Transcription Factors and their targets
Search Term:
TF
TargetGene
TargetGeneID
Home
Gene List
TF list
Protocol
Contact
TF
Target
Gene ID
Distance From TSS
AICDA
Nme3
79059
-755.00
AICDA
Nme3
79059
-377.00
BATF
Nme3
79059
-477.00
BATF
Nme3
79059
-455.00
BATF
Nme3
79059
-443.00
BATF
Nme3
79059
-406.00
BATF
Nme3
79059
-387.00
BATF
Nme3
79059
-157.00
BCL6
Nme3
79059
-451.00
CBX3
Nme3
79059
-254.00
CBX3
Nme3
79059
176.00
CDK8
Nme3
79059
-184.00
CDK9
Nme3
79059
-160.00
CEBPA
Nme3
79059
-256.00
CEBPB
Nme3
79059
-249.00
CEBPB
Nme3
79059
-234.00
CEBPB
Nme3
79059
-180.00
CEBPB
Nme3
79059
-131.00
CEBPB
Nme3
79059
-126.00
CREB1
Nme3
79059
-501.00
CTCF
Nme3
79059
-344.00
CTCF
Nme3
79059
-310.00
CTCF
Nme3
79059
-298.00
CTCF
Nme3
79059
-294.00
CTCF
Nme3
79059
-269.00
CTCF
Nme3
79059
-267.00
CTCF
Nme3
79059
-264.00
CTCF
Nme3
79059
-248.00
CTCF
Nme3
79059
-236.00
CTCF
Nme3
79059
-235.00
CTR9
Nme3
79059
-588.00
E2F1
Nme3
79059
-455.00
E2F4
Nme3
79059
-689.00
EGR2
Nme3
79059
-229.00
EP300
Nme3
79059
-489.00
EP300
Nme3
79059
-471.00
EP300
Nme3
79059
-466.00
EP300
Nme3
79059
-465.00
EP300
Nme3
79059
-458.00
EP300
Nme3
79059
-457.00
EP300
Nme3
79059
-454.00
EP300
Nme3
79059
-438.00
EP300
Nme3
79059
-415.00
EP300
Nme3
79059
-413.00
EP300
Nme3
79059
-406.00
EP300
Nme3
79059
-396.00
EP300
Nme3
79059
-388.00
EP300
Nme3
79059
-332.00
EP300
Nme3
79059
-303.00
EP300
Nme3
79059
-253.00
EP300
Nme3
79059
-22.00
ESR1
Nme3
79059
-641.00
ESR1
Nme3
79059
-216.00
ESR1
Nme3
79059
-76.00
ESR1
Nme3
79059
49.00
FOSL2
Nme3
79059
-557.00
FOSL2
Nme3
79059
-509.00
FOSL2
Nme3
79059
-452.00
FOSL2
Nme3
79059
-396.00
FOXA2
Nme3
79059
-212.00
FOXA2
Nme3
79059
-32.00
HCFC1
Nme3
79059
-510.00
HXB4
Nme3
79059
-671.00
HXB4
Nme3
79059
-425.00
HXB4
Nme3
79059
-380.00
IKZF1
Nme3
79059
-564.00
IKZF1
Nme3
79059
-285.00
IKZF1
Nme3
79059
-253.00
IKZF1
Nme3
79059
-226.00
IRF4
Nme3
79059
-459.00
IRF4
Nme3
79059
-458.00
IRF4
Nme3
79059
-454.00
IRF4
Nme3
79059
-446.00
IRF4
Nme3
79059
-343.00
IRF4
Nme3
79059
-324.00
IRF4
Nme3
79059
-209.00
IRF4
Nme3
79059
-159.00
IRF4
Nme3
79059
38.00
IRF4
Nme3
79059
169.00
JUND
Nme3
79059
-479.00
KAT8
Nme3
79059
91.00
KAT8
Nme3
79059
101.00
KDM1A
Nme3
79059
-10.00
KDM2A
Nme3
79059
-482.00
KDM2A
Nme3
79059
-267.00
KDM2A
Nme3
79059
87.00
KDM2A
Nme3
79059
124.00
KDM2B
Nme3
79059
-783.00
KDM2B
Nme3
79059
-325.00
KDM2B
Nme3
79059
-144.00
KDM2B
Nme3
79059
79.00
KLF1
Nme3
79059
-74.00
KMT2C
Nme3
79059
-482.00
KMT2D
Nme3
79059
-147.00
KMT2D
Nme3
79059
-133.00
KMT2D
Nme3
79059
-130.00
MAF
Nme3
79059
-407.00
MAF
Nme3
79059
-357.00
MAF
Nme3
79059
41.00
MBD1
Nme3
79059
-640.00
MED1
Nme3
79059
-349.00
MED1
Nme3
79059
-172.00
MED1
Nme3
79059
-107.00
MED1
Nme3
79059
-21.00
MEIS1
Nme3
79059
-441.00
MEIS1
Nme3
79059
-419.00
MYC
Nme3
79059
-759.00
MYOD1
Nme3
79059
-715.00
MYOD1
Nme3
79059
-615.00
MYOD1
Nme3
79059
-353.00
MYOD1
Nme3
79059
-230.00
MYOG
Nme3
79059
-236.00
MYOG
Nme3
79059
115.00
NANOG
Nme3
79059
-110.00
NBN
Nme3
79059
-265.00
NDF2
Nme3
79059
-741.00
NELFB
Nme3
79059
-650.00
NELFB
Nme3
79059
-398.00
NELFB
Nme3
79059
-194.00
NFIB
Nme3
79059
-525.00
NIPBL
Nme3
79059
-578.00
NIPBL
Nme3
79059
-266.00
NIPBL
Nme3
79059
109.00
NPAS4
Nme3
79059
125.00
NPAS4
Nme3
79059
138.00
NUCKS
Nme3
79059
-614.00
P53
Nme3
79059
-65.00
P53
Nme3
79059
2.00
P53
Nme3
79059
41.00
P53
Nme3
79059
44.00
PAX6
Nme3
79059
-756.00
PIT1
Nme3
79059
-121.00
PO5F1
Nme3
79059
-229.00
PO5F1
Nme3
79059
-137.00
PO5F1
Nme3
79059
-133.00
PO5F1
Nme3
79059
-92.00
PPARG
Nme3
79059
-605.00
PPARG
Nme3
79059
-243.00
PPARG
Nme3
79059
-203.00
PPARG
Nme3
79059
-155.00
PPARG
Nme3
79059
84.00
PPARG
Nme3
79059
140.00
RARA
Nme3
79059
-390.00
RARA
Nme3
79059
-351.00
RARA
Nme3
79059
-197.00
RARA
Nme3
79059
-162.00
RFX1
Nme3
79059
14.00
RORG
Nme3
79059
152.00
RPB1
Nme3
79059
-999.00
RUNX1
Nme3
79059
-715.00
RUNX1
Nme3
79059
-581.00
RUNX1
Nme3
79059
-324.00
RUNX1
Nme3
79059
-283.00
RXRA
Nme3
79059
-401.00
RXRA
Nme3
79059
-328.00
RXRA
Nme3
79059
-244.00
RXRA
Nme3
79059
-188.00
RPB1
Nme3
79059
-999
RPB1
Nme3
79059
-870
RPB1
Nme3
79059
-649
RPB1
Nme3
79059
-641
RPB1
Nme3
79059
-593
RPB1
Nme3
79059
-588
RPB1
Nme3
79059
-470
RPB1
Nme3
79059
-444
RPB1
Nme3
79059
-420
RPB1
Nme3
79059
-387
RPB1
Nme3
79059
-331
RPB1
Nme3
79059
-168
RPB1
Nme3
79059
-144
RPB1
Nme3
79059
51
RPB1
Nme3
79059
82
RUNX1
Nme3
79059
-715
RUNX1
Nme3
79059
-581
RUNX1
Nme3
79059
-324
RUNX1
Nme3
79059
-283
RUNX2
Nme3
79059
-389
RUNX2
Nme3
79059
-373
RXRA
Nme3
79059
-401
RXRA
Nme3
79059
-328
RXRA
Nme3
79059
-244
RXRA
Nme3
79059
-188
SIN3A
Nme3
79059
-699
SIN3A
Nme3
79059
-227
SIN3B
Nme3
79059
-839
SIR6
Nme3
79059
60
SMAD3
Nme3
79059
-88
SMC3
Nme3
79059
-281
SMC3
Nme3
79059
-273
SMC5
Nme3
79059
-460
SMCA4
Nme3
79059
-582
SMCA4
Nme3
79059
-481
SMCA4
Nme3
79059
-345
SMCA4
Nme3
79059
27
SOX17
Nme3
79059
-343
SOX2
Nme3
79059
109
SPI1
Nme3
79059
-400
SPI1
Nme3
79059
-394
SPI1
Nme3
79059
-375
SPI1
Nme3
79059
-373
SPI1
Nme3
79059
-336
SPI1
Nme3
79059
-330
SPI1
Nme3
79059
-296
SPI1
Nme3
79059
-262
SPI1
Nme3
79059
-221
SPI1
Nme3
79059
-187
SPI1
Nme3
79059
-172
SPI1
Nme3
79059
-114
SPI1
Nme3
79059
-113
SPI1
Nme3
79059
-111
SPI1
Nme3
79059
-109
SPI1
Nme3
79059
-107
SPI1
Nme3
79059
-106
SPI1
Nme3
79059
-96
SPI1
Nme3
79059
-81
SPI1
Nme3
79059
-79
SPI1
Nme3
79059
-65
SPI1
Nme3
79059
-59
SPI1
Nme3
79059
-51
SPI1
Nme3
79059
-35
SPI1
Nme3
79059
-31
SPI1
Nme3
79059
-15
SPI1
Nme3
79059
-14
SPI1
Nme3
79059
-8
SPI1
Nme3
79059
-4
SPI1
Nme3
79059
11
SPI1
Nme3
79059
17
SPI1
Nme3
79059
114
SPI1
Nme3
79059
115
SPI1
Nme3
79059
127
SPI1
Nme3
79059
145
SPI1
Nme3
79059
150
SPIB
Nme3
79059
-392
SPT5H
Nme3
79059
-900
SPT5H
Nme3
79059
-756
SPT5H
Nme3
79059
-580
SPT5H
Nme3
79059
-489
SPT5H
Nme3
79059
-220
STAT1
Nme3
79059
-409
STAT3
Nme3
79059
-356
SUZ12
Nme3
79059
-283
SUZ12
Nme3
79059
-139
SUZ12
Nme3
79059
120
SUZ12
Nme3
79059
162
SUZ12
Nme3
79059
171
T2EB
Nme3
79059
-194
TAF3
Nme3
79059
-347
TAF3
Nme3
79059
-284
TAF3
Nme3
79059
-203
TAF3
Nme3
79059
2
TAF3
Nme3
79059
23
TBP
Nme3
79059
-393
TBP
Nme3
79059
-196
TBX3
Nme3
79059
-421
TBX5
Nme3
79059
-210
TCF7
Nme3
79059
-179
TCF7
Nme3
79059
-176
TDG
Nme3
79059
-631
TET1
Nme3
79059
116
TET1
Nme3
79059
133
TF2B
Nme3
79059
-625
TF65
Nme3
79059
-432
TF65
Nme3
79059
-419
TF65
Nme3
79059
-408
TF65
Nme3
79059
-405
TF65
Nme3
79059
-69
TF65
Nme3
79059
-64
TF65
Nme3
79059
-17
TFAP4
Nme3
79059
-343
TFE2
Nme3
79059
-265
TGIF1
Nme3
79059
-933
TGIF1
Nme3
79059
-385
THB
Nme3
79059
-535
THB
Nme3
79059
-227
THB
Nme3
79059
-152
TIF1B
Nme3
79059
-282
TOP2A
Nme3
79059
168
TYY1
Nme3
79059
-446
USF2
Nme3
79059
-245
UTF1
Nme3
79059
-691
UTF1
Nme3
79059
-426
UTF1
Nme3
79059
-177
UTF1
Nme3
79059
78
ZC11A
Nme3
79059
-324
ZKSC1
Nme3
79059
-287
ZMIZ1
Nme3
79059
-187
SIN3A
Nme3
79059
-227.00
SIN3B
Nme3
79059
-839.00
SMAD3
Nme3
79059
-88.00
SMC5
Nme3
79059
-460.00
SMCA4
Nme3
79059
-582.00
SMCA4
Nme3
79059
-481.00
SOX17
Nme3
79059
-343.00
SOX2
Nme3
79059
109.00
SPI1
Nme3
79059
-394.00
SPI1
Nme3
79059
-375.00
SPI1
Nme3
79059
-373.00
SPI1
Nme3
79059
-336.00
SPI1
Nme3
79059
-330.00
SPI1
Nme3
79059
-296.00
SPI1
Nme3
79059
-262.00
SPI1
Nme3
79059
-221.00
SPI1
Nme3
79059
-187.00
SPI1
Nme3
79059
-172.00
SPI1
Nme3
79059
-114.00
SPI1
Nme3
79059
-111.00
SPI1
Nme3
79059
-109.00
SPI1
Nme3
79059
-81.00
SPI1
Nme3
79059
-59.00
SPI1
Nme3
79059
-51.00
SPI1
Nme3
79059
-35.00
SPI1
Nme3
79059
-31.00
SPI1
Nme3
79059
-15.00
SPI1
Nme3
79059
-8.00
SPI1
Nme3
79059
114.00
SPI1
Nme3
79059
145.00
SPI1
Nme3
79059
150.00
SPT5H
Nme3
79059
-900.00
SPT5H
Nme3
79059
-756.00
SPT5H
Nme3
79059
-580.00
SPT5H
Nme3
79059
-489.00
SPT5H
Nme3
79059
-220.00
STAT1
Nme3
79059
-409.00
STAT3
Nme3
79059
-356.00
TAF3
Nme3
79059
-203.00
TAF3
Nme3
79059
2.00
TBP
Nme3
79059
-196.00
TBX3
Nme3
79059
-421.00
TBX5
Nme3
79059
-210.00
TCF7
Nme3
79059
-179.00
TCF7
Nme3
79059
-176.00
TET1
Nme3
79059
116.00
TET1
Nme3
79059
133.00
TF65
Nme3
79059
-405.00
TF65
Nme3
79059
-69.00
TF65
Nme3
79059
-64.00
TF65
Nme3
79059
-17.00
THB
Nme3
79059
-227.00
TOP2A
Nme3
79059
168.00
TYY1
Nme3
79059
-446.00
UTF1
Nme3
79059
-426.00
UTF1
Nme3
79059
78.00
Additional Information about the Gene
Expression1
Allen Brain Atlas
BGEM
EMAGE
GeneNote
genepaint
GNF Symatlas
GENSAT
Expression2
AceView
HGNC Expression
UCSC
GEO
ArrayExpress
Cleanex
Function
AMIGO
MIPS
Panther
Uniport
Genecards
InterPro
IHOP
Gene Regulation
MicroRNA target
TRED
Pathways
Biocarta Pathways CGAP SAGE
KEGG Pathways
EBI
Sequences
NCBI
Ensembl
MGI Information
QTL
Harvester
Howdy
Interactions
MIMI
EBI
Nature-NCI
string
IHOP
Tools Links
Sequence Manipulation
Genes and Transcripts
Micoroarray Analysis
Literature Search
Protein
Databases
Functional Analysis
Transcription Factor Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
Target Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9