Transcription Factors and their targets
Search Term:
TF
TargetGene
TargetGeneID
Home
Gene List
TF list
Protocol
Contact
TF
Target
Gene ID
Distance From TSS
AICDA
Crkl
12929
-652.00
AICDA
Crkl
12929
-335.00
AICDA
Crkl
12929
75.00
AP2A
Crkl
12929
96.00
AP2A
Crkl
12929
134.00
AP2A
Crkl
12929
178.00
ASCL1
Crkl
12929
-467.00
ASCL1
Crkl
12929
-198.00
ASCL2
Crkl
12929
-481.00
ASH2L
Crkl
12929
-415.00
ASH2L
Crkl
12929
-140.00
ATF4
Crkl
12929
-220.00
ATOH1
Crkl
12929
-264.00
BAP1
Crkl
12929
-735.00
BATF
Crkl
12929
-639.00
BATF
Crkl
12929
-633.00
BATF
Crkl
12929
-535.00
BATF
Crkl
12929
-513.00
BATF
Crkl
12929
-318.00
BATF
Crkl
12929
-302.00
BATF
Crkl
12929
-269.00
BATF
Crkl
12929
-207.00
BATF
Crkl
12929
-153.00
BATF
Crkl
12929
-39.00
BATF
Crkl
12929
-32.00
BATF
Crkl
12929
-17.00
BATF
Crkl
12929
36.00
BCL6
Crkl
12929
-615.00
BCL6
Crkl
12929
-547.00
BMAL1
Crkl
12929
-570.00
BMAL1
Crkl
12929
-514.00
BRCA1
Crkl
12929
-681.00
BRD4
Crkl
12929
-217.00
CBP
Crkl
12929
-240.00
CBX3
Crkl
12929
-460.00
CCND1
Crkl
12929
-241.00
CDK8
Crkl
12929
-224.00
CDK9
Crkl
12929
-479.00
CDK9
Crkl
12929
-204.00
CEBPA
Crkl
12929
-865.00
CEBPA
Crkl
12929
-704.00
CEBPA
Crkl
12929
-697.00
CEBPA
Crkl
12929
-516.00
CEBPA
Crkl
12929
-484.00
CEBPB
Crkl
12929
-725.00
CEBPB
Crkl
12929
-703.00
CEBPB
Crkl
12929
-701.00
CEBPB
Crkl
12929
-694.00
CEBPB
Crkl
12929
-680.00
CEBPB
Crkl
12929
-648.00
CEBPB
Crkl
12929
-424.00
CEBPB
Crkl
12929
-394.00
CEBPB
Crkl
12929
-25.00
CEBPB
Crkl
12929
69.00
CHD4
Crkl
12929
-659.00
CHD4
Crkl
12929
-441.00
CHD4
Crkl
12929
-252.00
CHD4
Crkl
12929
-184.00
CREB1
Crkl
12929
-225.00
CREB1
Crkl
12929
-140.00
CREB1
Crkl
12929
-137.00
CREM
Crkl
12929
-602.00
CRY2
Crkl
12929
-670.00
CXXC1
Crkl
12929
-409.00
DPY30
Crkl
12929
-741.00
E2F1
Crkl
12929
-672.00
E2F1
Crkl
12929
-361.00
E2F3
Crkl
12929
-263.00
E2F4
Crkl
12929
-964.00
E2F4
Crkl
12929
-451.00
E2F4
Crkl
12929
-260.00
E2F4
Crkl
12929
-241.00
EGR2
Crkl
12929
-247.00
ELF1
Crkl
12929
-166.00
ELL3
Crkl
12929
-79.00
EP300
Crkl
12929
-629.00
EP300
Crkl
12929
-346.00
EP300
Crkl
12929
-326.00
EP300
Crkl
12929
-323.00
EP300
Crkl
12929
-309.00
EP300
Crkl
12929
-302.00
EP300
Crkl
12929
-298.00
EP300
Crkl
12929
-296.00
EP300
Crkl
12929
-292.00
EP300
Crkl
12929
-288.00
EP300
Crkl
12929
-275.00
EP300
Crkl
12929
-274.00
EP300
Crkl
12929
-272.00
EP300
Crkl
12929
-271.00
EP300
Crkl
12929
-252.00
EP300
Crkl
12929
-245.00
EP300
Crkl
12929
-210.00
EP300
Crkl
12929
-158.00
EP300
Crkl
12929
-144.00
EP300
Crkl
12929
-127.00
EP300
Crkl
12929
-121.00
EP300
Crkl
12929
-111.00
EP300
Crkl
12929
-101.00
EP300
Crkl
12929
-94.00
EP300
Crkl
12929
-50.00
EP400
Crkl
12929
-695.00
ERR1
Crkl
12929
-644.00
ERR2
Crkl
12929
-570.00
ESR1
Crkl
12929
75.00
ETS1
Crkl
12929
-261.00
ETS1
Crkl
12929
-207.00
ETV6
Crkl
12929
-894.00
ETV6
Crkl
12929
-187.00
EZH2
Crkl
12929
95.00
FLI1
Crkl
12929
-426.00
FOSL2
Crkl
12929
-303.00
FOSL2
Crkl
12929
-254.00
FOXA1
Crkl
12929
-644.00
FOXA2
Crkl
12929
-410.00
FOXA2
Crkl
12929
-399.00
FOXO1
Crkl
12929
-209.00
FOXO1
Crkl
12929
75.00
GATA4
Crkl
12929
-187.00
GCR
Crkl
12929
-374.00
GCR
Crkl
12929
-343.00
HCFC1
Crkl
12929
-699.00
HDAC3
Crkl
12929
-435.00
HXB4
Crkl
12929
-677.00
IKZF1
Crkl
12929
-397.00
IKZF1
Crkl
12929
-386.00
IKZF1
Crkl
12929
-354.00
IKZF1
Crkl
12929
-325.00
IKZF1
Crkl
12929
-321.00
IKZF1
Crkl
12929
-297.00
IKZF1
Crkl
12929
-287.00
IKZF1
Crkl
12929
-183.00
IKZF1
Crkl
12929
-15.00
IKZF1
Crkl
12929
0.00
IKZF1
Crkl
12929
12.00
IRF3
Crkl
12929
-372.00
IRF3
Crkl
12929
-54.00
IRF4
Crkl
12929
-608.00
IRF4
Crkl
12929
-582.00
IRF4
Crkl
12929
-477.00
IRF4
Crkl
12929
-450.00
IRF4
Crkl
12929
-368.00
IRF4
Crkl
12929
-312.00
IRF4
Crkl
12929
-297.00
IRF4
Crkl
12929
-296.00
IRF4
Crkl
12929
-293.00
IRF4
Crkl
12929
-281.00
IRF4
Crkl
12929
-278.00
IRF4
Crkl
12929
-274.00
IRF4
Crkl
12929
-268.00
IRF4
Crkl
12929
-261.00
IRF4
Crkl
12929
-240.00
IRF4
Crkl
12929
-239.00
IRF4
Crkl
12929
-226.00
IRF4
Crkl
12929
-212.00
IRF4
Crkl
12929
-197.00
IRF4
Crkl
12929
-104.00
IRF4
Crkl
12929
-90.00
IRF4
Crkl
12929
-48.00
IRF4
Crkl
12929
-26.00
IRF4
Crkl
12929
-23.00
JUN
Crkl
12929
-297.00
JUNB
Crkl
12929
-283.00
JUNB
Crkl
12929
-254.00
JUND
Crkl
12929
-305.00
JUND
Crkl
12929
-57.00
KAT8
Crkl
12929
-601.00
KAT8
Crkl
12929
-447.00
KAT8
Crkl
12929
-157.00
KAT8
Crkl
12929
-105.00
KDM1A
Crkl
12929
-252.00
KDM2A
Crkl
12929
-282.00
KDM2A
Crkl
12929
-32.00
KDM2B
Crkl
12929
-498.00
KDM2B
Crkl
12929
-426.00
KDM2B
Crkl
12929
-354.00
KDM2B
Crkl
12929
-285.00
KDM2B
Crkl
12929
8.00
KDM4C
Crkl
12929
-834.00
KDM4C
Crkl
12929
-251.00
KDM4C
Crkl
12929
57.00
KDM5A
Crkl
12929
-339.00
KDM6A
Crkl
12929
-481.00
KDM6B
Crkl
12929
-339.00
KDM6B
Crkl
12929
-155.00
KLF1
Crkl
12929
-249.00
KLF1
Crkl
12929
-194.00
KLF1
Crkl
12929
9.00
KLF4
Crkl
12929
-852.00
KLF4
Crkl
12929
-533.00
KMT2B
Crkl
12929
-636.00
KMT2B
Crkl
12929
-223.00
KMT2C
Crkl
12929
-543.00
KMT2C
Crkl
12929
-354.00
KMT2C
Crkl
12929
81.00
KMT2C
Crkl
12929
83.00
KMT2D
Crkl
12929
-347.00
KMT2D
Crkl
12929
-264.00
KMT2D
Crkl
12929
-104.00
KMT2D
Crkl
12929
-90.00
MAF
Crkl
12929
-277.00
MAF
Crkl
12929
-275.00
MAF
Crkl
12929
-8.00
MAX
Crkl
12929
-964.00
MED1
Crkl
12929
-422.00
MED1
Crkl
12929
-297.00
MED1
Crkl
12929
-282.00
MED1
Crkl
12929
-191.00
MEIS1
Crkl
12929
-146.00
MYBA
Crkl
12929
-346.00
MYC
Crkl
12929
-964.00
MYC
Crkl
12929
-687.00
MYC
Crkl
12929
-533.00
MYOD1
Crkl
12929
-780.00
MYOD1
Crkl
12929
-761.00
MYOD1
Crkl
12929
-652.00
MYOD1
Crkl
12929
-278.00
MYOD1
Crkl
12929
-256.00
MYOD1
Crkl
12929
54.00
MYOG
Crkl
12929
-601.00
MYOG
Crkl
12929
-322.00
NANOG
Crkl
12929
-381.00
NCOA2
Crkl
12929
-655.00
NCOA2
Crkl
12929
-479.00
NCOA2
Crkl
12929
-54.00
NCOR1
Crkl
12929
-252.00
NDF2
Crkl
12929
-766.00
NELFB
Crkl
12929
-400.00
NFIB
Crkl
12929
-445.00
NFIB
Crkl
12929
-413.00
NFIB
Crkl
12929
165.00
NIPBL
Crkl
12929
-333.00
NKX21
Crkl
12929
-763.00
NOTC1
Crkl
12929
85.00
NR0B1
Crkl
12929
-964.00
NR1D1
Crkl
12929
-504.00
NR1D2
Crkl
12929
-273.00
NR1H2
Crkl
12929
-664.00
NR1H3
Crkl
12929
-664.00
OLIG2
Crkl
12929
-260.00
OLIG2
Crkl
12929
-248.00
P53
Crkl
12929
-633.00
PAX5
Crkl
12929
-425.00
PAX6
Crkl
12929
-709.00
PAX6
Crkl
12929
195.00
PAXI1
Crkl
12929
-104.00
PEBB
Crkl
12929
-520.00
PER2
Crkl
12929
-740.00
PIT1
Crkl
12929
-597.00
PIT1
Crkl
12929
-296.00
PITX2
Crkl
12929
-316.00
PITX2
Crkl
12929
58.00
PKNX2
Crkl
12929
-228.00
PO5F1
Crkl
12929
-653.00
PO5F1
Crkl
12929
-629.00
PO5F1
Crkl
12929
-292.00
PO5F1
Crkl
12929
-282.00
PO5F1
Crkl
12929
-146.00
PO5F1
Crkl
12929
-131.00
PO5F1
Crkl
12929
-70.00
PO5F1
Crkl
12929
-56.00
PO5F1
Crkl
12929
-46.00
PO5F1
Crkl
12929
-17.00
PPARG
Crkl
12929
-379.00
PPARG
Crkl
12929
-372.00
PPARG
Crkl
12929
-334.00
PPARG
Crkl
12929
-271.00
PPARG
Crkl
12929
-265.00
PPARG
Crkl
12929
-16.00
PPARG
Crkl
12929
24.00
PRGR
Crkl
12929
-227.00
PTF1A
Crkl
12929
-675.00
PTF1A
Crkl
12929
-404.00
PTF1A
Crkl
12929
-376.00
RARA
Crkl
12929
-440.00
RARA
Crkl
12929
-419.00
RARA
Crkl
12929
-332.00
RARA
Crkl
12929
-292.00
RARB
Crkl
12929
-892.00
RARB
Crkl
12929
-657.00
RBBP5
Crkl
12929
-357.00
RFA2
Crkl
12929
-681.00
RFX1
Crkl
12929
-168.00
RING1
Crkl
12929
-451.00
RING2
Crkl
12929
-319.00
RING2
Crkl
12929
-255.00
RING2
Crkl
12929
-241.00
RING2
Crkl
12929
-49.00
RPB1
Crkl
12929
-801.00
RPB1
Crkl
12929
-724.00
RPB1
Crkl
12929
-616.00
RUNX3
Crkl
12929
-521.00
RXRA
Crkl
12929
-934.00
RXRA
Crkl
12929
-895.00
RXRA
Crkl
12929
-830.00
RXRA
Crkl
12929
-794.00
RXRA
Crkl
12929
-781.00
RXRA
Crkl
12929
-775.00
RXRA
Crkl
12929
-762.00
RXRA
Crkl
12929
-742.00
RXRA
Crkl
12929
-736.00
RXRA
Crkl
12929
-666.00
RXRA
Crkl
12929
-640.00
RXRA
Crkl
12929
-639.00
RXRA
Crkl
12929
-628.00
RXRA
Crkl
12929
-618.00
RXRA
Crkl
12929
-611.00
RXRA
Crkl
12929
-600.00
RYBP
Crkl
12929
-911.00
RYBP
Crkl
12929
-241.00
RUNX1
Crkl
12929
-235
RUNX1
Crkl
12929
-188
RUNX1
Crkl
12929
-102
RUNX2
Crkl
12929
-619
RUNX2
Crkl
12929
-495
RUNX2
Crkl
12929
-481
RUNX2
Crkl
12929
-241
RUNX2
Crkl
12929
-235
RUNX3
Crkl
12929
-704
RUNX3
Crkl
12929
-521
RUNX3
Crkl
12929
-319
RXRA
Crkl
12929
-934
RXRA
Crkl
12929
-895
RXRA
Crkl
12929
-830
RXRA
Crkl
12929
-794
RXRA
Crkl
12929
-781
RXRA
Crkl
12929
-775
RXRA
Crkl
12929
-762
RXRA
Crkl
12929
-742
RXRA
Crkl
12929
-736
RXRA
Crkl
12929
-666
RXRA
Crkl
12929
-640
RXRA
Crkl
12929
-639
RXRA
Crkl
12929
-628
RXRA
Crkl
12929
-618
RXRA
Crkl
12929
-611
RXRA
Crkl
12929
-600
RYBP
Crkl
12929
-911
RYBP
Crkl
12929
-241
SALL4
Crkl
12929
-241
SIN3A
Crkl
12929
-768
SIN3A
Crkl
12929
-767
SIN3A
Crkl
12929
-702
SIN3A
Crkl
12929
-690
SIN3A
Crkl
12929
-493
SIN3A
Crkl
12929
-451
SIN3A
Crkl
12929
-381
SIN3A
Crkl
12929
-49
SIN3B
Crkl
12929
-15
SIN3B
Crkl
12929
95
SIR1
Crkl
12929
-346
SIR6
Crkl
12929
-97
SIR6
Crkl
12929
5
SMAD3
Crkl
12929
-404
SMBT1
Crkl
12929
-326
SMBT1
Crkl
12929
-58
SMC3
Crkl
12929
-479
SMC5
Crkl
12929
-681
SMCA4
Crkl
12929
-376
SMCA4
Crkl
12929
-144
SMCA4
Crkl
12929
7
SMCA4
Crkl
12929
43
SMCA5
Crkl
12929
-165
SOX2
Crkl
12929
-375
SOX2
Crkl
12929
-315
SOX2
Crkl
12929
-144
SOX2
Crkl
12929
-132
SOX2
Crkl
12929
1
SOX4
Crkl
12929
-515
SPI1
Crkl
12929
-615
SPI1
Crkl
12929
-563
SPI1
Crkl
12929
-411
SPI1
Crkl
12929
-353
SPI1
Crkl
12929
-296
SPI1
Crkl
12929
-250
SPI1
Crkl
12929
-218
SPI1
Crkl
12929
-215
SPI1
Crkl
12929
-201
SPI1
Crkl
12929
-190
SPI1
Crkl
12929
-170
SPI1
Crkl
12929
-156
SPI1
Crkl
12929
-155
SPI1
Crkl
12929
-77
SPI1
Crkl
12929
-76
SPIB
Crkl
12929
-417
SPT5H
Crkl
12929
-682
SPT5H
Crkl
12929
-600
SPT5H
Crkl
12929
-542
SPT5H
Crkl
12929
-492
SPT5H
Crkl
12929
-347
SPT5H
Crkl
12929
24
SRF
Crkl
12929
22
STA5A
Crkl
12929
-327
STA5B
Crkl
12929
-614
STAT1
Crkl
12929
-506
STAT2
Crkl
12929
-375
STAT3
Crkl
12929
-321
STAT3
Crkl
12929
-316
STAT3
Crkl
12929
-284
STAT3
Crkl
12929
-269
STAT3
Crkl
12929
0
STAT3
Crkl
12929
12
STAT4
Crkl
12929
-360
SUZ12
Crkl
12929
-363
SUZ12
Crkl
12929
-345
SUZ12
Crkl
12929
-5
T2EB
Crkl
12929
-274
T2EB
Crkl
12929
-192
TAF1
Crkl
12929
25
TAF3
Crkl
12929
-422
TAF3
Crkl
12929
-394
TAF3
Crkl
12929
-386
TAF7L
Crkl
12929
-446
TAF7L
Crkl
12929
-226
TAF7L
Crkl
12929
-143
TBP
Crkl
12929
-626
TBP
Crkl
12929
-564
TBP
Crkl
12929
-420
TBP
Crkl
12929
-351
TBP
Crkl
12929
-317
TBP
Crkl
12929
-309
TBX3
Crkl
12929
-407
TBX5
Crkl
12929
-451
TCF7
Crkl
12929
-350
TCF7
Crkl
12929
-102
TCF7
Crkl
12929
-97
TDG
Crkl
12929
-835
TEAD1
Crkl
12929
-546
TEAD4
Crkl
12929
95
TET1
Crkl
12929
-495
TET1
Crkl
12929
-108
TF2B
Crkl
12929
-406
TF2B
Crkl
12929
-344
TF2B
Crkl
12929
-329
TF2B
Crkl
12929
-328
TF2B
Crkl
12929
-31
TF2B
Crkl
12929
-10
TF65
Crkl
12929
-223
TF65
Crkl
12929
-199
TF65
Crkl
12929
-184
TF65
Crkl
12929
-142
TF65
Crkl
12929
-111
TF65
Crkl
12929
-91
TF65
Crkl
12929
-51
TF65
Crkl
12929
103
TF7L2
Crkl
12929
-707
TFAP4
Crkl
12929
-672
TFE2
Crkl
12929
-241
TFE2
Crkl
12929
-187
TFE2
Crkl
12929
-87
TFE2
Crkl
12929
-7
TGIF1
Crkl
12929
-406
THB
Crkl
12929
-567
THB
Crkl
12929
-552
TIF1B
Crkl
12929
-720
TIF1B
Crkl
12929
-438
TOP2A
Crkl
12929
-755
TYY1
Crkl
12929
-358
TYY1
Crkl
12929
-343
TYY1
Crkl
12929
-109
TYY1
Crkl
12929
39
UBF1
Crkl
12929
-349
USF1
Crkl
12929
-474
UTF1
Crkl
12929
-469
UTF1
Crkl
12929
-353
UTF1
Crkl
12929
-249
WDR5
Crkl
12929
-346
WT1
Crkl
12929
-241
WT1
Crkl
12929
-172
ZBT17
Crkl
12929
-126
ZFP42
Crkl
12929
-672
ZFX
Crkl
12929
-373
ZFX
Crkl
12929
91
ZIC2
Crkl
12929
-284
ZMIZ1
Crkl
12929
-388
SALL4
Crkl
12929
-241.00
SIN3A
Crkl
12929
-493.00
SIN3A
Crkl
12929
-451.00
SIN3A
Crkl
12929
-381.00
SIN3A
Crkl
12929
-49.00
SIN3B
Crkl
12929
-15.00
SIN3B
Crkl
12929
95.00
SIR1
Crkl
12929
-346.00
SIR6
Crkl
12929
-97.00
SMAD3
Crkl
12929
-404.00
SMBT1
Crkl
12929
-326.00
SMBT1
Crkl
12929
-58.00
SMC3
Crkl
12929
-479.00
SMC5
Crkl
12929
-681.00
SMCA4
Crkl
12929
-144.00
SMCA5
Crkl
12929
-165.00
SOX2
Crkl
12929
-315.00
SOX2
Crkl
12929
-144.00
SOX2
Crkl
12929
-132.00
SPI1
Crkl
12929
-411.00
SPI1
Crkl
12929
-250.00
SPI1
Crkl
12929
-218.00
SPI1
Crkl
12929
-215.00
SPI1
Crkl
12929
-156.00
SPI1
Crkl
12929
-77.00
SPI1
Crkl
12929
-76.00
SPT5H
Crkl
12929
-682.00
SPT5H
Crkl
12929
-600.00
SPT5H
Crkl
12929
-542.00
SPT5H
Crkl
12929
-492.00
SPT5H
Crkl
12929
-347.00
SPT5H
Crkl
12929
24.00
SRF
Crkl
12929
22.00
STA5A
Crkl
12929
-327.00
STA5B
Crkl
12929
-614.00
STAT1
Crkl
12929
-506.00
STAT2
Crkl
12929
-375.00
STAT3
Crkl
12929
-321.00
STAT3
Crkl
12929
-316.00
STAT3
Crkl
12929
-284.00
STAT3
Crkl
12929
-269.00
STAT3
Crkl
12929
0.00
STAT3
Crkl
12929
12.00
STAT4
Crkl
12929
-360.00
TAF1
Crkl
12929
25.00
TAF3
Crkl
12929
-422.00
TAF7L
Crkl
12929
-446.00
TAF7L
Crkl
12929
-226.00
TAF7L
Crkl
12929
-143.00
TBP
Crkl
12929
-351.00
TBP
Crkl
12929
-309.00
TBX3
Crkl
12929
-407.00
TBX5
Crkl
12929
-451.00
TCF7
Crkl
12929
-350.00
TCF7
Crkl
12929
-102.00
TCF7
Crkl
12929
-97.00
TEAD4
Crkl
12929
95.00
TET1
Crkl
12929
-495.00
TET1
Crkl
12929
-108.00
TF65
Crkl
12929
-223.00
TF65
Crkl
12929
-142.00
TF65
Crkl
12929
-111.00
TF65
Crkl
12929
-51.00
TF65
Crkl
12929
103.00
TFE2
Crkl
12929
-241.00
TFE2
Crkl
12929
-187.00
TFE2
Crkl
12929
-7.00
TOP2A
Crkl
12929
-755.00
TYY1
Crkl
12929
-358.00
TYY1
Crkl
12929
-343.00
TYY1
Crkl
12929
-109.00
USF1
Crkl
12929
-474.00
UTF1
Crkl
12929
-353.00
WDR5
Crkl
12929
-346.00
WT1
Crkl
12929
-241.00
ZFP42
Crkl
12929
-672.00
ZFX
Crkl
12929
-373.00
ZFX
Crkl
12929
91.00
Additional Information about the Gene
Expression1
Allen Brain Atlas
BGEM
EMAGE
GeneNote
genepaint
GNF Symatlas
GENSAT
Expression2
AceView
HGNC Expression
UCSC
GEO
ArrayExpress
Cleanex
Function
AMIGO
MIPS
Panther
Uniport
Genecards
InterPro
IHOP
Gene Regulation
MicroRNA target
TRED
Pathways
Biocarta Pathways CGAP SAGE
KEGG Pathways
EBI
Sequences
NCBI
Ensembl
MGI Information
QTL
Harvester
Howdy
Interactions
MIMI
EBI
Nature-NCI
string
IHOP
Tools Links
Sequence Manipulation
Genes and Transcripts
Micoroarray Analysis
Literature Search
Protein
Databases
Functional Analysis
Transcription Factor Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
Target Gene Symbol Index:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9