Transcription Factors and their targets
Search Term:
TF
TargetGene
TargetGeneID
Home
Gene List
TF list
Protocol
Contact
TF
Target
Gene ID
Distance From TSS
ASH2L
Nme6
54369
-179.00
BAP1
Nme6
54369
-730.00
BATF
Nme6
54369
-224.00
BATF
Nme6
54369
-32.00
BATF
Nme6
54369
6.00
BATF
Nme6
54369
65.00
CBX3
Nme6
54369
-354.00
CCND1
Nme6
54369
15.00
CEBPA
Nme6
54369
-82.00
CHD4
Nme6
54369
-47.00
COE1
Nme6
54369
189.00
CTCF
Nme6
54369
-760.00
CTCF
Nme6
54369
-751.00
CTCF
Nme6
54369
-744.00
CTCF
Nme6
54369
-731.00
CTCF
Nme6
54369
-730.00
CTCF
Nme6
54369
-647.00
CTCF
Nme6
54369
-633.00
CTCF
Nme6
54369
-630.00
CTCF
Nme6
54369
-599.00
CTCF
Nme6
54369
-581.00
CTCF
Nme6
54369
-550.00
CTCF
Nme6
54369
-533.00
CTCF
Nme6
54369
-508.00
CTCF
Nme6
54369
-507.00
CTCF
Nme6
54369
-500.00
CTCF
Nme6
54369
-494.00
CTCF
Nme6
54369
-490.00
CTCF
Nme6
54369
-467.00
CTCF
Nme6
54369
-442.00
CTCF
Nme6
54369
-440.00
CTCF
Nme6
54369
-428.00
CTCF
Nme6
54369
-414.00
CTCF
Nme6
54369
-406.00
CTCFL
Nme6
54369
-402.00
E2F4
Nme6
54369
15.00
E2F4
Nme6
54369
199.00
EGR1
Nme6
54369
60.00
EGR1
Nme6
54369
186.00
EGR2
Nme6
54369
20.00
EGR2
Nme6
54369
28.00
EGR2
Nme6
54369
120.00
EGR2
Nme6
54369
146.00
EP300
Nme6
54369
-382.00
EP300
Nme6
54369
-367.00
EP300
Nme6
54369
-325.00
EP300
Nme6
54369
-319.00
EP300
Nme6
54369
-271.00
EP300
Nme6
54369
-203.00
EP300
Nme6
54369
-198.00
EP300
Nme6
54369
-139.00
EP300
Nme6
54369
-29.00
EP300
Nme6
54369
83.00
EP300
Nme6
54369
87.00
EP300
Nme6
54369
161.00
EP300
Nme6
54369
167.00
EP300
Nme6
54369
169.00
EP300
Nme6
54369
197.00
FOSL2
Nme6
54369
133.00
FOSL2
Nme6
54369
154.00
FOXA1
Nme6
54369
-566.00
FOXA1
Nme6
54369
-523.00
FOXO1
Nme6
54369
-345.00
IKZF1
Nme6
54369
-421.00
IKZF1
Nme6
54369
-169.00
IKZF1
Nme6
54369
-131.00
IRF1
Nme6
54369
-355.00
IRF4
Nme6
54369
-518.00
IRF4
Nme6
54369
-499.00
IRF4
Nme6
54369
-477.00
IRF4
Nme6
54369
-471.00
IRF4
Nme6
54369
-464.00
IRF4
Nme6
54369
-452.00
IRF4
Nme6
54369
-443.00
IRF4
Nme6
54369
-422.00
IRF4
Nme6
54369
-416.00
IRF4
Nme6
54369
-415.00
IRF4
Nme6
54369
-407.00
IRF4
Nme6
54369
-397.00
IRF4
Nme6
54369
-359.00
IRF4
Nme6
54369
-261.00
IRF4
Nme6
54369
-130.00
IRF4
Nme6
54369
-56.00
IRF4
Nme6
54369
179.00
IRF4
Nme6
54369
180.00
JUN
Nme6
54369
171.00
JUNB
Nme6
54369
-361.00
JUND
Nme6
54369
-25.00
KAT8
Nme6
54369
7.00
KAT8
Nme6
54369
177.00
KDM5A
Nme6
54369
-416.00
KLF4
Nme6
54369
92.00
KMT2D
Nme6
54369
-133.00
KMT2D
Nme6
54369
-125.00
MAF
Nme6
54369
-175.00
MBD1
Nme6
54369
10.00
MED1
Nme6
54369
-286.00
MED1
Nme6
54369
-180.00
MED1
Nme6
54369
2.00
MEIS1
Nme6
54369
62.00
MYC
Nme6
54369
-144.00
MYC
Nme6
54369
92.00
MYC
Nme6
54369
151.00
NANOG
Nme6
54369
92.00
NDF2
Nme6
54369
-455.00
NR1D2
Nme6
54369
-134.00
NR1D2
Nme6
54369
145.00
P53
Nme6
54369
-517.00
PAX5
Nme6
54369
-178.00
PIT1
Nme6
54369
-327.00
PO5F1
Nme6
54369
-820.00
PO5F1
Nme6
54369
-146.00
PO5F1
Nme6
54369
-132.00
PO5F1
Nme6
54369
-129.00
PO5F1
Nme6
54369
92.00
PO5F1
Nme6
54369
156.00
PO5F1
Nme6
54369
168.00
PPARG
Nme6
54369
-254.00
PPARG
Nme6
54369
-171.00
PPARG
Nme6
54369
-154.00
PPARG
Nme6
54369
-145.00
PPARG
Nme6
54369
142.00
RAD21
Nme6
54369
-765.00
RARA
Nme6
54369
-538.00
RARA
Nme6
54369
-224.00
RARB
Nme6
54369
-668.00
RARB
Nme6
54369
-335.00
RFX1
Nme6
54369
78.00
RING1
Nme6
54369
15.00
RING2
Nme6
54369
15.00
RXRA
Nme6
54369
-558.00
RXRA
Nme6
54369
-555.00
RXRA
Nme6
54369
155.00
RYBP
Nme6
54369
15.00
RPB1
Nme6
54369
-620
RPB1
Nme6
54369
-612
RPB1
Nme6
54369
-609
RPB1
Nme6
54369
-604
RPB1
Nme6
54369
-603
RPB1
Nme6
54369
-601
RPB1
Nme6
54369
-591
RPB1
Nme6
54369
-583
RPB1
Nme6
54369
-580
RPB1
Nme6
54369
-568
RUNX1
Nme6
54369
-129
RUNX1
Nme6
54369
21
RXRA
Nme6
54369
-558
RXRA
Nme6
54369
-555
RXRA
Nme6
54369
155
RYBP
Nme6
54369
15
SIN3A
Nme6
54369
-210
SIN3A
Nme6
54369
-1
SIN3A
Nme6
54369
15
SIN3A
Nme6
54369
177
SIN3B
Nme6
54369
-553
SIN3B
Nme6
54369
-473
SIN3B
Nme6
54369
-10
SIN3B
Nme6
54369
15
SIR1
Nme6
54369
163
SMAD3
Nme6
54369
-268
SMBT1
Nme6
54369
-267
SMC1A
Nme6
54369
-783
SMC1A
Nme6
54369
-708
SMC1A
Nme6
54369
-584
SMC1A
Nme6
54369
-555
SMC1A
Nme6
54369
-519
SMC3
Nme6
54369
-773
SMC3
Nme6
54369
-728
SMC3
Nme6
54369
-675
SMC3
Nme6
54369
-595
SMC3
Nme6
54369
-585
SMCA4
Nme6
54369
-147
SMCA4
Nme6
54369
-120
SMCA4
Nme6
54369
153
SMCA4
Nme6
54369
182
SOX2
Nme6
54369
-124
SOX2
Nme6
54369
92
SPI1
Nme6
54369
-89
SPI1
Nme6
54369
-75
SPI1
Nme6
54369
8
SPI1
Nme6
54369
35
SPI1
Nme6
54369
61
SPI1
Nme6
54369
65
SPI1
Nme6
54369
68
SPI1
Nme6
54369
74
SPI1
Nme6
54369
75
SPI1
Nme6
54369
79
SPI1
Nme6
54369
83
SPI1
Nme6
54369
86
SPI1
Nme6
54369
95
SPI1
Nme6
54369
99
SPI1
Nme6
54369
105
SPI1
Nme6
54369
106
SPI1
Nme6
54369
107
SPI1
Nme6
54369
111
SPI1
Nme6
54369
112
SPI1
Nme6
54369
114
SPI1
Nme6
54369
115
SPI1
Nme6
54369
118
SPI1
Nme6
54369
119
SPI1
Nme6
54369
126
SPI1
Nme6
54369
129
SPI1
Nme6
54369
132
SPI1
Nme6
54369
133
SPI1
Nme6
54369
137
SPI1
Nme6
54369
140
SPI1
Nme6
54369
142
SPI1
Nme6
54369
146
SPI1
Nme6
54369
160
SPI1
Nme6
54369
162
SPI1
Nme6
54369
166
SPI1
Nme6
54369
169
SPI1
Nme6
54369
170
SPT5H
Nme6
54369
-287
STA5A
Nme6
54369
192
STA5B
Nme6
54369
-20
STAG1
Nme6
54369
-482
STAT1
Nme6
54369
-509
STAT1
Nme6
54369
-330
STAT1
Nme6
54369
148
STAT3
Nme6
54369
-78
STAT3
Nme6
54369
88
STAT6
Nme6
54369
-534
STAT6
Nme6
54369
133
SUZ12
Nme6
54369
-415
SUZ12
Nme6
54369
5
T2EB
Nme6
54369
-236
T2EB
Nme6
54369
-80
TAF3
Nme6
54369
-324
TAF9B
Nme6
54369
107
TBP
Nme6
54369
-30
TCF7
Nme6
54369
-135
TET1
Nme6
54369
103
TET1
Nme6
54369
169
TET1
Nme6
54369
173
TF2B
Nme6
54369
-150
TF2B
Nme6
54369
-133
TF65
Nme6
54369
-273
TF65
Nme6
54369
-135
TF65
Nme6
54369
-117
TF65
Nme6
54369
-88
TF65
Nme6
54369
135
TF65
Nme6
54369
138
TF65
Nme6
54369
143
TF65
Nme6
54369
151
TF65
Nme6
54369
154
TFAP4
Nme6
54369
-697
TFE2
Nme6
54369
-163
TFE2
Nme6
54369
15
TFE3
Nme6
54369
66
TFE3
Nme6
54369
75
TGIF1
Nme6
54369
-86
TGIF1
Nme6
54369
127
TGIF1
Nme6
54369
154
THB
Nme6
54369
-121
TIF1B
Nme6
54369
-467
USF1
Nme6
54369
119
USF2
Nme6
54369
-624
USF2
Nme6
54369
55
WT1
Nme6
54369
-92
WT1
Nme6
54369
15
ZN335
Nme6
54369
-485
ZN335
Nme6
54369
-200
SIN3A
Nme6
54369
-210.00
SIN3A
Nme6
54369
-1.00
SIN3A
Nme6
54369
15.00
SIN3A
Nme6
54369
177.00
SIN3B
Nme6
54369
-553.00
SIN3B
Nme6
54369
-473.00
SIN3B
Nme6
54369
-10.00
SIN3B
Nme6
54369
15.00
SIR1
Nme6
54369
163.00
SMAD3
Nme6
54369
-268.00
SMBT1
Nme6
54369
-267.00
SMC1A
Nme6
54369
-783.00
SMC1A
Nme6
54369
-708.00
SMC1A
Nme6
54369
-584.00
SMC1A
Nme6
54369
-555.00
SMC1A
Nme6
54369
-519.00
SMC3
Nme6
54369
-773.00
SMC3
Nme6
54369
-728.00
SMC3
Nme6
54369
-675.00
SMC3
Nme6
54369
-595.00
SMC3
Nme6
54369
-585.00
SMCA4
Nme6
54369
-147.00
SMCA4
Nme6
54369
-120.00
SMCA4
Nme6
54369
153.00
SMCA4
Nme6
54369
182.00
SOX2
Nme6
54369
-124.00
SOX2
Nme6
54369
92.00
SPI1
Nme6
54369
-89.00
SPI1
Nme6
54369
-75.00
SPI1
Nme6
54369
35.00
SPI1
Nme6
54369
61.00
SPI1
Nme6
54369
68.00
SPI1
Nme6
54369
75.00
SPI1
Nme6
54369
79.00
SPI1
Nme6
54369
83.00
SPI1
Nme6
54369
86.00
SPI1
Nme6
54369
95.00
SPI1
Nme6
54369
99.00
SPI1
Nme6
54369
105.00
SPI1
Nme6
54369
107.00
SPI1
Nme6
54369
111.00
SPI1
Nme6
54369
112.00
SPI1
Nme6
54369
114.00
SPI1
Nme6
54369
115.00
SPI1
Nme6
54369
119.00
SPI1
Nme6
54369
126.00
SPI1
Nme6
54369
129.00
SPI1
Nme6
54369
132.00
SPI1
Nme6
54369
137.00
SPI1
Nme6
54369
140.00
SPI1
Nme6
54369
142.00
SPI1
Nme6
54369
146.00
SPI1
Nme6
54369
160.00
SPI1
Nme6
54369
162.00
SPI1
Nme6
54369
169.00
SPI1
Nme6
54369
170.00
SPT5H
Nme6
54369
-287.00
STA5A
Nme6
54369
192.00
STA5B
Nme6
54369
-20.00
STAG1
Nme6
54369
-482.00
STAT1
Nme6
54369
-509.00
STAT1
Nme6
54369
148.00
STAT3
Nme6
54369
-78.00
STAT3
Nme6
54369
88.00
STAT6
Nme6
54369
-534.00
STAT6
Nme6
54369
133.00
SUZ12
Nme6
54369
5.00
TAF3
Nme6
54369
-324.00
TCF7
Nme6
54369
-135.00
TET1
Nme6
54369
103.00
TET1
Nme6
54369
169.00
TET1
Nme6
54369
173.00
TF65
Nme6
54369
-273.00
TF65
Nme6
54369
-135.00
TF65
Nme6
54369
-117.00
TF65
Nme6
54369
-88.00
TF65
Nme6
54369
135.00
TF65
Nme6
54369
151.00
TFE2
Nme6
54369
15.00
TFE3
Nme6
54369
66.00
TFE3
Nme6
54369
75.00
USF1
Nme6
54369
119.00
WT1
Nme6
54369
15.00
Additional Information about the Gene
Expression1
Allen Brain Atlas
BGEM
EMAGE
GeneNote
genepaint
GNF Symatlas
GENSAT
Expression2
AceView
HGNC Expression
UCSC
GEO
ArrayExpress
Cleanex
Function
AMIGO
MIPS
Panther
Uniport
Genecards
InterPro
IHOP
Gene Regulation
MicroRNA target
TRED
Pathways
Biocarta Pathways CGAP SAGE
KEGG Pathways
EBI
Sequences
NCBI
Ensembl
MGI Information
QTL
Harvester
Howdy
Interactions
MIMI
EBI
Nature-NCI
string
IHOP
Tools Links
Sequence Manipulation
Genes and Transcripts
Micoroarray Analysis
Literature Search
Protein
Databases
Functional Analysis
Transcription Factor Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
Target Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9