
TET1
Gli2
14633
-388
TET1
Gli2
14633
-25
TET1
Gli2
14633
-3
TET1
Gli2
14633
1
TET1
Gli2
14633
5
TET1
Gli2
14633
37
TET1
Gli2
14633
175
TIF1B
Gli2
14633
-915
TYY1
Gli2
14633
-2
UTF1
Gli2
14633
-980
UTF1
Gli2
14633
-615
UTF1
Gli2
14633
-545
UTF1
Gli2
14633
-349
UTF1
Gli2
14633
129
WDR5
Gli2
14633
-575
ZC11A
Gli2
14633
107
ZFX
Gli2
14633
-595
ZIC2
Gli2
14633
-64
ZN281
Gli2
14633
176
SIN3A
Gli2
14633
-21.00
SIN3A
Gli2
14633
-12.00
SMAD3
Gli2
14633
-153.00
SMAD3
Gli2
14633
140.00
SMC1A
Gli2
14633
-17.00
SMC1A
Gli2
14633
71.00
SMC1A
Gli2
14633
116.00
SMC1A
Gli2
14633
127.00
SMC1A
Gli2
14633
165.00
SMC3
Gli2
14633
92.00
SMC3
Gli2
14633
169.00
SOX2
Gli2
14633
55.00
SPI1
Gli2
14633
-83.00
STA5B
Gli2
14633
85.00
STAG1
Gli2
14633
137.00
SUZ12
Gli2
14633
-208.00
SUZ12
Gli2
14633
-108.00
SUZ12
Gli2
14633
-61.00
SUZ12
Gli2
14633
-1.00
SUZ12
Gli2
14633
170.00
TAF3
Gli2
14633
-525.00
TET1
Gli2
14633
-676.00
TET1
Gli2
14633
-406.00
TET1
Gli2
14633
-388.00
TET1
Gli2
14633
-25.00
TET1
Gli2
14633
-3.00
TET1
Gli2
14633
1.00
TET1
Gli2
14633
5.00
TET1
Gli2
14633
37.00
TET1
Gli2
14633
175.00
TYY1
Gli2
14633
-2.00
UTF1
Gli2
14633
-980.00
UTF1
Gli2
14633
-615.00
UTF1
Gli2
14633
-349.00
UTF1
Gli2
14633
129.00
WDR5
Gli2
14633
-575.00
ZFX
Gli2
14633
-595.00
ZN281
Gli2
14633
176.00
Additional Information about the Gene
Expression1
Allen Brain Atlas
BGEM
EMAGE
GeneNote
genepaint
GNF Symatlas
GENSAT
Expression2
AceView
HGNC Expression
UCSC
GEO
ArrayExpress
Cleanex
Function
AMIGO
MIPS
Panther
Uniport
Genecards
InterPro
IHOP
Gene Regulation
MicroRNA target
TRED
Pathways
Biocarta Pathways CGAP SAGE
KEGG Pathways
EBI
Sequences
NCBI
Ensembl
MGI Information
QTL
Harvester
Howdy
Interactions
MIMI
EBI
Nature-NCI
string
IHOP
Tools Links
Sequence Manipulation
Genes and Transcripts
Micoroarray Analysis
Literature Search
Protein
Databases
Functional Analysis
Transcription Factor Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
Target Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9