Transcription Factors and their targets
Search Term:
TF
TargetGene
TargetGeneID
Home
Gene List
TF list
Protocol
Contact
TF
Target
Gene ID
Distance From TSS
AICDA
Trafd1
231712
-250.00
AICDA
Trafd1
231712
-160.00
ARX
Trafd1
231712
-973.00
ASCL1
Trafd1
231712
-50.00
ASCL1
Trafd1
231712
67.00
ATF4
Trafd1
231712
-838.00
BACH2
Trafd1
231712
-18.00
BATF
Trafd1
231712
-712.00
BATF
Trafd1
231712
-556.00
BATF
Trafd1
231712
-549.00
BATF
Trafd1
231712
-538.00
BATF
Trafd1
231712
-516.00
BATF
Trafd1
231712
-220.00
BATF
Trafd1
231712
-202.00
BATF
Trafd1
231712
-158.00
BATF
Trafd1
231712
14.00
BRAC
Trafd1
231712
-973.00
BRD4
Trafd1
231712
184.00
CBX3
Trafd1
231712
-160.00
CEBPA
Trafd1
231712
-774.00
CEBPA
Trafd1
231712
-746.00
CEBPB
Trafd1
231712
-761.00
CEBPB
Trafd1
231712
-756.00
CEBPB
Trafd1
231712
-740.00
CEBPB
Trafd1
231712
-680.00
CEBPB
Trafd1
231712
-86.00
CEBPB
Trafd1
231712
-21.00
CEBPB
Trafd1
231712
-11.00
CEBPB
Trafd1
231712
31.00
CHD4
Trafd1
231712
81.00
CTCF
Trafd1
231712
-33.00
DPY30
Trafd1
231712
16.00
E2F4
Trafd1
231712
-973.00
EGR1
Trafd1
231712
80.00
EP300
Trafd1
231712
-992.00
EP300
Trafd1
231712
-571.00
EP300
Trafd1
231712
-565.00
EP300
Trafd1
231712
-561.00
EP300
Trafd1
231712
-557.00
EP300
Trafd1
231712
-552.00
EP300
Trafd1
231712
-551.00
EP300
Trafd1
231712
-539.00
EP300
Trafd1
231712
-456.00
EP300
Trafd1
231712
-153.00
EP300
Trafd1
231712
-30.00
EP300
Trafd1
231712
-23.00
EP300
Trafd1
231712
-16.00
EP300
Trafd1
231712
-11.00
EP300
Trafd1
231712
9.00
EP300
Trafd1
231712
23.00
EP300
Trafd1
231712
27.00
EP300
Trafd1
231712
39.00
EP300
Trafd1
231712
40.00
EP300
Trafd1
231712
43.00
EP300
Trafd1
231712
51.00
EP300
Trafd1
231712
52.00
EP300
Trafd1
231712
57.00
EP300
Trafd1
231712
59.00
ESR1
Trafd1
231712
27.00
ETS1
Trafd1
231712
69.00
EZH2
Trafd1
231712
-973.00
FLI1
Trafd1
231712
97.00
FOSL2
Trafd1
231712
-892.00
FOSL2
Trafd1
231712
-571.00
FOSL2
Trafd1
231712
-230.00
FOSL2
Trafd1
231712
-111.00
FOXA2
Trafd1
231712
-6.00
FOXA2
Trafd1
231712
20.00
HNF4A
Trafd1
231712
-69.00
HXB4
Trafd1
231712
-127.00
HXB4
Trafd1
231712
-22.00
IKZF1
Trafd1
231712
-761.00
IKZF1
Trafd1
231712
-87.00
IKZF1
Trafd1
231712
22.00
IKZF1
Trafd1
231712
55.00
IKZF1
Trafd1
231712
73.00
IRF1
Trafd1
231712
-664.00
IRF1
Trafd1
231712
-632.00
IRF4
Trafd1
231712
-984.00
IRF4
Trafd1
231712
-539.00
IRF4
Trafd1
231712
-522.00
IRF4
Trafd1
231712
-223.00
IRF4
Trafd1
231712
-147.00
IRF4
Trafd1
231712
-10.00
IRF4
Trafd1
231712
-9.00
IRF4
Trafd1
231712
22.00
IRF4
Trafd1
231712
39.00
IRF4
Trafd1
231712
40.00
IRF4
Trafd1
231712
48.00
IRF4
Trafd1
231712
56.00
JUNB
Trafd1
231712
-705.00
JUNB
Trafd1
231712
-665.00
JUNB
Trafd1
231712
-148.00
JUNB
Trafd1
231712
51.00
JUND
Trafd1
231712
52.00
KAT8
Trafd1
231712
-361.00
KAT8
Trafd1
231712
-25.00
KAT8
Trafd1
231712
-12.00
KDM2A
Trafd1
231712
15.00
KDM2B
Trafd1
231712
-565.00
KDM2B
Trafd1
231712
-202.00
KDM2B
Trafd1
231712
29.00
KDM2B
Trafd1
231712
61.00
KDM2B
Trafd1
231712
65.00
KDM6B
Trafd1
231712
36.00
KLF3
Trafd1
231712
173.00
KMT2C
Trafd1
231712
58.00
KMT2D
Trafd1
231712
-121.00
KMT2D
Trafd1
231712
25.00
KMT2D
Trafd1
231712
47.00
MBD1
Trafd1
231712
-757.00
MBD4
Trafd1
231712
-792.00
MECP2
Trafd1
231712
-139.00
MED1
Trafd1
231712
38.00
MED1
Trafd1
231712
68.00
MED1
Trafd1
231712
123.00
MEIS1
Trafd1
231712
-223.00
MEIS1
Trafd1
231712
21.00
MK08
Trafd1
231712
13.00
MK10
Trafd1
231712
13.00
MYBA
Trafd1
231712
-539.00
MYOD1
Trafd1
231712
-203.00
MYOD1
Trafd1
231712
33.00
MYOD1
Trafd1
231712
78.00
MYOG
Trafd1
231712
71.00
MYOG
Trafd1
231712
82.00
NANOG
Trafd1
231712
-57.00
NANOG
Trafd1
231712
193.00
NCOR1
Trafd1
231712
-947.00
NCOR2
Trafd1
231712
-965.00
NDF2
Trafd1
231712
143.00
NELFB
Trafd1
231712
51.00
NFIB
Trafd1
231712
-235.00
NFIB
Trafd1
231712
79.00
NKX61
Trafd1
231712
-34.00
NR1D1
Trafd1
231712
-132.00
NR1D1
Trafd1
231712
-63.00
OGT1
Trafd1
231712
47.00
OGT1
Trafd1
231712
53.00
PAX6
Trafd1
231712
-501.00
PAXI1
Trafd1
231712
8.00
PAXI1
Trafd1
231712
11.00
PBX1
Trafd1
231712
39.00
PER2
Trafd1
231712
-8.00
PIT1
Trafd1
231712
-493.00
PIT1
Trafd1
231712
-291.00
PKNX2
Trafd1
231712
-3.00
PO5F1
Trafd1
231712
-146.00
PO5F1
Trafd1
231712
144.00
PO5F1
Trafd1
231712
150.00
PPARG
Trafd1
231712
-197.00
PPARG
Trafd1
231712
55.00
PPARG
Trafd1
231712
83.00
PRGR
Trafd1
231712
19.00
RARA
Trafd1
231712
44.00
RING1
Trafd1
231712
-973.00
RING2
Trafd1
231712
-973.00
RXRA
Trafd1
231712
-65.00
RXRA
Trafd1
231712
96.00
RXRA
Trafd1
231712
113.00
RYBP
Trafd1
231712
-973.00
RPB1
Trafd1
231712
-754
RPB1
Trafd1
231712
80
RUNX1
Trafd1
231712
9
RUNX1
Trafd1
231712
155
RXRA
Trafd1
231712
-65
RXRA
Trafd1
231712
96
RXRA
Trafd1
231712
113
RYBP
Trafd1
231712
-973
SIR1
Trafd1
231712
184
SMAD3
Trafd1
231712
35
SMCA4
Trafd1
231712
-556
SMCA4
Trafd1
231712
-298
SMCA4
Trafd1
231712
-82
SOX2
Trafd1
231712
-177
SOX2
Trafd1
231712
60
SPI1
Trafd1
231712
-857
SPI1
Trafd1
231712
-834
SPI1
Trafd1
231712
-830
SPI1
Trafd1
231712
-828
SPI1
Trafd1
231712
-827
SPI1
Trafd1
231712
-823
SPI1
Trafd1
231712
-821
SPI1
Trafd1
231712
-818
SPI1
Trafd1
231712
-815
SPI1
Trafd1
231712
-813
SPI1
Trafd1
231712
-808
SPI1
Trafd1
231712
-807
SPI1
Trafd1
231712
-806
SPI1
Trafd1
231712
-805
SPI1
Trafd1
231712
-801
SPI1
Trafd1
231712
-800
SPI1
Trafd1
231712
-798
SPI1
Trafd1
231712
-792
SPI1
Trafd1
231712
-788
SPI1
Trafd1
231712
-785
SPI1
Trafd1
231712
-779
SPI1
Trafd1
231712
-777
SPI1
Trafd1
231712
-776
SPI1
Trafd1
231712
-775
SPI1
Trafd1
231712
-774
SPI1
Trafd1
231712
-771
SPI1
Trafd1
231712
-768
SPI1
Trafd1
231712
-766
SPI1
Trafd1
231712
-765
SPI1
Trafd1
231712
-759
SPI1
Trafd1
231712
-755
SPI1
Trafd1
231712
-753
SPI1
Trafd1
231712
-747
SPI1
Trafd1
231712
-744
SPI1
Trafd1
231712
-739
SPI1
Trafd1
231712
-737
SPI1
Trafd1
231712
-717
SPI1
Trafd1
231712
-690
SPI1
Trafd1
231712
-664
SPI1
Trafd1
231712
-645
SPI1
Trafd1
231712
-617
SPI1
Trafd1
231712
-603
SPI1
Trafd1
231712
-582
SPI1
Trafd1
231712
-568
SPI1
Trafd1
231712
-551
SPI1
Trafd1
231712
-531
SPI1
Trafd1
231712
-510
SPI1
Trafd1
231712
-505
SPI1
Trafd1
231712
-499
SPI1
Trafd1
231712
-498
SPI1
Trafd1
231712
-487
SPI1
Trafd1
231712
-486
SPI1
Trafd1
231712
-481
SPI1
Trafd1
231712
-474
SPI1
Trafd1
231712
-472
SPI1
Trafd1
231712
-469
SPI1
Trafd1
231712
-466
SPI1
Trafd1
231712
-464
SPI1
Trafd1
231712
-453
SPI1
Trafd1
231712
-444
SPI1
Trafd1
231712
-415
SPI1
Trafd1
231712
-385
SPI1
Trafd1
231712
-382
SPI1
Trafd1
231712
-368
SPI1
Trafd1
231712
-341
SPI1
Trafd1
231712
-292
SPI1
Trafd1
231712
-201
SPI1
Trafd1
231712
-76
SPI1
Trafd1
231712
-28
SPI1
Trafd1
231712
4
SPI1
Trafd1
231712
11
SPI1
Trafd1
231712
28
SPI1
Trafd1
231712
33
SPI1
Trafd1
231712
37
SPI1
Trafd1
231712
52
SPI1
Trafd1
231712
53
SPI1
Trafd1
231712
55
SPI1
Trafd1
231712
57
SPI1
Trafd1
231712
58
SPI1
Trafd1
231712
61
SPI1
Trafd1
231712
65
SPI1
Trafd1
231712
66
SPI1
Trafd1
231712
73
SPI1
Trafd1
231712
75
SPI1
Trafd1
231712
79
SPI1
Trafd1
231712
84
SPI1
Trafd1
231712
85
SPI1
Trafd1
231712
88
SPI1
Trafd1
231712
89
SPI1
Trafd1
231712
114
SPI1
Trafd1
231712
124
SPI1
Trafd1
231712
126
SPI1
Trafd1
231712
132
SPI1
Trafd1
231712
135
SPI1
Trafd1
231712
140
SPI1
Trafd1
231712
149
SPI1
Trafd1
231712
153
SPT5H
Trafd1
231712
61
SPT5H
Trafd1
231712
67
SRF
Trafd1
231712
-177
STAT1
Trafd1
231712
-699
STAT1
Trafd1
231712
-539
STAT1
Trafd1
231712
-515
STAT1
Trafd1
231712
-106
STAT3
Trafd1
231712
64
STAT4
Trafd1
231712
-857
STAT4
Trafd1
231712
-190
SUZ12
Trafd1
231712
-198
SUZ12
Trafd1
231712
-185
SUZ12
Trafd1
231712
-129
SUZ12
Trafd1
231712
-41
SUZ12
Trafd1
231712
28
SUZ12
Trafd1
231712
40
TAF3
Trafd1
231712
100
TAF7L
Trafd1
231712
-21
TAF9B
Trafd1
231712
36
TBP
Trafd1
231712
29
TBP
Trafd1
231712
75
TBP
Trafd1
231712
77
TBX21
Trafd1
231712
67
TBX3
Trafd1
231712
28
TBX3
Trafd1
231712
58
TCF7
Trafd1
231712
43
TCF7
Trafd1
231712
60
TET1
Trafd1
231712
-211
TET1
Trafd1
231712
-5
TET1
Trafd1
231712
11
TET1
Trafd1
231712
30
TET1
Trafd1
231712
89
TF2B
Trafd1
231712
-805
TF2B
Trafd1
231712
-110
TF2B
Trafd1
231712
13
TF65
Trafd1
231712
-976
TF65
Trafd1
231712
-814
TF65
Trafd1
231712
-784
TF65
Trafd1
231712
-776
TF65
Trafd1
231712
-715
TF65
Trafd1
231712
12
TF65
Trafd1
231712
17
TF65
Trafd1
231712
44
TF65
Trafd1
231712
46
TF65
Trafd1
231712
55
TF65
Trafd1
231712
76
TF65
Trafd1
231712
81
TFAP4
Trafd1
231712
100
TGIF1
Trafd1
231712
-229
TGIF1
Trafd1
231712
-210
THB
Trafd1
231712
40
TIF1B
Trafd1
231712
146
TOP2A
Trafd1
231712
-501
UTF1
Trafd1
231712
-74
UTF1
Trafd1
231712
36
UTF1
Trafd1
231712
63
ZBT17
Trafd1
231712
171
ZBT17
Trafd1
231712
195
ZFX
Trafd1
231712
41
SIR1
Trafd1
231712
184.00
SMAD3
Trafd1
231712
35.00
SMCA4
Trafd1
231712
-298.00
SMCA4
Trafd1
231712
-82.00
SPI1
Trafd1
231712
-857.00
SPI1
Trafd1
231712
-834.00
SPI1
Trafd1
231712
-830.00
SPI1
Trafd1
231712
-828.00
SPI1
Trafd1
231712
-823.00
SPI1
Trafd1
231712
-818.00
SPI1
Trafd1
231712
-808.00
SPI1
Trafd1
231712
-807.00
SPI1
Trafd1
231712
-806.00
SPI1
Trafd1
231712
-801.00
SPI1
Trafd1
231712
-798.00
SPI1
Trafd1
231712
-788.00
SPI1
Trafd1
231712
-785.00
SPI1
Trafd1
231712
-776.00
SPI1
Trafd1
231712
-774.00
SPI1
Trafd1
231712
-759.00
SPI1
Trafd1
231712
-753.00
SPI1
Trafd1
231712
-747.00
SPI1
Trafd1
231712
-739.00
SPI1
Trafd1
231712
-737.00
SPI1
Trafd1
231712
-717.00
SPI1
Trafd1
231712
-664.00
SPI1
Trafd1
231712
-645.00
SPI1
Trafd1
231712
-603.00
SPI1
Trafd1
231712
-582.00
SPI1
Trafd1
231712
-568.00
SPI1
Trafd1
231712
-551.00
SPI1
Trafd1
231712
-531.00
SPI1
Trafd1
231712
-510.00
SPI1
Trafd1
231712
-505.00
SPI1
Trafd1
231712
-499.00
SPI1
Trafd1
231712
-498.00
SPI1
Trafd1
231712
-486.00
SPI1
Trafd1
231712
-474.00
SPI1
Trafd1
231712
-472.00
SPI1
Trafd1
231712
-469.00
SPI1
Trafd1
231712
-453.00
SPI1
Trafd1
231712
-415.00
SPI1
Trafd1
231712
-382.00
SPI1
Trafd1
231712
-368.00
SPI1
Trafd1
231712
-341.00
SPI1
Trafd1
231712
-201.00
SPI1
Trafd1
231712
-76.00
SPI1
Trafd1
231712
28.00
SPI1
Trafd1
231712
37.00
SPI1
Trafd1
231712
52.00
SPI1
Trafd1
231712
55.00
SPI1
Trafd1
231712
57.00
SPI1
Trafd1
231712
61.00
SPI1
Trafd1
231712
65.00
SPI1
Trafd1
231712
66.00
SPI1
Trafd1
231712
73.00
SPI1
Trafd1
231712
79.00
SPI1
Trafd1
231712
84.00
SPI1
Trafd1
231712
85.00
SPI1
Trafd1
231712
88.00
SPI1
Trafd1
231712
89.00
SPI1
Trafd1
231712
114.00
SPI1
Trafd1
231712
124.00
SPI1
Trafd1
231712
126.00
SPI1
Trafd1
231712
132.00
SPI1
Trafd1
231712
135.00
SPI1
Trafd1
231712
140.00
SPI1
Trafd1
231712
153.00
SPT5H
Trafd1
231712
61.00
SPT5H
Trafd1
231712
67.00
SRF
Trafd1
231712
-177.00
STAT1
Trafd1
231712
-699.00
STAT1
Trafd1
231712
-539.00
STAT1
Trafd1
231712
-515.00
STAT1
Trafd1
231712
-106.00
STAT3
Trafd1
231712
64.00
STAT4
Trafd1
231712
-857.00
STAT4
Trafd1
231712
-190.00
SUZ12
Trafd1
231712
-198.00
SUZ12
Trafd1
231712
-41.00
TAF3
Trafd1
231712
100.00
TAF7L
Trafd1
231712
-21.00
TBX21
Trafd1
231712
67.00
TBX3
Trafd1
231712
28.00
TCF7
Trafd1
231712
43.00
TCF7
Trafd1
231712
60.00
TET1
Trafd1
231712
-211.00
TET1
Trafd1
231712
-5.00
TET1
Trafd1
231712
11.00
TET1
Trafd1
231712
30.00
TET1
Trafd1
231712
89.00
TF65
Trafd1
231712
-814.00
TF65
Trafd1
231712
-715.00
TF65
Trafd1
231712
44.00
TF65
Trafd1
231712
46.00
TF65
Trafd1
231712
76.00
TF65
Trafd1
231712
81.00
TOP2A
Trafd1
231712
-501.00
UTF1
Trafd1
231712
-74.00
ZFX
Trafd1
231712
41.00
Additional Information about the Gene
Expression1
Allen Brain Atlas
BGEM
EMAGE
GeneNote
genepaint
GNF Symatlas
GENSAT
Expression2
AceView
HGNC Expression
UCSC
GEO
ArrayExpress
Cleanex
Function
AMIGO
MIPS
Panther
Uniport
Genecards
InterPro
IHOP
Gene Regulation
MicroRNA target
TRED
Pathways
Biocarta Pathways CGAP SAGE
KEGG Pathways
EBI
Sequences
NCBI
Ensembl
MGI Information
QTL
Harvester
Howdy
Interactions
MIMI
EBI
Nature-NCI
string
IHOP
Tools Links
Sequence Manipulation
Genes and Transcripts
Micoroarray Analysis
Literature Search
Protein
Databases
Functional Analysis
Transcription Factor Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
Target Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9