Transcription Factors and their targets
Search Term:
TF
TargetGene
TargetGeneID
Home
Gene List
TF list
Protocol
Contact
TF
Target
Gene ID
Distance From TSS
AHR
Metap1
75624
44.00
AICDA
Metap1
75624
-243.00
AICDA
Metap1
75624
179.00
AP2A
Metap1
75624
-241.00
AP2A
Metap1
75624
-230.00
AP2A
Metap1
75624
79.00
AP2C
Metap1
75624
66.00
ASH2L
Metap1
75624
-246.00
ASH2L
Metap1
75624
179.00
ATOH1
Metap1
75624
157.00
BATF
Metap1
75624
-264.00
BATF
Metap1
75624
-234.00
BATF
Metap1
75624
-227.00
BATF
Metap1
75624
-221.00
BATF
Metap1
75624
67.00
BATF
Metap1
75624
137.00
BATF
Metap1
75624
138.00
BATF
Metap1
75624
195.00
CBX3
Metap1
75624
-241.00
CCND1
Metap1
75624
70.00
CDK8
Metap1
75624
30.00
CDK9
Metap1
75624
-231.00
CEBPA
Metap1
75624
-513.00
CEBPA
Metap1
75624
-177.00
CEBPB
Metap1
75624
-345.00
CEBPB
Metap1
75624
-279.00
CEBPB
Metap1
75624
-229.00
CHD4
Metap1
75624
-185.00
CHD4
Metap1
75624
-137.00
CHD4
Metap1
75624
-88.00
CHD4
Metap1
75624
44.00
CHD4
Metap1
75624
71.00
COE1
Metap1
75624
94.00
CTCF
Metap1
75624
-253.00
CTCF
Metap1
75624
-242.00
CTCF
Metap1
75624
74.00
CTCF
Metap1
75624
89.00
CTCF
Metap1
75624
175.00
CXXC1
Metap1
75624
-258.00
DMC1
Metap1
75624
-228.00
DPY30
Metap1
75624
-190.00
E2F1
Metap1
75624
-197.00
E2F1
Metap1
75624
134.00
E2F4
Metap1
75624
-188.00
E2F4
Metap1
75624
25.00
E2F4
Metap1
75624
70.00
EHMT2
Metap1
75624
-284.00
EOMES
Metap1
75624
-336.00
EP300
Metap1
75624
-894.00
EP300
Metap1
75624
-303.00
EP300
Metap1
75624
-254.00
EP300
Metap1
75624
-247.00
EP300
Metap1
75624
-235.00
EP300
Metap1
75624
-234.00
EP300
Metap1
75624
-222.00
EP300
Metap1
75624
-214.00
EP300
Metap1
75624
-205.00
EP300
Metap1
75624
-201.00
EP300
Metap1
75624
58.00
EP300
Metap1
75624
81.00
EP300
Metap1
75624
83.00
EP300
Metap1
75624
87.00
EP300
Metap1
75624
96.00
EP300
Metap1
75624
98.00
EP300
Metap1
75624
99.00
EP300
Metap1
75624
113.00
EP300
Metap1
75624
114.00
EP300
Metap1
75624
126.00
EP300
Metap1
75624
131.00
EP300
Metap1
75624
138.00
EP300
Metap1
75624
157.00
EP300
Metap1
75624
166.00
EP300
Metap1
75624
175.00
EP300
Metap1
75624
188.00
EP300
Metap1
75624
199.00
ESR1
Metap1
75624
-316.00
ESR1
Metap1
75624
-178.00
ESR1
Metap1
75624
88.00
ETS1
Metap1
75624
106.00
ETV6
Metap1
75624
-271.00
ETV6
Metap1
75624
158.00
FLI1
Metap1
75624
176.00
FOSL2
Metap1
75624
-271.00
FOSL2
Metap1
75624
-224.00
FOXA2
Metap1
75624
-215.00
FOXA2
Metap1
75624
-177.00
FOXO1
Metap1
75624
-123.00
FOXO1
Metap1
75624
91.00
HXB4
Metap1
75624
-133.00
IKZF1
Metap1
75624
-354.00
IKZF1
Metap1
75624
-241.00
IKZF1
Metap1
75624
-238.00
IKZF1
Metap1
75624
45.00
IKZF1
Metap1
75624
59.00
IKZF1
Metap1
75624
88.00
IKZF1
Metap1
75624
117.00
IRF1
Metap1
75624
-472.00
IRF3
Metap1
75624
-264.00
IRF3
Metap1
75624
-248.00
IRF3
Metap1
75624
106.00
IRF3
Metap1
75624
143.00
IRF4
Metap1
75624
-273.00
IRF4
Metap1
75624
-271.00
IRF4
Metap1
75624
-262.00
IRF4
Metap1
75624
-238.00
IRF4
Metap1
75624
50.00
IRF4
Metap1
75624
61.00
IRF4
Metap1
75624
90.00
IRF4
Metap1
75624
131.00
IRF4
Metap1
75624
135.00
IRF4
Metap1
75624
137.00
IRF4
Metap1
75624
138.00
IRF4
Metap1
75624
151.00
IRF4
Metap1
75624
155.00
IRF4
Metap1
75624
163.00
IRF4
Metap1
75624
165.00
IRF4
Metap1
75624
174.00
ISL1
Metap1
75624
-750.00
JUN
Metap1
75624
188.00
JUND
Metap1
75624
-196.00
KAT8
Metap1
75624
139.00
KAT8
Metap1
75624
189.00
KDM1A
Metap1
75624
-249.00
KDM1A
Metap1
75624
72.00
KDM2A
Metap1
75624
147.00
KDM2B
Metap1
75624
-346.00
KDM2B
Metap1
75624
-187.00
KDM2B
Metap1
75624
-165.00
KDM4C
Metap1
75624
111.00
KDM6B
Metap1
75624
-218.00
KDM6B
Metap1
75624
98.00
KLF1
Metap1
75624
-140.00
KLF3
Metap1
75624
-61.00
KLF4
Metap1
75624
-494.00
KLF4
Metap1
75624
-349.00
KLF4
Metap1
75624
-218.00
KMT2C
Metap1
75624
-636.00
KMT2C
Metap1
75624
-311.00
KMT2C
Metap1
75624
-180.00
KMT2D
Metap1
75624
-189.00
KMT2D
Metap1
75624
-185.00
KMT2D
Metap1
75624
53.00
KMT2D
Metap1
75624
54.00
KMT2D
Metap1
75624
67.00
KMT2D
Metap1
75624
82.00
LDB1
Metap1
75624
-375.00
MAF
Metap1
75624
-243.00
MAF
Metap1
75624
101.00
MAF
Metap1
75624
136.00
MED1
Metap1
75624
-240.00
MED1
Metap1
75624
-182.00
MED1
Metap1
75624
178.00
MEIS1
Metap1
75624
-141.00
MK08
Metap1
75624
78.00
MK10
Metap1
75624
78.00
MYC
Metap1
75624
-494.00
MYC
Metap1
75624
-349.00
MYC
Metap1
75624
-228.00
MYC
Metap1
75624
98.00
MYC
Metap1
75624
193.00
MYCN
Metap1
75624
-260.00
MYOD1
Metap1
75624
120.00
MYOG
Metap1
75624
-139.00
MYOG
Metap1
75624
190.00
NANOG
Metap1
75624
-494.00
NANOG
Metap1
75624
-185.00
NANOG
Metap1
75624
35.00
NCOA2
Metap1
75624
58.00
NCOR2
Metap1
75624
-365.00
NELFB
Metap1
75624
-219.00
NKX61
Metap1
75624
27.00
NUCKS
Metap1
75624
105.00
OGT1
Metap1
75624
-276.00
P53
Metap1
75624
102.00
PAX5
Metap1
75624
-200.00
PAX5
Metap1
75624
188.00
PAX6
Metap1
75624
-541.00
PAX6
Metap1
75624
-397.00
PAXI1
Metap1
75624
-304.00
PAXI1
Metap1
75624
114.00
PAXI1
Metap1
75624
174.00
PIT1
Metap1
75624
-746.00
PIT1
Metap1
75624
-446.00
PO5F1
Metap1
75624
-494.00
PO5F1
Metap1
75624
-46.00
PO5F1
Metap1
75624
72.00
PO5F1
Metap1
75624
76.00
PO5F1
Metap1
75624
84.00
PO5F1
Metap1
75624
132.00
PO5F1
Metap1
75624
159.00
PO5F1
Metap1
75624
160.00
PO5F1
Metap1
75624
170.00
PO5F1
Metap1
75624
175.00
PPARG
Metap1
75624
-255.00
PPARG
Metap1
75624
84.00
PPARG
Metap1
75624
108.00
PPARG
Metap1
75624
184.00
PRGR
Metap1
75624
-206.00
PRGR
Metap1
75624
30.00
PRGR
Metap1
75624
51.00
RARA
Metap1
75624
-208.00
RARA
Metap1
75624
-195.00
RARA
Metap1
75624
153.00
RARB
Metap1
75624
129.00
RBBP5
Metap1
75624
149.00
RING2
Metap1
75624
-255.00
RING2
Metap1
75624
-240.00
RING2
Metap1
75624
-71.00
RORG
Metap1
75624
-312.00
RORG
Metap1
75624
106.00
RPB1
Metap1
75624
-195.00
RUNX1
Metap1
75624
-243.00
RUNX1
Metap1
75624
-212.00
RXRA
Metap1
75624
55.00
RXRA
Metap1
75624
103.00
RXRA
Metap1
75624
114.00
RYBP
Metap1
75624
-98.00
RPB1
Metap1
75624
-290
RPB1
Metap1
75624
-240
RPB1
Metap1
75624
-195
RPB1
Metap1
75624
154
RPB1
Metap1
75624
165
RPB1
Metap1
75624
197
RUNX1
Metap1
75624
-243
RUNX1
Metap1
75624
-212
RUNX1
Metap1
75624
-133
RUNX1
Metap1
75624
-100
RUNX1
Metap1
75624
96
RUNX2
Metap1
75624
-266
RUNX2
Metap1
75624
-259
RUNX3
Metap1
75624
-155
RUNX3
Metap1
75624
18
RUNX3
Metap1
75624
173
RXRA
Metap1
75624
55
RXRA
Metap1
75624
103
RXRA
Metap1
75624
114
RYBP
Metap1
75624
-98
SIN3A
Metap1
75624
142
SIR1
Metap1
75624
85
SIR1
Metap1
75624
134
SMAD3
Metap1
75624
94
SMBT1
Metap1
75624
89
SMC1A
Metap1
75624
-238
SMC3
Metap1
75624
130
SMC5
Metap1
75624
165
SMCA4
Metap1
75624
-275
SMCA4
Metap1
75624
-221
SMCA4
Metap1
75624
161
SMCA4
Metap1
75624
167
SOX17
Metap1
75624
-246
SOX2
Metap1
75624
-494
SOX2
Metap1
75624
-322
SOX2
Metap1
75624
-314
SOX2
Metap1
75624
-211
SOX2
Metap1
75624
-196
SOX2
Metap1
75624
-184
SOX2
Metap1
75624
136
SPI1
Metap1
75624
-863
SPI1
Metap1
75624
-416
SPI1
Metap1
75624
-411
SPI1
Metap1
75624
-402
SPI1
Metap1
75624
-394
SPI1
Metap1
75624
-381
SPI1
Metap1
75624
-380
SPI1
Metap1
75624
-377
SPI1
Metap1
75624
-373
SPI1
Metap1
75624
-371
SPI1
Metap1
75624
-367
SPI1
Metap1
75624
-365
SPI1
Metap1
75624
-363
SPI1
Metap1
75624
-359
SPI1
Metap1
75624
-357
SPI1
Metap1
75624
-356
SPI1
Metap1
75624
-351
SPI1
Metap1
75624
-350
SPI1
Metap1
75624
-348
SPI1
Metap1
75624
-347
SPI1
Metap1
75624
-336
SPI1
Metap1
75624
-333
SPI1
Metap1
75624
-332
SPI1
Metap1
75624
-331
SPI1
Metap1
75624
-325
SPI1
Metap1
75624
-324
SPI1
Metap1
75624
-318
SPI1
Metap1
75624
-311
SPI1
Metap1
75624
-302
SPI1
Metap1
75624
-299
SPI1
Metap1
75624
-283
SPI1
Metap1
75624
-278
SPI1
Metap1
75624
-269
SPI1
Metap1
75624
-260
SPI1
Metap1
75624
-259
SPI1
Metap1
75624
-253
SPI1
Metap1
75624
-232
SPI1
Metap1
75624
-224
SPI1
Metap1
75624
-220
SPI1
Metap1
75624
-217
SPI1
Metap1
75624
-198
SPI1
Metap1
75624
-187
SPI1
Metap1
75624
65
SPI1
Metap1
75624
66
SPI1
Metap1
75624
87
SPI1
Metap1
75624
88
SPI1
Metap1
75624
89
SPI1
Metap1
75624
90
SPI1
Metap1
75624
93
SPI1
Metap1
75624
94
SPI1
Metap1
75624
98
SPI1
Metap1
75624
99
SPI1
Metap1
75624
103
SPI1
Metap1
75624
105
SPI1
Metap1
75624
106
SPI1
Metap1
75624
107
SPI1
Metap1
75624
109
SPI1
Metap1
75624
112
SPI1
Metap1
75624
116
SPI1
Metap1
75624
118
SPI1
Metap1
75624
119
SPI1
Metap1
75624
120
SPI1
Metap1
75624
122
SPI1
Metap1
75624
125
SPI1
Metap1
75624
128
SPI1
Metap1
75624
130
SPI1
Metap1
75624
134
SPI1
Metap1
75624
135
SPI1
Metap1
75624
136
SPI1
Metap1
75624
140
SPI1
Metap1
75624
142
SPI1
Metap1
75624
143
SPI1
Metap1
75624
145
SPI1
Metap1
75624
146
SPI1
Metap1
75624
148
SPI1
Metap1
75624
149
SPI1
Metap1
75624
154
SPI1
Metap1
75624
159
SPI1
Metap1
75624
160
SPI1
Metap1
75624
162
SPI1
Metap1
75624
178
SPT5H
Metap1
75624
-239
SPT5H
Metap1
75624
-196
SPT5H
Metap1
75624
-162
SPT5H
Metap1
75624
160
SRF
Metap1
75624
111
SRF
Metap1
75624
151
STA5A
Metap1
75624
157
STA5B
Metap1
75624
-317
STA5B
Metap1
75624
-191
STA5B
Metap1
75624
130
STAT1
Metap1
75624
-290
STAT3
Metap1
75624
-384
STAT3
Metap1
75624
-235
STAT3
Metap1
75624
102
STAT3
Metap1
75624
168
STAT3
Metap1
75624
197
STAT6
Metap1
75624
-230
STAT6
Metap1
75624
-173
STAT6
Metap1
75624
-162
SUZ12
Metap1
75624
-227
SUZ12
Metap1
75624
-168
SUZ12
Metap1
75624
-74
SUZ12
Metap1
75624
61
SUZ12
Metap1
75624
99
SUZ12
Metap1
75624
122
SUZ12
Metap1
75624
127
T2EB
Metap1
75624
182
TAF3
Metap1
75624
-198
TAF7L
Metap1
75624
-196
TAF7L
Metap1
75624
76
TBP
Metap1
75624
-206
TBP
Metap1
75624
62
TBP
Metap1
75624
153
TBX3
Metap1
75624
-225
TBX3
Metap1
75624
-189
TCF7
Metap1
75624
-200
TCF7
Metap1
75624
87
TCF7
Metap1
75624
147
TET1
Metap1
75624
-258
TET1
Metap1
75624
-238
TET1
Metap1
75624
-206
TET1
Metap1
75624
-202
TET1
Metap1
75624
159
TET1
Metap1
75624
173
TF2B
Metap1
75624
-259
TF2B
Metap1
75624
108
TF2B
Metap1
75624
154
TF2B
Metap1
75624
160
TF65
Metap1
75624
-285
TF65
Metap1
75624
-243
TF65
Metap1
75624
-215
TF65
Metap1
75624
-213
TF65
Metap1
75624
-210
TF65
Metap1
75624
-201
TF65
Metap1
75624
-196
TF65
Metap1
75624
-165
TF65
Metap1
75624
-164
TF65
Metap1
75624
-45
TF65
Metap1
75624
68
TFE2
Metap1
75624
-64
TFE2
Metap1
75624
115
TGIF1
Metap1
75624
-230
TGIF1
Metap1
75624
-190
TGIF1
Metap1
75624
-13
USF1
Metap1
75624
-259
USF1
Metap1
75624
-225
USF1
Metap1
75624
-207
USF2
Metap1
75624
-180
USF2
Metap1
75624
-162
UTF1
Metap1
75624
-160
UTF1
Metap1
75624
174
WDR5
Metap1
75624
-139
WDR5
Metap1
75624
-43
WT1
Metap1
75624
92
WT1
Metap1
75624
147
WT1
Metap1
75624
167
ZBT17
Metap1
75624
39
ZBT17
Metap1
75624
55
ZFP384
Metap1
75624
-252
SIN3A
Metap1
75624
142.00
SIR1
Metap1
75624
85.00
SIR1
Metap1
75624
134.00
SMAD3
Metap1
75624
94.00
SMBT1
Metap1
75624
89.00
SMC1A
Metap1
75624
-238.00
SMC5
Metap1
75624
165.00
SMCA4
Metap1
75624
-221.00
SOX17
Metap1
75624
-246.00
SOX2
Metap1
75624
-494.00
SOX2
Metap1
75624
-322.00
SOX2
Metap1
75624
-211.00
SOX2
Metap1
75624
-184.00
SPI1
Metap1
75624
-863.00
SPI1
Metap1
75624
-416.00
SPI1
Metap1
75624
-411.00
SPI1
Metap1
75624
-402.00
SPI1
Metap1
75624
-394.00
SPI1
Metap1
75624
-381.00
SPI1
Metap1
75624
-377.00
SPI1
Metap1
75624
-373.00
SPI1
Metap1
75624
-367.00
SPI1
Metap1
75624
-365.00
SPI1
Metap1
75624
-359.00
SPI1
Metap1
75624
-351.00
SPI1
Metap1
75624
-350.00
SPI1
Metap1
75624
-347.00
SPI1
Metap1
75624
-336.00
SPI1
Metap1
75624
-332.00
SPI1
Metap1
75624
-331.00
SPI1
Metap1
75624
-318.00
SPI1
Metap1
75624
-311.00
SPI1
Metap1
75624
-299.00
SPI1
Metap1
75624
-283.00
SPI1
Metap1
75624
-260.00
SPI1
Metap1
75624
-259.00
SPI1
Metap1
75624
-232.00
SPI1
Metap1
75624
-220.00
SPI1
Metap1
75624
-217.00
SPI1
Metap1
75624
65.00
SPI1
Metap1
75624
66.00
SPI1
Metap1
75624
87.00
SPI1
Metap1
75624
88.00
SPI1
Metap1
75624
90.00
SPI1
Metap1
75624
93.00
SPI1
Metap1
75624
98.00
SPI1
Metap1
75624
103.00
SPI1
Metap1
75624
106.00
SPI1
Metap1
75624
107.00
SPI1
Metap1
75624
109.00
SPI1
Metap1
75624
112.00
SPI1
Metap1
75624
116.00
SPI1
Metap1
75624
118.00
SPI1
Metap1
75624
122.00
SPI1
Metap1
75624
128.00
SPI1
Metap1
75624
130.00
SPI1
Metap1
75624
134.00
SPI1
Metap1
75624
135.00
SPI1
Metap1
75624
136.00
SPI1
Metap1
75624
140.00
SPI1
Metap1
75624
145.00
SPI1
Metap1
75624
146.00
SPI1
Metap1
75624
154.00
SPI1
Metap1
75624
160.00
SPI1
Metap1
75624
162.00
SPI1
Metap1
75624
178.00
SPT5H
Metap1
75624
-239.00
SPT5H
Metap1
75624
-196.00
SPT5H
Metap1
75624
-162.00
SPT5H
Metap1
75624
160.00
SRF
Metap1
75624
111.00
SRF
Metap1
75624
151.00
STA5A
Metap1
75624
157.00
STA5B
Metap1
75624
-317.00
STA5B
Metap1
75624
-191.00
STA5B
Metap1
75624
130.00
STAT1
Metap1
75624
-290.00
STAT3
Metap1
75624
-384.00
STAT3
Metap1
75624
-235.00
STAT3
Metap1
75624
102.00
STAT3
Metap1
75624
168.00
STAT3
Metap1
75624
197.00
STAT6
Metap1
75624
-230.00
STAT6
Metap1
75624
-173.00
STAT6
Metap1
75624
-162.00
TAF3
Metap1
75624
-198.00
TAF7L
Metap1
75624
-196.00
TAF7L
Metap1
75624
76.00
TBP
Metap1
75624
-206.00
TBP
Metap1
75624
62.00
TBX3
Metap1
75624
-225.00
TCF7
Metap1
75624
-200.00
TCF7
Metap1
75624
87.00
TCF7
Metap1
75624
147.00
TET1
Metap1
75624
-258.00
TET1
Metap1
75624
-238.00
TET1
Metap1
75624
-206.00
TET1
Metap1
75624
-202.00
TET1
Metap1
75624
159.00
TET1
Metap1
75624
173.00
TF65
Metap1
75624
-285.00
TF65
Metap1
75624
-243.00
TF65
Metap1
75624
-213.00
TF65
Metap1
75624
-210.00
TF65
Metap1
75624
-201.00
TF65
Metap1
75624
-45.00
TFE2
Metap1
75624
-64.00
USF1
Metap1
75624
-259.00
WDR5
Metap1
75624
-43.00
Additional Information about the Gene
Expression1
Allen Brain Atlas
BGEM
EMAGE
GeneNote
genepaint
GNF Symatlas
GENSAT
Expression2
AceView
HGNC Expression
UCSC
GEO
ArrayExpress
Cleanex
Function
AMIGO
MIPS
Panther
Uniport
Genecards
InterPro
IHOP
Gene Regulation
MicroRNA target
TRED
Pathways
Biocarta Pathways CGAP SAGE
KEGG Pathways
EBI
Sequences
NCBI
Ensembl
MGI Information
QTL
Harvester
Howdy
Interactions
MIMI
EBI
Nature-NCI
string
IHOP
Tools Links
Sequence Manipulation
Genes and Transcripts
Micoroarray Analysis
Literature Search
Protein
Databases
Functional Analysis
Transcription Factor Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
Target Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9