Transcription Factors and their targets
Search Term:
TF
TargetGene
TargetGeneID
Home
Gene List
TF list
Protocol
Contact
TF
Target
Gene ID
Distance From TSS
BATF
Otx1
18423
-826.00
BATF
Otx1
18423
-807.00
BATF
Otx1
18423
-793.00
BATF
Otx1
18423
-755.00
BATF
Otx1
18423
-683.00
BATF
Otx1
18423
-391.00
BMI1
Otx1
18423
-159.00
CBP
Otx1
18423
-334.00
CBX3
Otx1
18423
-282.00
CBX3
Otx1
18423
100.00
CBX7
Otx1
18423
-139.00
CDX2
Otx1
18423
178.00
CEBPB
Otx1
18423
21.00
CHD4
Otx1
18423
-958.00
CHD4
Otx1
18423
-518.00
CHD4
Otx1
18423
-432.00
CHD4
Otx1
18423
-270.00
COE1
Otx1
18423
-862.00
COE1
Otx1
18423
140.00
CTCF
Otx1
18423
-709.00
CTCF
Otx1
18423
96.00
CTNB1
Otx1
18423
-947.00
DMRT1
Otx1
18423
-428.00
E2F3
Otx1
18423
-240.00
E2F3
Otx1
18423
-60.00
E2F4
Otx1
18423
-538.00
EED
Otx1
18423
-719.00
EP300
Otx1
18423
-838.00
EP300
Otx1
18423
-813.00
EP300
Otx1
18423
-812.00
EP300
Otx1
18423
-802.00
EP300
Otx1
18423
-796.00
EP300
Otx1
18423
-775.00
EP300
Otx1
18423
-747.00
EP300
Otx1
18423
-740.00
EP300
Otx1
18423
-739.00
EP300
Otx1
18423
-735.00
EP300
Otx1
18423
-720.00
EP300
Otx1
18423
-716.00
EP300
Otx1
18423
-679.00
EP300
Otx1
18423
-658.00
EP300
Otx1
18423
-643.00
EP300
Otx1
18423
-398.00
EP300
Otx1
18423
-355.00
EP300
Otx1
18423
-223.00
EP300
Otx1
18423
-138.00
EP300
Otx1
18423
98.00
EP400
Otx1
18423
-920.00
ESR1
Otx1
18423
-692.00
ESR1
Otx1
18423
-540.00
ESR1
Otx1
18423
-221.00
ESR1
Otx1
18423
-180.00
EZH1
Otx1
18423
-141.00
EZH2
Otx1
18423
-929.00
EZH2
Otx1
18423
-915.00
EZH2
Otx1
18423
-339.00
EZH2
Otx1
18423
-252.00
EZH2
Otx1
18423
-243.00
EZH2
Otx1
18423
-223.00
EZH2
Otx1
18423
-205.00
EZH2
Otx1
18423
-187.00
EZH2
Otx1
18423
-186.00
EZH2
Otx1
18423
-169.00
EZH2
Otx1
18423
-166.00
EZH2
Otx1
18423
-134.00
EZH2
Otx1
18423
94.00
FOSL2
Otx1
18423
-768.00
HCFC1
Otx1
18423
-720.00
HELLS
Otx1
18423
-160.00
HELLS
Otx1
18423
40.00
HXA2
Otx1
18423
129.00
HXB4
Otx1
18423
82.00
HXB4
Otx1
18423
108.00
HXB4
Otx1
18423
176.00
IKZF1
Otx1
18423
-353.00
IRF4
Otx1
18423
-856.00
IRF4
Otx1
18423
-807.00
IRF4
Otx1
18423
-774.00
IRF4
Otx1
18423
-683.00
IRF4
Otx1
18423
-598.00
IRF4
Otx1
18423
-569.00
IRF4
Otx1
18423
-541.00
IRF4
Otx1
18423
-524.00
IRF4
Otx1
18423
-496.00
IRF4
Otx1
18423
-426.00
IRF4
Otx1
18423
-425.00
IRF4
Otx1
18423
-402.00
IRF4
Otx1
18423
-355.00
IRF4
Otx1
18423
-330.00
ISL1
Otx1
18423
55.00
JARD2
Otx1
18423
-922.00
JARD2
Otx1
18423
-904.00
JARD2
Otx1
18423
-902.00
JARD2
Otx1
18423
-880.00
JARD2
Otx1
18423
-654.00
JARD2
Otx1
18423
-507.00
JARD2
Otx1
18423
-506.00
JARD2
Otx1
18423
-373.00
JARD2
Otx1
18423
-237.00
JARD2
Otx1
18423
-212.00
JARD2
Otx1
18423
-204.00
JARD2
Otx1
18423
-118.00
JUND
Otx1
18423
-768.00
JUND
Otx1
18423
-421.00
KDM1A
Otx1
18423
-239.00
KDM2A
Otx1
18423
-340.00
KDM2B
Otx1
18423
-865.00
KDM2B
Otx1
18423
-689.00
KDM2B
Otx1
18423
-346.00
KDM2B
Otx1
18423
-211.00
KDM2B
Otx1
18423
-198.00
KDM2B
Otx1
18423
-169.00
KDM2B
Otx1
18423
161.00
KDM4C
Otx1
18423
-205.00
KDM6B
Otx1
18423
-249.00
KLF2
Otx1
18423
-932.00
KLF2
Otx1
18423
-838.00
KLF3
Otx1
18423
-101.00
KLF4
Otx1
18423
121.00
KLF5
Otx1
18423
-838.00
KMT2B
Otx1
18423
187.00
KMT2C
Otx1
18423
-696.00
KMT2C
Otx1
18423
178.00
KMT2D
Otx1
18423
-502.00
KMT2D
Otx1
18423
-421.00
KMT2D
Otx1
18423
-358.00
KMT2D
Otx1
18423
-292.00
KMT2D
Otx1
18423
-194.00
KMT2D
Otx1
18423
-151.00
KMT2D
Otx1
18423
13.00
LDB1
Otx1
18423
-448.00
LHX3
Otx1
18423
44.00
MAF
Otx1
18423
-996.00
MEIS1
Otx1
18423
131.00
MEIS1
Otx1
18423
136.00
MYBA
Otx1
18423
-252.00
MYOD1
Otx1
18423
-487.00
MYOG
Otx1
18423
-318.00
NANOG
Otx1
18423
121.00
NANOG
Otx1
18423
168.00
NELFB
Otx1
18423
-182.00
NELFB
Otx1
18423
139.00
NFIB
Otx1
18423
-311.00
NOTC1
Otx1
18423
-341.00
OGT1
Otx1
18423
-413.00
PBX1
Otx1
18423
72.00
PHF19
Otx1
18423
-174.00
PKNX2
Otx1
18423
39.00
PO5F1
Otx1
18423
-773.00
PO5F1
Otx1
18423
-699.00
PO5F1
Otx1
18423
-558.00
PO5F1
Otx1
18423
-304.00
PO5F1
Otx1
18423
-32.00
PO5F1
Otx1
18423
-26.00
PO5F1
Otx1
18423
-14.00
PO5F1
Otx1
18423
-2.00
PO5F1
Otx1
18423
164.00
PO5F1
Otx1
18423
177.00
PPARG
Otx1
18423
-452.00
PPARG
Otx1
18423
-232.00
PPARG
Otx1
18423
-194.00
PPARG
Otx1
18423
-188.00
PPARG
Otx1
18423
-132.00
RFX1
Otx1
18423
-326.00
RING2
Otx1
18423
-962.00
RING2
Otx1
18423
-922.00
RING2
Otx1
18423
-917.00
RING2
Otx1
18423
-912.00
RING2
Otx1
18423
-844.00
RING2
Otx1
18423
-619.00
RING2
Otx1
18423
-404.00
RING2
Otx1
18423
-396.00
RING2
Otx1
18423
-249.00
RING2
Otx1
18423
-248.00
RING2
Otx1
18423
-247.00
RING2
Otx1
18423
-204.00
RING2
Otx1
18423
-200.00
RING2
Otx1
18423
-190.00
RING2
Otx1
18423
-186.00
RING2
Otx1
18423
-166.00
RYBP
Otx1
18423
-768.00
RPB1
Otx1
18423
-813
RPB1
Otx1
18423
-195
RPB1
Otx1
18423
42
RPB1
Otx1
18423
173
RUNX2
Otx1
18423
-963
RUNX2
Otx1
18423
1
RUNX2
Otx1
18423
132
RUNX2
Otx1
18423
175
RYBP
Otx1
18423
-768
SALL4
Otx1
18423
-538
SIN3A
Otx1
18423
-538
SIN3A
Otx1
18423
-404
SIN3A
Otx1
18423
-171
SIN3B
Otx1
18423
-656
SIX1
Otx1
18423
-768
SMAD3
Otx1
18423
-150
SMBT1
Otx1
18423
-249
SMC1A
Otx1
18423
-196
SMC3
Otx1
18423
-691
SMCA4
Otx1
18423
-909
SMCA4
Otx1
18423
-765
SMCA4
Otx1
18423
-597
SMCA4
Otx1
18423
-537
SMCA4
Otx1
18423
-483
SMCA4
Otx1
18423
-471
SMCA4
Otx1
18423
-369
SMCA4
Otx1
18423
-256
SMCA4
Otx1
18423
-207
SMCA4
Otx1
18423
-28
SOX17
Otx1
18423
-923
SOX2
Otx1
18423
-590
SOX2
Otx1
18423
-522
SOX2
Otx1
18423
-260
SOX2
Otx1
18423
81
SRF
Otx1
18423
-332
SRF
Otx1
18423
82
STA5B
Otx1
18423
-234
STAT4
Otx1
18423
-644
SUH
Otx1
18423
-283
SUZ12
Otx1
18423
-933
SUZ12
Otx1
18423
-925
SUZ12
Otx1
18423
-895
SUZ12
Otx1
18423
-890
SUZ12
Otx1
18423
-861
SUZ12
Otx1
18423
-855
SUZ12
Otx1
18423
-850
SUZ12
Otx1
18423
-810
SUZ12
Otx1
18423
-663
SUZ12
Otx1
18423
-653
SUZ12
Otx1
18423
-617
SUZ12
Otx1
18423
-605
SUZ12
Otx1
18423
-588
SUZ12
Otx1
18423
-565
SUZ12
Otx1
18423
-544
SUZ12
Otx1
18423
-462
SUZ12
Otx1
18423
-453
SUZ12
Otx1
18423
-451
SUZ12
Otx1
18423
-356
SUZ12
Otx1
18423
-331
SUZ12
Otx1
18423
-297
SUZ12
Otx1
18423
-286
SUZ12
Otx1
18423
-276
SUZ12
Otx1
18423
-269
SUZ12
Otx1
18423
-249
SUZ12
Otx1
18423
-234
SUZ12
Otx1
18423
-230
SUZ12
Otx1
18423
-225
SUZ12
Otx1
18423
-218
SUZ12
Otx1
18423
-216
SUZ12
Otx1
18423
-206
SUZ12
Otx1
18423
-205
SUZ12
Otx1
18423
-204
SUZ12
Otx1
18423
-198
SUZ12
Otx1
18423
-195
SUZ12
Otx1
18423
-191
SUZ12
Otx1
18423
-189
SUZ12
Otx1
18423
-180
SUZ12
Otx1
18423
-171
SUZ12
Otx1
18423
-166
SUZ12
Otx1
18423
-162
SUZ12
Otx1
18423
-161
SUZ12
Otx1
18423
-6
SUZ12
Otx1
18423
177
SUZ12
Otx1
18423
193
TAF3
Otx1
18423
-470
TAF3
Otx1
18423
-256
TAF7L
Otx1
18423
-197
TBP
Otx1
18423
-594
TBP
Otx1
18423
-165
TBP
Otx1
18423
121
TBX3
Otx1
18423
-347
TBX5
Otx1
18423
-183
TCF7
Otx1
18423
-538
TDG
Otx1
18423
27
TET1
Otx1
18423
-335
TET1
Otx1
18423
-326
TET1
Otx1
18423
-323
TET1
Otx1
18423
-314
TET1
Otx1
18423
51
TET1
Otx1
18423
170
TF2B
Otx1
18423
-216
TF2L1
Otx1
18423
-208
TF2L1
Otx1
18423
174
TFAP4
Otx1
18423
-281
TIF1B
Otx1
18423
-58
UTF1
Otx1
18423
-250
WT1
Otx1
18423
-564
WT1
Otx1
18423
157
ZBT17
Otx1
18423
-510
ZBT17
Otx1
18423
-470
ZBT17
Otx1
18423
-322
ZBT17
Otx1
18423
-182
ZIC2
Otx1
18423
-525
ZIC2
Otx1
18423
-401
SALL4
Otx1
18423
-538.00
SIN3A
Otx1
18423
-538.00
SIN3A
Otx1
18423
-404.00
SIN3B
Otx1
18423
-656.00
SIX1
Otx1
18423
-768.00
SMAD3
Otx1
18423
-150.00
SMBT1
Otx1
18423
-249.00
SMC1A
Otx1
18423
-196.00
SMC3
Otx1
18423
-691.00
SMCA4
Otx1
18423
-765.00
SMCA4
Otx1
18423
-471.00
SMCA4
Otx1
18423
-207.00
SMCA4
Otx1
18423
-28.00
SOX17
Otx1
18423
-923.00
SOX2
Otx1
18423
-590.00
SOX2
Otx1
18423
-522.00
SRF
Otx1
18423
-332.00
SRF
Otx1
18423
82.00
STA5B
Otx1
18423
-234.00
STAT4
Otx1
18423
-644.00
SUH
Otx1
18423
-283.00
SUZ12
Otx1
18423
-933.00
SUZ12
Otx1
18423
-925.00
SUZ12
Otx1
18423
-895.00
SUZ12
Otx1
18423
-855.00
SUZ12
Otx1
18423
-850.00
SUZ12
Otx1
18423
-810.00
SUZ12
Otx1
18423
-663.00
SUZ12
Otx1
18423
-653.00
SUZ12
Otx1
18423
-617.00
SUZ12
Otx1
18423
-605.00
SUZ12
Otx1
18423
-588.00
SUZ12
Otx1
18423
-565.00
SUZ12
Otx1
18423
-544.00
SUZ12
Otx1
18423
-453.00
SUZ12
Otx1
18423
-451.00
SUZ12
Otx1
18423
-356.00
SUZ12
Otx1
18423
-297.00
SUZ12
Otx1
18423
-286.00
SUZ12
Otx1
18423
-276.00
SUZ12
Otx1
18423
-269.00
SUZ12
Otx1
18423
-218.00
SUZ12
Otx1
18423
-216.00
SUZ12
Otx1
18423
-206.00
SUZ12
Otx1
18423
-205.00
SUZ12
Otx1
18423
-204.00
SUZ12
Otx1
18423
-166.00
SUZ12
Otx1
18423
-162.00
SUZ12
Otx1
18423
-6.00
SUZ12
Otx1
18423
193.00
TAF3
Otx1
18423
-256.00
TAF7L
Otx1
18423
-197.00
TBP
Otx1
18423
-594.00
TBP
Otx1
18423
-165.00
TBP
Otx1
18423
121.00
TBX3
Otx1
18423
-347.00
TBX5
Otx1
18423
-183.00
TCF7
Otx1
18423
-538.00
TET1
Otx1
18423
-335.00
TET1
Otx1
18423
-326.00
TET1
Otx1
18423
-323.00
TET1
Otx1
18423
-314.00
TET1
Otx1
18423
51.00
TET1
Otx1
18423
170.00
TF2L1
Otx1
18423
-208.00
TF2L1
Otx1
18423
174.00
Additional Information about the Gene
Expression1
Allen Brain Atlas
BGEM
EMAGE
GeneNote
genepaint
GNF Symatlas
GENSAT
Expression2
AceView
HGNC Expression
UCSC
GEO
ArrayExpress
Cleanex
Function
AMIGO
MIPS
Panther
Uniport
Genecards
InterPro
IHOP
Gene Regulation
MicroRNA target
TRED
Pathways
Biocarta Pathways CGAP SAGE
KEGG Pathways
EBI
Sequences
NCBI
Ensembl
MGI Information
QTL
Harvester
Howdy
Interactions
MIMI
EBI
Nature-NCI
string
IHOP
Tools Links
Sequence Manipulation
Genes and Transcripts
Micoroarray Analysis
Literature Search
Protein
Databases
Functional Analysis
Transcription Factor Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
Target Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9