Transcription Factors and their targets
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Gene ID
Distance From TSS
BMI1
Gli3
14634
-117.00
CDK8
Gli3
14634
-732.00
CEBPA
Gli3
14634
-125.00
CEBPB
Gli3
14634
-895.00
CEBPB
Gli3
14634
-869.00
CEBPB
Gli3
14634
-641.00
CEBPB
Gli3
14634
-133.00
CEBPB
Gli3
14634
-80.00
CEBPB
Gli3
14634
-76.00
CEBPB
Gli3
14634
-49.00
CEBPB
Gli3
14634
90.00
CHD4
Gli3
14634
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COE1
Gli3
14634
-421.00
DMC1
Gli3
14634
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DMRT1
Gli3
14634
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Gli3
14634
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Gli3
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Gli3
14634
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E2F3
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E2F4
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E2F4
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EP300
Gli3
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EP300
Gli3
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EP300
Gli3
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EP300
Gli3
14634
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EP300
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EP400
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Gli3
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Gli3
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Gli3
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Gli3
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EZH2
Gli3
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EZH2
Gli3
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Gli3
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FOSL2
Gli3
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FOXA2
Gli3
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FOXA2
Gli3
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FOXA2
Gli3
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GLI1
Gli3
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GLI1
Gli3
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GLI1
Gli3
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GLI1
Gli3
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GLI1
Gli3
14634
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GLI1
Gli3
14634
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HELLS
Gli3
14634
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JARD2
Gli3
14634
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JUN
Gli3
14634
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JUND
Gli3
14634
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JUND
Gli3
14634
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KDM1A
Gli3
14634
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KDM2A
Gli3
14634
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KDM2A
Gli3
14634
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KDM2A
Gli3
14634
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KDM2B
Gli3
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KDM2B
Gli3
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KDM2B
Gli3
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KDM2B
Gli3
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KDM2B
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KDM2B
Gli3
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KDM2B
Gli3
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KDM2B
Gli3
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KDM4C
Gli3
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KDM4C
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KDM6A
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KDM6A
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KDM6B
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KDM6B
Gli3
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KDM6B
Gli3
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Gli3
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KMT2B
Gli3
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KMT2C
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KMT2C
Gli3
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Gli3
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KMT2D
Gli3
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KMT2D
Gli3
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KMT2D
Gli3
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Gli3
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KMT2D
Gli3
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Gli3
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Gli3
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Gli3
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KMT2D
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KMT2D
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KMT2D
Gli3
14634
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Gli3
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MBD1
Gli3
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-2.00
MED1
Gli3
14634
-638.00
MEIS1
Gli3
14634
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MYBA
Gli3
14634
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MYOD1
Gli3
14634
-548.00
MYOD1
Gli3
14634
105.00
MYOG
Gli3
14634
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MYOG
Gli3
14634
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NANOG
Gli3
14634
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NANOG
Gli3
14634
-307.00
NBN
Gli3
14634
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NELFB
Gli3
14634
-308.00
NFIB
Gli3
14634
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NFIB
Gli3
14634
-3.00
P53
Gli3
14634
-549.00
P53
Gli3
14634
-252.00
PO5F1
Gli3
14634
-993.00
PO5F1
Gli3
14634
-702.00
PO5F1
Gli3
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PO5F1
Gli3
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PO5F1
Gli3
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-658.00
PO5F1
Gli3
14634
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PO5F1
Gli3
14634
-642.00
PO5F1
Gli3
14634
-617.00
PO5F1
Gli3
14634
96.00
PO5F1
Gli3
14634
178.00
PPARG
Gli3
14634
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PPARG
Gli3
14634
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PPARG
Gli3
14634
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PPARG
Gli3
14634
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PPARG
Gli3
14634
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PPARG
Gli3
14634
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PPARG
Gli3
14634
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PPARG
Gli3
14634
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PPARG
Gli3
14634
132.00
PRGR
Gli3
14634
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PRGR
Gli3
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RARA
Gli3
14634
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RARA
Gli3
14634
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RBBP5
Gli3
14634
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RBBP5
Gli3
14634
-152.00
RFX1
Gli3
14634
-509.00
RFX1
Gli3
14634
-113.00
RFX1
Gli3
14634
129.00
RING2
Gli3
14634
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RING2
Gli3
14634
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RING2
Gli3
14634
-960.00
RING2
Gli3
14634
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RING2
Gli3
14634
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Gli3
14634
-661.00
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Gli3
14634
-779.00
RUNX2
Gli3
14634
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RUNX2
Gli3
14634
-725
RUNX2
Gli3
14634
-699
RXRA
Gli3
14634
-661
RYBP
Gli3
14634
-779
SALL4
Gli3
14634
-779
SALL4
Gli3
14634
-549
SIN3A
Gli3
14634
-700
SIN3A
Gli3
14634
-252
SIN3A
Gli3
14634
-114
SIN3A
Gli3
14634
68
SIR6
Gli3
14634
-146
SIX1
Gli3
14634
-463
SIX1
Gli3
14634
-251
SIX1
Gli3
14634
154
SIX2
Gli3
14634
62
SMAD3
Gli3
14634
-797
SMAD3
Gli3
14634
42
SMC1A
Gli3
14634
-997
SMC1A
Gli3
14634
-965
SMC1A
Gli3
14634
-681
SMC3
Gli3
14634
-288
SMC3
Gli3
14634
-190
SMC3
Gli3
14634
-165
SMCA4
Gli3
14634
-952
SMCA4
Gli3
14634
-805
SMCA4
Gli3
14634
-798
SMCA4
Gli3
14634
-779
SMCA4
Gli3
14634
-193
SMCA4
Gli3
14634
-155
SMCA4
Gli3
14634
11
SOX2
Gli3
14634
-645
SOX3
Gli3
14634
-86
SPI1
Gli3
14634
-619
SPT5H
Gli3
14634
-704
SPT5H
Gli3
14634
-243
SRF
Gli3
14634
-374
STA5A
Gli3
14634
-855
STA5A
Gli3
14634
-171
SUH
Gli3
14634
-536
SUH
Gli3
14634
-476
SUH
Gli3
14634
-146
SUZ12
Gli3
14634
-989
SUZ12
Gli3
14634
-981
SUZ12
Gli3
14634
-978
SUZ12
Gli3
14634
-941
SUZ12
Gli3
14634
-930
SUZ12
Gli3
14634
-767
SUZ12
Gli3
14634
-762
SUZ12
Gli3
14634
-740
SUZ12
Gli3
14634
-727
SUZ12
Gli3
14634
-717
SUZ12
Gli3
14634
-582
SUZ12
Gli3
14634
-516
SUZ12
Gli3
14634
-477
SUZ12
Gli3
14634
-469
SUZ12
Gli3
14634
-442
SUZ12
Gli3
14634
-351
SUZ12
Gli3
14634
-218
SUZ12
Gli3
14634
-183
SUZ12
Gli3
14634
-139
SUZ12
Gli3
14634
-132
SUZ12
Gli3
14634
-107
SUZ12
Gli3
14634
-95
SUZ12
Gli3
14634
-41
SUZ12
Gli3
14634
27
SUZ12
Gli3
14634
90
SUZ12
Gli3
14634
103
SUZ12
Gli3
14634
105
SUZ12
Gli3
14634
200
TAF3
Gli3
14634
-944
TAF3
Gli3
14634
-702
TAF3
Gli3
14634
95
TAF7L
Gli3
14634
99
TBP
Gli3
14634
-917
TBP
Gli3
14634
-662
TBP
Gli3
14634
-162
TBP
Gli3
14634
-127
TET1
Gli3
14634
-976
TET1
Gli3
14634
-917
TET1
Gli3
14634
-669
TET1
Gli3
14634
-662
TET1
Gli3
14634
-528
TET1
Gli3
14634
-186
TET1
Gli3
14634
-127
TET1
Gli3
14634
-99
TF2B
Gli3
14634
-523
TF2B
Gli3
14634
-149
TF65
Gli3
14634
-963
TF65
Gli3
14634
-563
TF65
Gli3
14634
-463
TFE2
Gli3
14634
-653
TOP2A
Gli3
14634
-778
UTF1
Gli3
14634
-859
UTF1
Gli3
14634
-347
UTF1
Gli3
14634
-339
UTF1
Gli3
14634
-107
UTF1
Gli3
14634
200
WDR5
Gli3
14634
-634
WT1
Gli3
14634
-960
WT1
Gli3
14634
-779
ZBT17
Gli3
14634
-847
ZFX
Gli3
14634
-809
ZFX
Gli3
14634
-425
ZFX
Gli3
14634
-30
SALL4
Gli3
14634
-779.00
SALL4
Gli3
14634
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SIN3A
Gli3
14634
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SIN3A
Gli3
14634
-252.00
SIN3A
Gli3
14634
-114.00
SIX1
Gli3
14634
-463.00
SIX1
Gli3
14634
-251.00
SIX1
Gli3
14634
154.00
SIX2
Gli3
14634
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SMAD3
Gli3
14634
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SMAD3
Gli3
14634
42.00
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Gli3
14634
-997.00
SMC1A
Gli3
14634
-965.00
SMC1A
Gli3
14634
-681.00
SMC3
Gli3
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SMC3
Gli3
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Gli3
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Gli3
14634
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Gli3
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Gli3
14634
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SPI1
Gli3
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Gli3
14634
-704.00
SPT5H
Gli3
14634
-243.00
SRF
Gli3
14634
-374.00
STA5A
Gli3
14634
-855.00
STA5A
Gli3
14634
-171.00
SUH
Gli3
14634
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SUH
Gli3
14634
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SUH
Gli3
14634
-146.00
SUZ12
Gli3
14634
-981.00
SUZ12
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SUZ12
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SUZ12
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-41.00
SUZ12
Gli3
14634
90.00
SUZ12
Gli3
14634
200.00
TAF3
Gli3
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TAF3
Gli3
14634
-702.00
TAF3
Gli3
14634
95.00
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Gli3
14634
99.00
TBP
Gli3
14634
-917.00
TBP
Gli3
14634
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TBP
Gli3
14634
-162.00
TBP
Gli3
14634
-127.00
TET1
Gli3
14634
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Gli3
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Gli3
14634
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TET1
Gli3
14634
-127.00
TET1
Gli3
14634
-99.00
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Gli3
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TF65
Gli3
14634
-563.00
TF65
Gli3
14634
-463.00
TFE2
Gli3
14634
-653.00
TOP2A
Gli3
14634
-778.00
UTF1
Gli3
14634
-107.00
WDR5
Gli3
14634
-634.00
WT1
Gli3
14634
-960.00
WT1
Gli3
14634
-779.00
ZFX
Gli3
14634
-809.00
ZFX
Gli3
14634
-425.00
ZFX
Gli3
14634
-30.00
Additional Information about the Gene
Expression1
Allen Brain Atlas
BGEM
EMAGE
GeneNote
genepaint
GNF Symatlas
GENSAT
Expression2
AceView
HGNC Expression
UCSC
GEO
ArrayExpress
Cleanex
Function
AMIGO
MIPS
Panther
Uniport
Genecards
InterPro
IHOP
Gene Regulation
MicroRNA target
TRED
Pathways
Biocarta Pathways CGAP SAGE
KEGG Pathways
EBI
Sequences
NCBI
Ensembl
MGI Information
QTL
Harvester
Howdy
Interactions
MIMI
EBI
Nature-NCI
string
IHOP
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Genes and Transcripts
Micoroarray Analysis
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Protein
Databases
Functional Analysis
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A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
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