Transcription Factors and their targets
Search Term:
TF
TargetGene
TargetGeneID
Home
Gene List
TF list
Protocol
Contact
TF
Target
Gene ID
Distance From TSS
AICDA
Stx1a
20907
91.00
ASCL1
Stx1a
20907
-273.00
ASCL1
Stx1a
20907
-101.00
BATF
Stx1a
20907
17.00
CBX3
Stx1a
20907
-308.00
CCND1
Stx1a
20907
-276.00
CDK8
Stx1a
20907
-342.00
CDK9
Stx1a
20907
-274.00
CDK9
Stx1a
20907
-178.00
CDK9
Stx1a
20907
-31.00
CEBPA
Stx1a
20907
-167.00
CHD4
Stx1a
20907
-500.00
CHD4
Stx1a
20907
-412.00
CHD4
Stx1a
20907
-383.00
CHD4
Stx1a
20907
-199.00
CHD4
Stx1a
20907
-185.00
CHD4
Stx1a
20907
-20.00
CTCF
Stx1a
20907
5.00
DPY30
Stx1a
20907
-565.00
E2F1
Stx1a
20907
-45.00
E2F3
Stx1a
20907
-262.00
E2F4
Stx1a
20907
-276.00
E2F4
Stx1a
20907
-138.00
EGR2
Stx1a
20907
-292.00
EHMT2
Stx1a
20907
65.00
EP300
Stx1a
20907
-371.00
EP300
Stx1a
20907
-354.00
EP300
Stx1a
20907
-292.00
EP300
Stx1a
20907
-275.00
EP300
Stx1a
20907
-274.00
EP300
Stx1a
20907
-200.00
EP300
Stx1a
20907
-164.00
EP300
Stx1a
20907
-70.00
EP300
Stx1a
20907
-33.00
EP400
Stx1a
20907
-415.00
ESR1
Stx1a
20907
-49.00
ETS1
Stx1a
20907
-186.00
EZH2
Stx1a
20907
-276.00
EZH2
Stx1a
20907
95.00
FOXA2
Stx1a
20907
-254.00
FOXA2
Stx1a
20907
23.00
FOXO1
Stx1a
20907
-601.00
FOXO1
Stx1a
20907
-139.00
IKZF1
Stx1a
20907
-271.00
IKZF1
Stx1a
20907
-197.00
IKZF1
Stx1a
20907
-125.00
IRF4
Stx1a
20907
-191.00
IRF4
Stx1a
20907
-130.00
IRF4
Stx1a
20907
-122.00
IRF4
Stx1a
20907
-117.00
IRF4
Stx1a
20907
-108.00
IRF4
Stx1a
20907
-73.00
IRF4
Stx1a
20907
-70.00
IRF4
Stx1a
20907
-48.00
IRF4
Stx1a
20907
-42.00
IRF4
Stx1a
20907
-26.00
IRF4
Stx1a
20907
-12.00
IRF4
Stx1a
20907
4.00
IRF4
Stx1a
20907
32.00
JUN
Stx1a
20907
-54.00
KAT8
Stx1a
20907
34.00
KDM1A
Stx1a
20907
-223.00
KDM2A
Stx1a
20907
170.00
KDM2B
Stx1a
20907
-286.00
KDM2B
Stx1a
20907
-266.00
KDM2B
Stx1a
20907
-185.00
KDM2B
Stx1a
20907
-139.00
KDM2B
Stx1a
20907
66.00
KDM4C
Stx1a
20907
-767.00
KDM4C
Stx1a
20907
40.00
KDM4C
Stx1a
20907
47.00
KDM6B
Stx1a
20907
-176.00
KDM6B
Stx1a
20907
43.00
KLF3
Stx1a
20907
-265.00
KMT2B
Stx1a
20907
-759.00
KMT2C
Stx1a
20907
-248.00
KMT2C
Stx1a
20907
7.00
KMT2D
Stx1a
20907
-168.00
KMT2D
Stx1a
20907
-95.00
MAF
Stx1a
20907
-71.00
MBD1
Stx1a
20907
72.00
MYOD1
Stx1a
20907
-439.00
MYOD1
Stx1a
20907
-346.00
MYOD1
Stx1a
20907
-207.00
MYOD1
Stx1a
20907
-131.00
MYOG
Stx1a
20907
-8.00
NANOG
Stx1a
20907
-208.00
NBN
Stx1a
20907
-143.00
NDF2
Stx1a
20907
-533.00
NELFA
Stx1a
20907
-267.00
NELFB
Stx1a
20907
-109.00
NIPBL
Stx1a
20907
-232.00
OGT1
Stx1a
20907
-71.00
PAX5
Stx1a
20907
-290.00
PIT1
Stx1a
20907
-515.00
PITX2
Stx1a
20907
19.00
PO5F1
Stx1a
20907
-545.00
PO5F1
Stx1a
20907
-450.00
PO5F1
Stx1a
20907
-379.00
PO5F1
Stx1a
20907
-250.00
PO5F1
Stx1a
20907
-239.00
PO5F1
Stx1a
20907
-220.00
PO5F1
Stx1a
20907
-211.00
PO5F1
Stx1a
20907
-202.00
PO5F1
Stx1a
20907
-187.00
PO5F1
Stx1a
20907
-125.00
PO5F1
Stx1a
20907
-107.00
PPARG
Stx1a
20907
-131.00
PPARG
Stx1a
20907
-115.00
PPARG
Stx1a
20907
-62.00
PRGR
Stx1a
20907
-184.00
PRGR
Stx1a
20907
-148.00
RARA
Stx1a
20907
-346.00
RARA
Stx1a
20907
-92.00
RARA
Stx1a
20907
-36.00
RING1
Stx1a
20907
-171.00
RING2
Stx1a
20907
-180.00
RING2
Stx1a
20907
126.00
RPB1
Stx1a
20907
-363.00
RYBP
Stx1a
20907
-276.00
RPB1
Stx1a
20907
-513
RPB1
Stx1a
20907
-468
RPB1
Stx1a
20907
-449
RPB1
Stx1a
20907
-446
RPB1
Stx1a
20907
-444
RPB1
Stx1a
20907
-441
RPB1
Stx1a
20907
-440
RPB1
Stx1a
20907
-439
RPB1
Stx1a
20907
-438
RPB1
Stx1a
20907
-437
RPB1
Stx1a
20907
-416
RPB1
Stx1a
20907
-413
RPB1
Stx1a
20907
-410
RPB1
Stx1a
20907
-363
RPB1
Stx1a
20907
-280
RPB1
Stx1a
20907
-271
RPB1
Stx1a
20907
-246
RUNX2
Stx1a
20907
-368
RUNX2
Stx1a
20907
-292
RUNX2
Stx1a
20907
-268
RYBP
Stx1a
20907
-276
SALL4
Stx1a
20907
-276
SIN3A
Stx1a
20907
-312
SIN3A
Stx1a
20907
-297
SIN3A
Stx1a
20907
-190
SIN3A
Stx1a
20907
-169
SIN3A
Stx1a
20907
-19
SIR6
Stx1a
20907
91
SMAD3
Stx1a
20907
-181
SMC5
Stx1a
20907
192
SMCA4
Stx1a
20907
-286
SMCA4
Stx1a
20907
-272
SMCA4
Stx1a
20907
53
SMCA4
Stx1a
20907
157
SMCA4
Stx1a
20907
165
SOX2
Stx1a
20907
-187
SOX2
Stx1a
20907
-179
SOX2
Stx1a
20907
-25
SOX3
Stx1a
20907
-157
SPI1
Stx1a
20907
-573
SPI1
Stx1a
20907
-556
SPI1
Stx1a
20907
-512
SPI1
Stx1a
20907
-474
SPI1
Stx1a
20907
-423
SPI1
Stx1a
20907
-395
SPI1
Stx1a
20907
-369
SPI1
Stx1a
20907
-347
SPI1
Stx1a
20907
-318
SPI1
Stx1a
20907
-312
SPI1
Stx1a
20907
-306
SPI1
Stx1a
20907
-298
SPI1
Stx1a
20907
-297
SPI1
Stx1a
20907
-289
SPI1
Stx1a
20907
-286
SPI1
Stx1a
20907
-278
SPI1
Stx1a
20907
-226
SPI1
Stx1a
20907
-211
SPI1
Stx1a
20907
50
SPI1
Stx1a
20907
66
SPI1
Stx1a
20907
93
SPI1
Stx1a
20907
105
SPI1
Stx1a
20907
110
SPI1
Stx1a
20907
164
SPT5H
Stx1a
20907
-551
SPT5H
Stx1a
20907
-267
SPT5H
Stx1a
20907
-205
SPT5H
Stx1a
20907
-33
SRBP1
Stx1a
20907
-253
STAT1
Stx1a
20907
-196
STAT1
Stx1a
20907
-140
STAT3
Stx1a
20907
-129
STAT4
Stx1a
20907
78
SUZ12
Stx1a
20907
-464
SUZ12
Stx1a
20907
-206
SUZ12
Stx1a
20907
-154
SUZ12
Stx1a
20907
-108
SUZ12
Stx1a
20907
-36
SUZ12
Stx1a
20907
-10
SUZ12
Stx1a
20907
-9
SUZ12
Stx1a
20907
-6
SUZ12
Stx1a
20907
5
SUZ12
Stx1a
20907
16
SUZ12
Stx1a
20907
59
SUZ12
Stx1a
20907
68
TAF3
Stx1a
20907
-113
TAF3
Stx1a
20907
-107
TAF3
Stx1a
20907
-91
TBP
Stx1a
20907
-349
TBP
Stx1a
20907
-347
TBP
Stx1a
20907
-220
TBP
Stx1a
20907
-79
TBP
Stx1a
20907
-58
TDG
Stx1a
20907
-814
TET1
Stx1a
20907
-206
TET1
Stx1a
20907
-155
TF2B
Stx1a
20907
-235
TF2B
Stx1a
20907
-65
TFAP4
Stx1a
20907
-249
TFE2
Stx1a
20907
-276
TIF1B
Stx1a
20907
-519
TIF1B
Stx1a
20907
-427
UBF1
Stx1a
20907
-64
UTF1
Stx1a
20907
-359
UTF1
Stx1a
20907
-157
WDR5
Stx1a
20907
-15
WT1
Stx1a
20907
-276
ZBT17
Stx1a
20907
-271
ZMIZ1
Stx1a
20907
-109
SALL4
Stx1a
20907
-276.00
SIN3A
Stx1a
20907
-169.00
SIN3A
Stx1a
20907
-19.00
SMAD3
Stx1a
20907
-181.00
SMC5
Stx1a
20907
192.00
SMCA4
Stx1a
20907
53.00
SOX2
Stx1a
20907
-187.00
SOX2
Stx1a
20907
-179.00
SPI1
Stx1a
20907
-573.00
SPI1
Stx1a
20907
-556.00
SPI1
Stx1a
20907
-512.00
SPI1
Stx1a
20907
-474.00
SPI1
Stx1a
20907
-423.00
SPI1
Stx1a
20907
-395.00
SPI1
Stx1a
20907
-369.00
SPI1
Stx1a
20907
-347.00
SPI1
Stx1a
20907
-318.00
SPI1
Stx1a
20907
-312.00
SPI1
Stx1a
20907
-306.00
SPI1
Stx1a
20907
-298.00
SPI1
Stx1a
20907
-297.00
SPI1
Stx1a
20907
-289.00
SPI1
Stx1a
20907
-211.00
SPI1
Stx1a
20907
66.00
SPI1
Stx1a
20907
93.00
SPI1
Stx1a
20907
105.00
SPI1
Stx1a
20907
110.00
SPI1
Stx1a
20907
164.00
SPT5H
Stx1a
20907
-551.00
SPT5H
Stx1a
20907
-267.00
SPT5H
Stx1a
20907
-205.00
SPT5H
Stx1a
20907
-33.00
STAT1
Stx1a
20907
-196.00
STAT3
Stx1a
20907
-129.00
STAT4
Stx1a
20907
78.00
SUZ12
Stx1a
20907
-10.00
SUZ12
Stx1a
20907
-9.00
SUZ12
Stx1a
20907
5.00
SUZ12
Stx1a
20907
16.00
SUZ12
Stx1a
20907
59.00
TAF3
Stx1a
20907
-91.00
TBP
Stx1a
20907
-220.00
TBP
Stx1a
20907
-79.00
TBP
Stx1a
20907
-58.00
TET1
Stx1a
20907
-206.00
TET1
Stx1a
20907
-155.00
TFE2
Stx1a
20907
-276.00
TIF1B
Stx1a
20907
-519.00
WDR5
Stx1a
20907
-15.00
WT1
Stx1a
20907
-276.00
Additional Information about the Gene
Expression1
Allen Brain Atlas
BGEM
EMAGE
GeneNote
genepaint
GNF Symatlas
GENSAT
Expression2
AceView
HGNC Expression
UCSC
GEO
ArrayExpress
Cleanex
Function
AMIGO
MIPS
Panther
Uniport
Genecards
InterPro
IHOP
Gene Regulation
MicroRNA target
TRED
Pathways
Biocarta Pathways CGAP SAGE
KEGG Pathways
EBI
Sequences
NCBI
Ensembl
MGI Information
QTL
Harvester
Howdy
Interactions
MIMI
EBI
Nature-NCI
string
IHOP
Tools Links
Sequence Manipulation
Genes and Transcripts
Micoroarray Analysis
Literature Search
Protein
Databases
Functional Analysis
Transcription Factor Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
Target Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9