Transcription Factors and their targets
Search Term:
TF
TargetGene
TargetGeneID
Home
Gene List
TF list
Protocol
Contact
TF
Target
Gene ID
Distance From TSS
AICDA
Atl2
56298
-139.00
ATF4
Atl2
56298
36.00
BACH2
Atl2
56298
138.00
BATF
Atl2
56298
25.00
BATF
Atl2
56298
51.00
BATF
Atl2
56298
68.00
BATF
Atl2
56298
129.00
BATF
Atl2
56298
130.00
BATF
Atl2
56298
136.00
BATF
Atl2
56298
150.00
BATF
Atl2
56298
185.00
BRCA1
Atl2
56298
-337.00
CBP
Atl2
56298
133.00
CBX8
Atl2
56298
38.00
CDK8
Atl2
56298
109.00
CDK9
Atl2
56298
-109.00
CDK9
Atl2
56298
-20.00
CDK9
Atl2
56298
69.00
CEBPA
Atl2
56298
-143.00
CEBPA
Atl2
56298
122.00
CEBPA
Atl2
56298
123.00
CEBPB
Atl2
56298
-178.00
CEBPB
Atl2
56298
-127.00
CEBPB
Atl2
56298
-40.00
CEBPB
Atl2
56298
94.00
CHD4
Atl2
56298
95.00
CHD4
Atl2
56298
116.00
CREB1
Atl2
56298
130.00
CREB1
Atl2
56298
139.00
CREB1
Atl2
56298
151.00
CTCF
Atl2
56298
19.00
E2F4
Atl2
56298
83.00
ELL3
Atl2
56298
160.00
EP300
Atl2
56298
-38.00
EP300
Atl2
56298
77.00
EP300
Atl2
56298
96.00
EP300
Atl2
56298
132.00
EP300
Atl2
56298
133.00
EP300
Atl2
56298
140.00
EP300
Atl2
56298
141.00
EP300
Atl2
56298
153.00
EP300
Atl2
56298
156.00
EP300
Atl2
56298
182.00
EP300
Atl2
56298
183.00
EP300
Atl2
56298
190.00
EP300
Atl2
56298
195.00
EP300
Atl2
56298
199.00
EP400
Atl2
56298
-179.00
ETS1
Atl2
56298
64.00
ETV6
Atl2
56298
195.00
FOSL2
Atl2
56298
99.00
FOXO1
Atl2
56298
128.00
FOXO1
Atl2
56298
138.00
FOXP3
Atl2
56298
103.00
GATA1
Atl2
56298
97.00
GATA4
Atl2
56298
180.00
GATA4
Atl2
56298
191.00
HDAC3
Atl2
56298
154.00
HIF1A
Atl2
56298
100.00
HXB4
Atl2
56298
120.00
HXB4
Atl2
56298
143.00
IKZF1
Atl2
56298
-80.00
IKZF1
Atl2
56298
115.00
IKZF1
Atl2
56298
123.00
IKZF1
Atl2
56298
167.00
IRF3
Atl2
56298
-172.00
IRF4
Atl2
56298
128.00
IRF4
Atl2
56298
140.00
IRF4
Atl2
56298
143.00
IRF4
Atl2
56298
148.00
IRF4
Atl2
56298
151.00
IRF4
Atl2
56298
163.00
IRF4
Atl2
56298
165.00
IRF4
Atl2
56298
182.00
IRF4
Atl2
56298
184.00
IRF4
Atl2
56298
185.00
JUN
Atl2
56298
170.00
JUN
Atl2
56298
191.00
JUNB
Atl2
56298
170.00
JUND
Atl2
56298
11.00
KAT8
Atl2
56298
-146.00
KDM1A
Atl2
56298
178.00
KDM2A
Atl2
56298
-26.00
KDM2B
Atl2
56298
-159.00
KDM5A
Atl2
56298
110.00
KLF3
Atl2
56298
197.00
KLF4
Atl2
56298
-543.00
KLF4
Atl2
56298
-433.00
KLF4
Atl2
56298
-229.00
KLF4
Atl2
56298
102.00
KMT2C
Atl2
56298
-121.00
KMT2D
Atl2
56298
122.00
KMT2D
Atl2
56298
148.00
KMT2D
Atl2
56298
149.00
KMT2D
Atl2
56298
168.00
MAX
Atl2
56298
138.00
MBD1
Atl2
56298
-180.00
MEIS1
Atl2
56298
170.00
MK08
Atl2
56298
107.00
MK10
Atl2
56298
107.00
MYC
Atl2
56298
-543.00
MYOD1
Atl2
56298
186.00
NANOG
Atl2
56298
-433.00
NCOR1
Atl2
56298
103.00
NFIB
Atl2
56298
-111.00
NFIB
Atl2
56298
105.00
OGT1
Atl2
56298
-127.00
OGT1
Atl2
56298
15.00
P53
Atl2
56298
77.00
P53
Atl2
56298
90.00
PAXI1
Atl2
56298
-76.00
PIT1
Atl2
56298
-279.00
PO5F1
Atl2
56298
-191.00
PO5F1
Atl2
56298
-127.00
PO5F1
Atl2
56298
55.00
PO5F1
Atl2
56298
98.00
PO5F1
Atl2
56298
109.00
PO5F1
Atl2
56298
116.00
PO5F1
Atl2
56298
124.00
PO5F1
Atl2
56298
136.00
PO5F1
Atl2
56298
139.00
PO5F1
Atl2
56298
171.00
PO5F1
Atl2
56298
173.00
PPARG
Atl2
56298
88.00
PPARG
Atl2
56298
195.00
PRD14
Atl2
56298
76.00
PRGR
Atl2
56298
197.00
PRGR
Atl2
56298
198.00
RARA
Atl2
56298
-46.00
RBBP5
Atl2
56298
199.00
RING1
Atl2
56298
33.00
RING2
Atl2
56298
-264.00
RING2
Atl2
56298
-263.00
RING2
Atl2
56298
-179.00
RING2
Atl2
56298
-98.00
RORG
Atl2
56298
129.00
RUNX1
Atl2
56298
65
RUNX1
Atl2
56298
193
RUNX3
Atl2
56298
103
RUNX3
Atl2
56298
148
RXRA
Atl2
56298
136
RXRA
Atl2
56298
143
SIN3A
Atl2
56298
-88
SIR1
Atl2
56298
182
SIX1
Atl2
56298
-521
SIX1
Atl2
56298
-151
SMC1A
Atl2
56298
-46
SMC1A
Atl2
56298
134
SMC1A
Atl2
56298
141
SMCA4
Atl2
56298
3
SMCA4
Atl2
56298
14
SMCA4
Atl2
56298
29
SMCA4
Atl2
56298
49
SOX2
Atl2
56298
-543
SOX2
Atl2
56298
-34
SOX3
Atl2
56298
124
SPI1
Atl2
56298
-100
SPI1
Atl2
56298
-37
SPI1
Atl2
56298
-8
SPI1
Atl2
56298
11
SPI1
Atl2
56298
29
SPI1
Atl2
56298
35
SPI1
Atl2
56298
76
SPI1
Atl2
56298
83
SPI1
Atl2
56298
93
SPI1
Atl2
56298
126
SPI1
Atl2
56298
129
SPI1
Atl2
56298
157
SPI1
Atl2
56298
163
SPI1
Atl2
56298
167
SPI1
Atl2
56298
171
SPI1
Atl2
56298
196
STA5A
Atl2
56298
50
STA5A
Atl2
56298
79
STA5A
Atl2
56298
152
STA5B
Atl2
56298
-43
STA5B
Atl2
56298
-12
STAT1
Atl2
56298
81
STAT1
Atl2
56298
162
STAT3
Atl2
56298
133
STAT3
Atl2
56298
171
STAT3
Atl2
56298
174
STAT6
Atl2
56298
56
STAT6
Atl2
56298
122
STAT6
Atl2
56298
195
SUZ12
Atl2
56298
-72
SUZ12
Atl2
56298
-39
SUZ12
Atl2
56298
191
T2EB
Atl2
56298
199
TAF1
Atl2
56298
127
TAF9B
Atl2
56298
78
TBP
Atl2
56298
190
TBP
Atl2
56298
197
TBX21
Atl2
56298
66
TBX3
Atl2
56298
94
TBX3
Atl2
56298
131
TCF7
Atl2
56298
117
TET1
Atl2
56298
-106
TET1
Atl2
56298
-71
TET1
Atl2
56298
37
TET1
Atl2
56298
127
TET1
Atl2
56298
143
TF65
Atl2
56298
14
TF65
Atl2
56298
38
TF65
Atl2
56298
47
TF65
Atl2
56298
79
TF65
Atl2
56298
82
TF65
Atl2
56298
89
TF65
Atl2
56298
91
TF65
Atl2
56298
105
TF65
Atl2
56298
138
TF65
Atl2
56298
145
TF65
Atl2
56298
171
TFE2
Atl2
56298
71
THB
Atl2
56298
164
TIF1B
Atl2
56298
197
UBP16
Atl2
56298
70
USF2
Atl2
56298
34
WT1
Atl2
56298
119
ZBT17
Atl2
56298
51
ZBT17
Atl2
56298
195
ZIC2
Atl2
56298
99
ZIC2
Atl2
56298
100
SIN3A
Atl2
56298
-88.00
SIR1
Atl2
56298
182.00
SIX1
Atl2
56298
-521.00
SIX1
Atl2
56298
-151.00
SMC1A
Atl2
56298
-46.00
SMC1A
Atl2
56298
134.00
SMC1A
Atl2
56298
141.00
SMCA4
Atl2
56298
3.00
SMCA4
Atl2
56298
49.00
SOX2
Atl2
56298
-543.00
SPI1
Atl2
56298
-100.00
SPI1
Atl2
56298
-37.00
SPI1
Atl2
56298
29.00
SPI1
Atl2
56298
35.00
SPI1
Atl2
56298
83.00
SPI1
Atl2
56298
126.00
SPI1
Atl2
56298
129.00
SPI1
Atl2
56298
157.00
SPI1
Atl2
56298
167.00
SPI1
Atl2
56298
171.00
SPI1
Atl2
56298
196.00
STA5A
Atl2
56298
50.00
STA5A
Atl2
56298
79.00
STA5A
Atl2
56298
152.00
STA5B
Atl2
56298
-43.00
STA5B
Atl2
56298
-12.00
STAT1
Atl2
56298
81.00
STAT1
Atl2
56298
162.00
STAT3
Atl2
56298
133.00
STAT3
Atl2
56298
171.00
STAT3
Atl2
56298
174.00
STAT6
Atl2
56298
56.00
STAT6
Atl2
56298
122.00
STAT6
Atl2
56298
195.00
SUZ12
Atl2
56298
-39.00
TAF1
Atl2
56298
127.00
TBP
Atl2
56298
197.00
TBX3
Atl2
56298
94.00
TCF7
Atl2
56298
117.00
TET1
Atl2
56298
-106.00
TET1
Atl2
56298
-71.00
TET1
Atl2
56298
37.00
TET1
Atl2
56298
127.00
TET1
Atl2
56298
143.00
TF65
Atl2
56298
14.00
TF65
Atl2
56298
38.00
TF65
Atl2
56298
47.00
TF65
Atl2
56298
79.00
TF65
Atl2
56298
89.00
TF65
Atl2
56298
91.00
TF65
Atl2
56298
145.00
Additional Information about the Gene
Expression1
Allen Brain Atlas
BGEM
EMAGE
GeneNote
genepaint
GNF Symatlas
GENSAT
Expression2
AceView
HGNC Expression
UCSC
GEO
ArrayExpress
Cleanex
Function
AMIGO
MIPS
Panther
Uniport
Genecards
InterPro
IHOP
Gene Regulation
MicroRNA target
TRED
Pathways
Biocarta Pathways CGAP SAGE
KEGG Pathways
EBI
Sequences
NCBI
Ensembl
MGI Information
QTL
Harvester
Howdy
Interactions
MIMI
EBI
Nature-NCI
string
IHOP
Tools Links
Sequence Manipulation
Genes and Transcripts
Micoroarray Analysis
Literature Search
Protein
Databases
Functional Analysis
Transcription Factor Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
Target Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9